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尼罗罗非鱼微阵列Fosmid基因组文库的构建及基因筛选
被引量:
4
1
作者
李明辉
吴风瑞
+10 位作者
熊传奇
曾圣
杨世杰
叶凯
蒋汶洮
孙运侣
黄宝锋
魏莹莹
焦静
顾源
王德寿
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期27-34,共8页
以pCC2FOS为载体构建尼罗罗非鱼Fosmid基因组文库,共挑选115 200个单菌落,保存在300块384孔样品板中,构建4 800个行池、7 200个列池、300个板池和25个超级池,形成微阵列,并对其进行复制备份。该文库插入片段平均长度约为40 kb,覆盖约罗...
以pCC2FOS为载体构建尼罗罗非鱼Fosmid基因组文库,共挑选115 200个单菌落,保存在300块384孔样品板中,构建4 800个行池、7 200个列池、300个板池和25个超级池,形成微阵列,并对其进行复制备份。该文库插入片段平均长度约为40 kb,覆盖约罗非鱼基因组的3倍。连续传代实验研究表明,文库具有良好的稳定性。由于构建超级池-板池-行、列池三级池系统形成的微阵列,有助于快速、准确、有效地筛选目的基因,仅需77个PCR反应(超级池25+板池12+行池16+列池24)就能筛选到含有目的基因的一个单克隆,解决了普遍存在的文库筛选难题。通过文库尝试筛选18个与性别分化和生长相关基因,均获得2~5个阳性克隆,说明文库具有较好的实用性。
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关键词
尼罗罗非鱼
基因组文库
微阵列
基因筛选
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题名
尼罗罗非鱼微阵列Fosmid基因组文库的构建及基因筛选
被引量:
4
1
作者
李明辉
吴风瑞
熊传奇
曾圣
杨世杰
叶凯
蒋汶洮
孙运侣
黄宝锋
魏莹莹
焦静
顾源
王德寿
机构
西南大学生命科学学院
出处
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期27-34,共8页
基金
农业部“九四八”项目(2010-Z56)
国家“八六三”高科技研究发展计划(2007AA10Z165)
+4 种基金
国家自然科学基金委员会与香港研究资助局联合科研基金(30831160508)
国家自然科学基金(3087195,30770272,31030063)
教育部博士点基金项目(20090182110008)
重庆市科委攻关项目(CSTC,2008AC1016)
重庆市自然科学基金项目(CSTC,2008BB1006)
文摘
以pCC2FOS为载体构建尼罗罗非鱼Fosmid基因组文库,共挑选115 200个单菌落,保存在300块384孔样品板中,构建4 800个行池、7 200个列池、300个板池和25个超级池,形成微阵列,并对其进行复制备份。该文库插入片段平均长度约为40 kb,覆盖约罗非鱼基因组的3倍。连续传代实验研究表明,文库具有良好的稳定性。由于构建超级池-板池-行、列池三级池系统形成的微阵列,有助于快速、准确、有效地筛选目的基因,仅需77个PCR反应(超级池25+板池12+行池16+列池24)就能筛选到含有目的基因的一个单克隆,解决了普遍存在的文库筛选难题。通过文库尝试筛选18个与性别分化和生长相关基因,均获得2~5个阳性克隆,说明文库具有较好的实用性。
关键词
尼罗罗非鱼
基因组文库
微阵列
基因筛选
Keywords
Oreochromis niloticus
genomic library
Fosmid library
microarray
gene screening
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
S917 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
尼罗罗非鱼微阵列Fosmid基因组文库的构建及基因筛选
李明辉
吴风瑞
熊传奇
曾圣
杨世杰
叶凯
蒋汶洮
孙运侣
黄宝锋
魏莹莹
焦静
顾源
王德寿
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
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