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H1N1亚型流感病毒感染A549细胞的环状RNA表达分析
1
作者
蒋盛强
胡靖
陈红英
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期4724-4734,共11页
通过对甲型H1N1流感病毒感染A549细胞前后表达的环状RNA进行鉴定,筛选病毒感染引起的差异表达环状RNA,为进一步研究环状RNA在流感病毒感染过程中的调控作用奠定基础。本研究从病毒感染和PBS处理的A549细胞中提取RNA,构建测序文库后进行...
通过对甲型H1N1流感病毒感染A549细胞前后表达的环状RNA进行鉴定,筛选病毒感染引起的差异表达环状RNA,为进一步研究环状RNA在流感病毒感染过程中的调控作用奠定基础。本研究从病毒感染和PBS处理的A549细胞中提取RNA,构建测序文库后进行全转录组测序。通过生信分析,鉴定了病毒感染前后宿主细胞表达的环状RNA。以未感染组为对照,使用EdgeR包,筛选条件:|log_(2)FC|≥1、P value<0.05,筛选获得感染前后的细胞中差异表达的环状RNA。使用ClusterProfiler包对差异表达环状RNA的来源基因进行GO和KEGG分析。最后通过荧光定量PCR、外切核糖核酸酶处理、Sanger测序等手段验证了病毒感染前后宿主细胞内部分环状RNA的差异表达。结果表明:流感病毒感染细胞后,环状RNA的表达数目增加。感染组和未感染组分别鉴定到1101和676个环状RNA表达,这些环状RNA广泛分布在所有染色体上,其中大部分(约60%)长度在300~1000 nt,约20%的环状RNA长度超过2000 nt。基于基因位置关系的分析发现,75%~82%的环状RNA源自外显子,12%~17%源自正链重叠转录本,少部分(1%~4%)来自内含子、基因间和反义链转录本。经差异表达分析,共筛选出54个表达上调,18个表达下调的环状RNA。这些差异表达的环状RNA主要分布在5号染色体和19号染色体上。基因本体论GO富集分析显示,差异表达环状RNA来源基因主要富集到RNA定位、细胞质膜和单链DNA结合等相关进程。KEGG通路分析显示,差异表达环状RNA主要与氨基酸降解、FoxO信号等通路相关。最后,通过RT-qPCR、RNase R消化、Sanger测序等方法,验证了环状RNA SNUPN(has_circ_0104558)、DCBLD1(hsa_circ_0077717)和EIF4G3(hsa_circ_0000025)在病毒感染前后细胞中的差异表达,证实其是由对应来源序列反向剪接而成并且具有环状RNA抗RNase R降解的特性。本研究通过转录组测序和生信分析手段鉴定了H1N1甲型流感病毒感染A549细胞前后环状RNA的表达谱,分析了环状RNA的长度、染色体分布、来源分类和可能参与的调控通路,筛选出了病毒感染后差异表达的环状RNA,为深入研究环状RNA是否在流感病毒感染期间发挥作用奠定了基础。
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关键词
环状RNA
甲型流感病毒
A549细胞
差异表达
下载PDF
职称材料
数据中心热回收型专用空调系统智能控制及改造成效
被引量:
3
2
作者
许国平
李昶
+3 位作者
张建风
王攀
刘昊儒
蒋盛强
《智能建筑》
2020年第5期27-31,共5页
在通信企业中时,柴油发电机组主要作为备用的交流电源,能在市电停电后迅速提供稳定的交流电源。为保证柴油发电机组的及时响应能力,按照中华人民共和国通信行业标准《YD/T 502-2007通信用柴油发电机组》要求,发电机房温度应保持在5~40℃...
在通信企业中时,柴油发电机组主要作为备用的交流电源,能在市电停电后迅速提供稳定的交流电源。为保证柴油发电机组的及时响应能力,按照中华人民共和国通信行业标准《YD/T 502-2007通信用柴油发电机组》要求,发电机房温度应保持在5~40℃,因为当机组水箱里的冷却水和发动机缸体里的机油温度较低时,会导致发电机组的启动成功率下降。柴油发电机组常用的加热方式是安装高功率水套加热器,以循环水的方式保证柴油发电机组的温度。
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关键词
柴油发电机组
交流电源
通信行业标准
专用空调
智能控制
发电机房
数据中心
机油温度
原文传递
题名
H1N1亚型流感病毒感染A549细胞的环状RNA表达分析
1
作者
蒋盛强
胡靖
陈红英
机构
西北农林科技大学生命科学学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期4724-4734,共11页
基金
西北农林科技大学教育发展基金会捐赠项目(S5030222010)。
文摘
通过对甲型H1N1流感病毒感染A549细胞前后表达的环状RNA进行鉴定,筛选病毒感染引起的差异表达环状RNA,为进一步研究环状RNA在流感病毒感染过程中的调控作用奠定基础。本研究从病毒感染和PBS处理的A549细胞中提取RNA,构建测序文库后进行全转录组测序。通过生信分析,鉴定了病毒感染前后宿主细胞表达的环状RNA。以未感染组为对照,使用EdgeR包,筛选条件:|log_(2)FC|≥1、P value<0.05,筛选获得感染前后的细胞中差异表达的环状RNA。使用ClusterProfiler包对差异表达环状RNA的来源基因进行GO和KEGG分析。最后通过荧光定量PCR、外切核糖核酸酶处理、Sanger测序等手段验证了病毒感染前后宿主细胞内部分环状RNA的差异表达。结果表明:流感病毒感染细胞后,环状RNA的表达数目增加。感染组和未感染组分别鉴定到1101和676个环状RNA表达,这些环状RNA广泛分布在所有染色体上,其中大部分(约60%)长度在300~1000 nt,约20%的环状RNA长度超过2000 nt。基于基因位置关系的分析发现,75%~82%的环状RNA源自外显子,12%~17%源自正链重叠转录本,少部分(1%~4%)来自内含子、基因间和反义链转录本。经差异表达分析,共筛选出54个表达上调,18个表达下调的环状RNA。这些差异表达的环状RNA主要分布在5号染色体和19号染色体上。基因本体论GO富集分析显示,差异表达环状RNA来源基因主要富集到RNA定位、细胞质膜和单链DNA结合等相关进程。KEGG通路分析显示,差异表达环状RNA主要与氨基酸降解、FoxO信号等通路相关。最后,通过RT-qPCR、RNase R消化、Sanger测序等方法,验证了环状RNA SNUPN(has_circ_0104558)、DCBLD1(hsa_circ_0077717)和EIF4G3(hsa_circ_0000025)在病毒感染前后细胞中的差异表达,证实其是由对应来源序列反向剪接而成并且具有环状RNA抗RNase R降解的特性。本研究通过转录组测序和生信分析手段鉴定了H1N1甲型流感病毒感染A549细胞前后环状RNA的表达谱,分析了环状RNA的长度、染色体分布、来源分类和可能参与的调控通路,筛选出了病毒感染后差异表达的环状RNA,为深入研究环状RNA是否在流感病毒感染期间发挥作用奠定了基础。
关键词
环状RNA
甲型流感病毒
A549细胞
差异表达
Keywords
circRNA
influenza A virus
A549 cells
differential expression
分类号
S852.659.5 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
数据中心热回收型专用空调系统智能控制及改造成效
被引量:
3
2
作者
许国平
李昶
张建风
王攀
刘昊儒
蒋盛强
机构
中国移动通信集团浙江有限公司
出处
《智能建筑》
2020年第5期27-31,共5页
文摘
在通信企业中时,柴油发电机组主要作为备用的交流电源,能在市电停电后迅速提供稳定的交流电源。为保证柴油发电机组的及时响应能力,按照中华人民共和国通信行业标准《YD/T 502-2007通信用柴油发电机组》要求,发电机房温度应保持在5~40℃,因为当机组水箱里的冷却水和发动机缸体里的机油温度较低时,会导致发电机组的启动成功率下降。柴油发电机组常用的加热方式是安装高功率水套加热器,以循环水的方式保证柴油发电机组的温度。
关键词
柴油发电机组
交流电源
通信行业标准
专用空调
智能控制
发电机房
数据中心
机油温度
分类号
TU831.8 [建筑科学—供热、供燃气、通风及空调工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
H1N1亚型流感病毒感染A549细胞的环状RNA表达分析
蒋盛强
胡靖
陈红英
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
数据中心热回收型专用空调系统智能控制及改造成效
许国平
李昶
张建风
王攀
刘昊儒
蒋盛强
《智能建筑》
2020
3
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