ESR、FSHβ、AHR基因多态性对二花脸猪产仔数的影响

[目的]本文旨在通过研究猪ESR、FSHβ和AHR基因多态性对二花脸群体产仔数的影响,鉴别出影响二花脸猪产仔数变异的关键基因。[方法]对303头二花脸猪进行ESR基因g.14418786、FSHβ基因g.3039847430398475ins292(292 bp大片段插入)、AHR基因g.86550830位点分型(Sscrofa11.1),用Excel 2003软件进行基因多态性分布的分析和卡方检验,并利用SAS 9.2软件混合模型对ESR、FSHβ、AHR基因及其合并基因型与产仔数进行关联性分析。[结果]ESR基因g.14418786、FSHβ基因g.3039847430398475ins292以及AHR基因g.86550830位点在二花脸群体中均具有多态性,且3个基因的不同等位基因频率差异很大,ESR基因g.14418786位点A、B等位基因频率分别为0.173和0.827,FSHβ基因g.3039847430398475ins292位点A、B等位基因频率分别为0.889和0.111,而AHR基因g.86550830位点G、T等位基因频率分别为0.889和0.111。ESR基因g.14418786位点的AA、AB和BB基因型频率分别为0.050、0.248和0.703,FSHβ基因g.3039847430398475ins292的AA、AB和BB基因型频率分别为0.808、0.162和0.030,AHR基因g.86550830位点的GG、GT和TT基因型频率则为0.792、0.194和0.013。ESR基因g.14418786与FSHβ基因g.3039847430398475ins292位点显著偏离哈代-温伯格平衡(P<0.05),而AHR基因g.86550830位点符合哈代-温伯格平衡(P>0.05)。关联性分析未发现ESR、FSHβ、AHR基因以及3个基因的合并基因型显著影响二花脸猪的产仔数(P>0.05)。[结论]本试验未能证明ESR、FSHβ和AHR基因是影响二花脸猪产仔数的主效基因,二花脸猪产仔数变异可能受其他基因影响。

猪8号染色体影响产仔数性状的QTL精细定位

实验旨在基于前期从二花脸猪群体鉴别到的猪8号染色体上影响产仔数性状的数量性状基因座(Quantitative trait loci,QTL),通过增加群体的数量(二花脸猪和梅山猪)以及分子标记的密度(1个SNP/14.5kb),利用单标记关联分析和合并群体的荟萃分析精细定位猪8号染色体影响产仔数的QTL,并挖掘QTL区域内候选基因。结果表明,基于二花脸猪群体的单标记关联分析,将影响经产胎次(2~7胎)产活仔数(Number born alive,NBA)的QTL分别精细定位至33818121~34324224 bp;基于梅山猪群体的单标记关联分析,将影响经产胎次(2~7胎)NBA的QTL分别精细定位至33884473~34156584 bp;基于二花脸猪群体和梅山猪群体荟萃分析,将影响经产胎次(2~7胎)NBA的QTL精细定位到33934355~34094188bp;最后将关联分析和荟萃分析重叠,将影响猪经产胎次(2~7胎)NBA的QTL精细定位到33934355~34094188bp;并且在QTL区间内发现UCHL1为关键位置功能候选基因。综上,本研究通过增加群体和标记密度成功在猪8号染色体上精细定位影响产仔数的QTL,并在QTL精细定位区间内发现UCHL1基因为影响猪产仔数的候选基因。

兰州不同地区商品猪SLA-DQB基因的差异性研究

为探讨兰州不同地区商品猪SLA-DQB基因的差异,以猪肉组织为实验材料,提取兰州永登县、榆中县、兰州市三个地方的白猪(毛色为全白)、黑猪(毛色为全黑)、花猪(毛色为黑白)的DNA,并对目的基因(SLA-DQB)进行PCR扩增,片段大小为273bp;将PCR产物送往北京六合华大基因科技股份有限公司兰州分公司测序,将测序好的核苷酸序列、氨基酸序列进行差异性分析。另外将兰州、永登县、榆中县商品猪的SLA-DQB基因序列与NCBI查找的SLA-DQB基因的苏太猪(登录号:AY303988)、太湖猪(登录号:AY243101)、五指山猪(登录号:AY243105)、大白猪(登录号:AY247779)。利用MEGA6.06软件构建进化树,进行相关分析,得出兰州不同商品猪与他们的亲缘关系远近。