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H1N1亚型流感病毒感染A549细胞的环状RNA表达分析
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作者 蒋盛强 胡靖 陈红英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期4724-4734,共11页
通过对甲型H1N1流感病毒感染A549细胞前后表达的环状RNA进行鉴定,筛选病毒感染引起的差异表达环状RNA,为进一步研究环状RNA在流感病毒感染过程中的调控作用奠定基础。本研究从病毒感染和PBS处理的A549细胞中提取RNA,构建测序文库后进行... 通过对甲型H1N1流感病毒感染A549细胞前后表达的环状RNA进行鉴定,筛选病毒感染引起的差异表达环状RNA,为进一步研究环状RNA在流感病毒感染过程中的调控作用奠定基础。本研究从病毒感染和PBS处理的A549细胞中提取RNA,构建测序文库后进行全转录组测序。通过生信分析,鉴定了病毒感染前后宿主细胞表达的环状RNA。以未感染组为对照,使用EdgeR包,筛选条件:|log_(2)FC|≥1、P value<0.05,筛选获得感染前后的细胞中差异表达的环状RNA。使用ClusterProfiler包对差异表达环状RNA的来源基因进行GO和KEGG分析。最后通过荧光定量PCR、外切核糖核酸酶处理、Sanger测序等手段验证了病毒感染前后宿主细胞内部分环状RNA的差异表达。结果表明:流感病毒感染细胞后,环状RNA的表达数目增加。感染组和未感染组分别鉴定到1101和676个环状RNA表达,这些环状RNA广泛分布在所有染色体上,其中大部分(约60%)长度在300~1000 nt,约20%的环状RNA长度超过2000 nt。基于基因位置关系的分析发现,75%~82%的环状RNA源自外显子,12%~17%源自正链重叠转录本,少部分(1%~4%)来自内含子、基因间和反义链转录本。经差异表达分析,共筛选出54个表达上调,18个表达下调的环状RNA。这些差异表达的环状RNA主要分布在5号染色体和19号染色体上。基因本体论GO富集分析显示,差异表达环状RNA来源基因主要富集到RNA定位、细胞质膜和单链DNA结合等相关进程。KEGG通路分析显示,差异表达环状RNA主要与氨基酸降解、FoxO信号等通路相关。最后,通过RT-qPCR、RNase R消化、Sanger测序等方法,验证了环状RNA SNUPN(has_circ_0104558)、DCBLD1(hsa_circ_0077717)和EIF4G3(hsa_circ_0000025)在病毒感染前后细胞中的差异表达,证实其是由对应来源序列反向剪接而成并且具有环状RNA抗RNase R降解的特性。本研究通过转录组测序和生信分析手段鉴定了H1N1甲型流感病毒感染A549细胞前后环状RNA的表达谱,分析了环状RNA的长度、染色体分布、来源分类和可能参与的调控通路,筛选出了病毒感染后差异表达的环状RNA,为深入研究环状RNA是否在流感病毒感染期间发挥作用奠定了基础。 展开更多
关键词 环状RNA 甲型流感病毒 A549细胞 差异表达
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数据中心热回收型专用空调系统智能控制及改造成效 被引量:3
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作者 许国平 李昶 +3 位作者 张建风 王攀 刘昊儒 蒋盛强 《智能建筑》 2020年第5期27-31,共5页
在通信企业中时,柴油发电机组主要作为备用的交流电源,能在市电停电后迅速提供稳定的交流电源。为保证柴油发电机组的及时响应能力,按照中华人民共和国通信行业标准《YD/T 502-2007通信用柴油发电机组》要求,发电机房温度应保持在5~40℃... 在通信企业中时,柴油发电机组主要作为备用的交流电源,能在市电停电后迅速提供稳定的交流电源。为保证柴油发电机组的及时响应能力,按照中华人民共和国通信行业标准《YD/T 502-2007通信用柴油发电机组》要求,发电机房温度应保持在5~40℃,因为当机组水箱里的冷却水和发动机缸体里的机油温度较低时,会导致发电机组的启动成功率下降。柴油发电机组常用的加热方式是安装高功率水套加热器,以循环水的方式保证柴油发电机组的温度。 展开更多
关键词 柴油发电机组 交流电源 通信行业标准 专用空调 智能控制 发电机房 数据中心 机油温度
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