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胃癌预后标志物circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络生物信息学分析
1
作者
黄馨仪
周锦涛
蒋晨杉
《医学分子生物学杂志》
CAS
2024年第4期366-373,共8页
目的构建胃癌(gastric cancer,GC)中与预后相关的circRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,探究诊治靶点。方法从GEO、TCGA数据库中获得GC中差异表达的circRNAs(circular RNA,circRNA)及相关miRNAs(mi...
目的构建胃癌(gastric cancer,GC)中与预后相关的circRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,探究诊治靶点。方法从GEO、TCGA数据库中获得GC中差异表达的circRNAs(circular RNA,circRNA)及相关miRNAs(microRNA,miRNA)、mRNAs,利用Cytoscape构建circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,关注差异表达mRNAs功能,确定枢纽基因,最终通过Kaplan-Meier生存分析确定其预后价值。结果ceRNA网络由差异表达的2个circRNAs、5个miRNAs和349个mRNAs组成。功能富集分析提示差异mRNAs在“肌肉系统发育”、“金属离子跨膜转运蛋白活性”、“突触膜”和“钙信号通路”等方面和通路显著富集。构建了包含125个节点和165条边的PPI网络,并鉴定出10个枢纽基因,生存分析提示低ADAR1D或PTGFR表达可能导致GC患者预后不良。结论成功构建了与GC预后相关的circRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络,确定了hsa_circ_0001190/hsa-miR-7-5p/ADRA1D和hsa_circ_0036287/hsa-miR-3127-5p/PTGFR两个在GC中具有潜在预后价值的轴,为GC的靶向诊治与研究提供新的依据。
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关键词
环状RNA
胃癌
竞争性内源RNA
MRNA
预后
下载PDF
职称材料
超声引导下经皮微波消融与手术切除治疗原发性肝癌的疗效比较
2
作者
乔谦
蒋晨杉
+3 位作者
吴鸣宇
周锋盛
蒋骁
蔡兵
《首都食品与医药》
2022年第2期25-29,共5页
目的对比探讨超声引导下经皮微波消融与手术切除治疗CNLC 1期原发性肝癌的疗效。方法收集2017年1月-2020年12月无锡市人民医院收治的107例行超声引导下经皮微波消融或手术切除治疗CNLCI期肝癌患者的临床资料,其中微波消融(MWA)组56例,...
目的对比探讨超声引导下经皮微波消融与手术切除治疗CNLC 1期原发性肝癌的疗效。方法收集2017年1月-2020年12月无锡市人民医院收治的107例行超声引导下经皮微波消融或手术切除治疗CNLCI期肝癌患者的临床资料,其中微波消融(MWA)组56例,手术切除(SR)组51例。比较两组术后检验学指标、术后并发症、短期疗效及短期生存率,探讨两组病人的生存影响因素。两组间的计数资料用卡方检验比较,计量资料采用Mann-Whi tney比较。采用Kaplan-Meier和Cox回归分析影响患者术后生存的相关因素。结果术后SR组患者LDH(P-0.036),PT(P=0.006)及INR(P=0.007)均高于NWA组,术后疼痛发生率显著高于MWA组(P<0.001)。MWMA组患者半年、1年,2年的生存率分别为98.2%、89.3%、53.6%,SR组患者半年、1年、2年的生存率分别为100%、92.2%、58.8%,两组患者术后生存率比较,差别无统计学意义(P=0.681).于NWA患者而言,肿瘤多发为主要危险因素;于SR患者而言,肿瘤直径及术前LDH为主要危险因素。结论超声引导下经皮微波消融或手术切除治疗CNLC I期肝癌的短期疗效无明显差异,但经皮微波消融所带来的并发症更少。
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关键词
原发性肝癌
微波消融
手术切除
疗效
CNLC-1期肝癌
原文传递
题名
胃癌预后标志物circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络生物信息学分析
1
作者
黄馨仪
周锦涛
蒋晨杉
机构
南京医科大学附属无锡人民医院普外科
南京医科大学附属无锡人民医院手术室
出处
《医学分子生物学杂志》
CAS
2024年第4期366-373,共8页
文摘
目的构建胃癌(gastric cancer,GC)中与预后相关的circRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,探究诊治靶点。方法从GEO、TCGA数据库中获得GC中差异表达的circRNAs(circular RNA,circRNA)及相关miRNAs(microRNA,miRNA)、mRNAs,利用Cytoscape构建circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,关注差异表达mRNAs功能,确定枢纽基因,最终通过Kaplan-Meier生存分析确定其预后价值。结果ceRNA网络由差异表达的2个circRNAs、5个miRNAs和349个mRNAs组成。功能富集分析提示差异mRNAs在“肌肉系统发育”、“金属离子跨膜转运蛋白活性”、“突触膜”和“钙信号通路”等方面和通路显著富集。构建了包含125个节点和165条边的PPI网络,并鉴定出10个枢纽基因,生存分析提示低ADAR1D或PTGFR表达可能导致GC患者预后不良。结论成功构建了与GC预后相关的circRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络,确定了hsa_circ_0001190/hsa-miR-7-5p/ADRA1D和hsa_circ_0036287/hsa-miR-3127-5p/PTGFR两个在GC中具有潜在预后价值的轴,为GC的靶向诊治与研究提供新的依据。
关键词
环状RNA
胃癌
竞争性内源RNA
MRNA
预后
Keywords
circular RNA
gastric cancer
ceRNA
mRNA
prognosis
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
超声引导下经皮微波消融与手术切除治疗原发性肝癌的疗效比较
2
作者
乔谦
蒋晨杉
吴鸣宇
周锋盛
蒋骁
蔡兵
机构
南京医科大学附属无锡人民医院
出处
《首都食品与医药》
2022年第2期25-29,共5页
文摘
目的对比探讨超声引导下经皮微波消融与手术切除治疗CNLC 1期原发性肝癌的疗效。方法收集2017年1月-2020年12月无锡市人民医院收治的107例行超声引导下经皮微波消融或手术切除治疗CNLCI期肝癌患者的临床资料,其中微波消融(MWA)组56例,手术切除(SR)组51例。比较两组术后检验学指标、术后并发症、短期疗效及短期生存率,探讨两组病人的生存影响因素。两组间的计数资料用卡方检验比较,计量资料采用Mann-Whi tney比较。采用Kaplan-Meier和Cox回归分析影响患者术后生存的相关因素。结果术后SR组患者LDH(P-0.036),PT(P=0.006)及INR(P=0.007)均高于NWA组,术后疼痛发生率显著高于MWA组(P<0.001)。MWMA组患者半年、1年,2年的生存率分别为98.2%、89.3%、53.6%,SR组患者半年、1年、2年的生存率分别为100%、92.2%、58.8%,两组患者术后生存率比较,差别无统计学意义(P=0.681).于NWA患者而言,肿瘤多发为主要危险因素;于SR患者而言,肿瘤直径及术前LDH为主要危险因素。结论超声引导下经皮微波消融或手术切除治疗CNLC I期肝癌的短期疗效无明显差异,但经皮微波消融所带来的并发症更少。
关键词
原发性肝癌
微波消融
手术切除
疗效
CNLC-1期肝癌
Keywords
primary hepatocellular carcinoma
microwave ablation
surgical resection
trealment efficacy
CNLC Istage HCC
分类号
R730.5 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胃癌预后标志物circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络生物信息学分析
黄馨仪
周锦涛
蒋晨杉
《医学分子生物学杂志》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
超声引导下经皮微波消融与手术切除治疗原发性肝癌的疗效比较
乔谦
蒋晨杉
吴鸣宇
周锋盛
蒋骁
蔡兵
《首都食品与医药》
2022
0
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