目的探索白藜芦醇抗三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)的潜在作用机制。方法利用PharmMapper、SwissTargetPrediction、SuperPred、DrugBank数据库,筛选整合白藜芦醇可能作用的靶点。与CTD、DisGeNET、MalaCards数据库...目的探索白藜芦醇抗三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)的潜在作用机制。方法利用PharmMapper、SwissTargetPrediction、SuperPred、DrugBank数据库,筛选整合白藜芦醇可能作用的靶点。与CTD、DisGeNET、MalaCards数据库中筛选得到的TNBC靶点相映射后得到白藜芦醇抗TNBC可能作用的靶点。利用DAVID数据库对得到的靶点进行基因功能(Gene ontology,GO)和京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路注释分析,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建靶点间的蛋白互作网络,筛选出核心靶点及核心模块。结果共筛选得到422个白藜芦醇可能作用的靶点,1799个TNBC相关靶点,映射后共得到白藜芦醇治疗TNBC的潜在作用靶点130个,并从中进一步筛选出了10个核心基因(MAPK1、MAPK3、TP53、SRC、PIK3CA、AKT1、PIK3R1、MAPK8、PTPN11。JAK2),KEGG通路富集提示核心基因主要涉及PI3K-Akt等信号通路。结论白藜芦醇可能是通过靶向作用于多个靶点及通路,形成相互协调的作用网络从而发挥抗TNBC作用,其中PI3K/Akt通路可能发挥重要作用,为白藜芦醇在TNBC治疗方面的进一步研究提供参考。展开更多
文摘目的探索白藜芦醇抗三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)的潜在作用机制。方法利用PharmMapper、SwissTargetPrediction、SuperPred、DrugBank数据库,筛选整合白藜芦醇可能作用的靶点。与CTD、DisGeNET、MalaCards数据库中筛选得到的TNBC靶点相映射后得到白藜芦醇抗TNBC可能作用的靶点。利用DAVID数据库对得到的靶点进行基因功能(Gene ontology,GO)和京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路注释分析,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建靶点间的蛋白互作网络,筛选出核心靶点及核心模块。结果共筛选得到422个白藜芦醇可能作用的靶点,1799个TNBC相关靶点,映射后共得到白藜芦醇治疗TNBC的潜在作用靶点130个,并从中进一步筛选出了10个核心基因(MAPK1、MAPK3、TP53、SRC、PIK3CA、AKT1、PIK3R1、MAPK8、PTPN11。JAK2),KEGG通路富集提示核心基因主要涉及PI3K-Akt等信号通路。结论白藜芦醇可能是通过靶向作用于多个靶点及通路,形成相互协调的作用网络从而发挥抗TNBC作用,其中PI3K/Akt通路可能发挥重要作用,为白藜芦醇在TNBC治疗方面的进一步研究提供参考。
