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我国东北部分地区宿主动物感染汉坦病毒的分子流行病学调查
被引量:
5
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作者
姚昆
江佳富
+9 位作者
张文义
赵秋敏
蒋西宁
左曙青
吴晓明
詹琳
褚宸一
张泮河
杨红
曹务春
《中国病原生物学杂志》
CSCD
2007年第1期1-3,10,共4页
目的了解我国东北部分地区宿主动物携带汉坦病毒状况及其型别。方法采用夹夜法捕鼠,针对不同型别汉坦病毒M片段设计引物,应用RT—PCR检测带毒状况,阳性标本测序,对M片段变异大的标本再进行S片段的扩增测序,获得序列用clustalX(1...
目的了解我国东北部分地区宿主动物携带汉坦病毒状况及其型别。方法采用夹夜法捕鼠,针对不同型别汉坦病毒M片段设计引物,应用RT—PCR检测带毒状况,阳性标本测序,对M片段变异大的标本再进行S片段的扩增测序,获得序列用clustalX(1.83)和Phylip3.63进行分析。结果共捕获鼠类宿主220只,平均阳性率为3.64%,不同鼠种间阳性率差别有统计学意义。其中从棕背鼠平鼠Jilin-54、Jilin-59检测到汉滩型汉坦病毒,从褐家鼠Jilin-99、Ji—lin-106标本中检测到汉城型汉坦病毒。而从大林姬鼠HU-32、Jilin—AP10和HLJ-47中得到的汉坦病毒M片段均与HTNV原型株76-118同源性最高(95.35%~97.42%);来源吉林(毗邻俄罗斯远东地区)大林姬鼠的Jilin-AP06的汉坦病毒M片段与我国病人分离株B78、H5同源性最高(97.25%~95.33%),与来源俄罗斯远东地区大林姬鼠的Amur类汉坦病毒AP111株同源性为93.48%,与来自吉林大林姬鼠的Jilin93同源性为80.80%,与76-118同源性为80.80%,与朝鲜大林姬鼠分离株Soochong-1同源性为88.24%。Jilin-AP06S片段同其他株的同源性与M片段的结果一致。结论我国东北部分地区宿主动物携带汉坦病毒的型别多样,我国大林姬鼠中存在Amur类病毒感染。
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关键词
宿主动物
汉坦病毒
序列分析
分子流行病学
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职称材料
题名
我国东北部分地区宿主动物感染汉坦病毒的分子流行病学调查
被引量:
5
1
作者
姚昆
江佳富
张文义
赵秋敏
蒋西宁
左曙青
吴晓明
詹琳
褚宸一
张泮河
杨红
曹务春
机构
军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室
解放军总参管理局第五门诊部
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
2007年第1期1-3,10,共4页
基金
国家自然科学基金重大项目(No.30590374)
北京市自然科学基金资助项目(No.06G0668)
军队‘十一五’计划立项课题(No.06MA33)。
文摘
目的了解我国东北部分地区宿主动物携带汉坦病毒状况及其型别。方法采用夹夜法捕鼠,针对不同型别汉坦病毒M片段设计引物,应用RT—PCR检测带毒状况,阳性标本测序,对M片段变异大的标本再进行S片段的扩增测序,获得序列用clustalX(1.83)和Phylip3.63进行分析。结果共捕获鼠类宿主220只,平均阳性率为3.64%,不同鼠种间阳性率差别有统计学意义。其中从棕背鼠平鼠Jilin-54、Jilin-59检测到汉滩型汉坦病毒,从褐家鼠Jilin-99、Ji—lin-106标本中检测到汉城型汉坦病毒。而从大林姬鼠HU-32、Jilin—AP10和HLJ-47中得到的汉坦病毒M片段均与HTNV原型株76-118同源性最高(95.35%~97.42%);来源吉林(毗邻俄罗斯远东地区)大林姬鼠的Jilin-AP06的汉坦病毒M片段与我国病人分离株B78、H5同源性最高(97.25%~95.33%),与来源俄罗斯远东地区大林姬鼠的Amur类汉坦病毒AP111株同源性为93.48%,与来自吉林大林姬鼠的Jilin93同源性为80.80%,与76-118同源性为80.80%,与朝鲜大林姬鼠分离株Soochong-1同源性为88.24%。Jilin-AP06S片段同其他株的同源性与M片段的结果一致。结论我国东北部分地区宿主动物携带汉坦病毒的型别多样,我国大林姬鼠中存在Amur类病毒感染。
关键词
宿主动物
汉坦病毒
序列分析
分子流行病学
Keywords
Hantavirus
reservoir animal
sequence analysis
molecular epidemiology
分类号
R373.9 [医药卫生—病原生物学]
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题名
作者
出处
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1
我国东北部分地区宿主动物感染汉坦病毒的分子流行病学调查
姚昆
江佳富
张文义
赵秋敏
蒋西宁
左曙青
吴晓明
詹琳
褚宸一
张泮河
杨红
曹务春
《中国病原生物学杂志》
CSCD
2007
5
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