目的探讨毅新博创Clin-TOF-I基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)分析性能验证方法,使之满足实验室对临床常见病原微生物的检测需要,为临...目的探讨毅新博创Clin-TOF-I基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)分析性能验证方法,使之满足实验室对临床常见病原微生物的检测需要,为临床提供及时准确的鉴定结果。方法选取标准菌株、质控菌株和临床菌株共167株,包含常见的革兰氏阳性及阴性杆菌67株、革兰氏阳性及阴性球菌45株、真菌33株,厌氧菌10株、苛养菌12株,所有菌株均经VITEK2 XL、Clin-TOF-II鉴定,必要时进行细菌16S rDNA验证。采用该质谱检测系统推荐的方法对以上菌株进行鉴定,完成准确度验证试验;选取标准菌株10株,采用该质谱检测系统对10株菌株每天进行质谱鉴定3次,连续鉴定3d,从而验证鉴定结果的重复性,即完成精密度验证。结果毅新博创质谱对标准/质控菌株的鉴定符合率为100%;对临床菌株的属水平鉴定符合率为100%;对常见革兰氏阳性及阴性杆菌的种水平鉴定符合率95.5%;对常见革兰氏阳性球菌的种水平鉴定符合率为100%;对真菌的种水平鉴定符合率为90.9%;对苛养菌的种水平鉴定符合率为100%;对厌氧菌的种水平鉴定符合率为100%。精密度验证试验结果重复性为100%。结论MALDI-TOF MS系统在革兰氏阳性及阴性杆菌、革兰氏阳性及阴性球菌、真菌、苛养菌鉴定的准确度和精密度均符合规定要求,验证通过。展开更多
目的通过对临床少见丝状真菌的分离和分析鉴定,探讨尖端赛多孢子菌、裂褶菌、短柄帚霉、匍枝根霉、茄病镰刀菌等临床不常见丝状真菌的实验诊断方法,为临床明确诊断真菌感染种类提供科学依据。方法从临床标本培养出的5株真菌用形态学方...目的通过对临床少见丝状真菌的分离和分析鉴定,探讨尖端赛多孢子菌、裂褶菌、短柄帚霉、匍枝根霉、茄病镰刀菌等临床不常见丝状真菌的实验诊断方法,为临床明确诊断真菌感染种类提供科学依据。方法从临床标本培养出的5株真菌用形态学方法未能作出准确鉴定,通过聚合酶链反应(PCR)和基因测序方法分析核糖体转录间隔区域ITS和ITS2序列,在NCBI网站应用Blastn对获得的基因序列进行同源性分析及利用Gen Bank中的系统发育软件自动生成系统发育树,以确定丝状真菌的种。结果 r DNA-ITS序列分析结合形态学分析,5株菌均可鉴定到种的水平,鉴定结果分别是:尖端赛多孢子菌、裂褶菌、短柄帚霉、匍枝根霉和茄病镰刀菌。结论传统形态学方法,极易受检验人员经验水平影响,对于罕见菌株甚至不能作出鉴定,利用真菌的ITS序列的特异性,可快速、准确将大部分丝状真菌鉴定到种水平。展开更多
文摘目的通过对临床少见丝状真菌的分离和分析鉴定,探讨尖端赛多孢子菌、裂褶菌、短柄帚霉、匍枝根霉、茄病镰刀菌等临床不常见丝状真菌的实验诊断方法,为临床明确诊断真菌感染种类提供科学依据。方法从临床标本培养出的5株真菌用形态学方法未能作出准确鉴定,通过聚合酶链反应(PCR)和基因测序方法分析核糖体转录间隔区域ITS和ITS2序列,在NCBI网站应用Blastn对获得的基因序列进行同源性分析及利用Gen Bank中的系统发育软件自动生成系统发育树,以确定丝状真菌的种。结果 r DNA-ITS序列分析结合形态学分析,5株菌均可鉴定到种的水平,鉴定结果分别是:尖端赛多孢子菌、裂褶菌、短柄帚霉、匍枝根霉和茄病镰刀菌。结论传统形态学方法,极易受检验人员经验水平影响,对于罕见菌株甚至不能作出鉴定,利用真菌的ITS序列的特异性,可快速、准确将大部分丝状真菌鉴定到种水平。