巨大口蘑内参基因的筛选

根据巨大口蘑(Tricholoma giganteum)转录组测序组装结果,选取6个组成型表达基因(β微管蛋白基因β-tubulin、肌动蛋白基因act、核糖体蛋白基因60S、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸还原酶基因ND、RNA聚合酶Ⅱ基因rpb2、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因gapdh)为候选内参基因,结合geNorm、NormFinder以及BestKeeper软件与实时荧光定量PCR技术,对巨大口蘑各候选内参基因在不同生长阶段(Ⅰ组)、不同组织(Ⅱ组)以及不同亚铁离子浓度胁迫条件下(Ⅲ组)的表达稳定性进行分析。结果表明:β-tubulin基因在供试条件下的相对表达量较稳定,可作为巨大口蘑功能基因转录水平分析的内参基因。

三种巨大口蘑菌株贮藏期间褐变及相关酶活性

以巨大口蘑SCAU1、新3和新4三种菌株子实体为试材,于12℃和相对湿度95%下贮藏,定期取样测定褐变度、多酚氧化酶(PPO)、酪氨酸酶(TYR)、漆酶和总酚等生理指标,研究各菌株的褐变度与酶活性及总酚的相关性。结果表明,贮藏期间三种巨大口蘑菌株的褐变度呈上升趋势,PPO、TYR及漆酶的活性均呈下降趋势,其中SCAU1菌株的褐变度和PPO、TYR及漆酶活性最低,而总酚含量与新3和新4差异不显著(p> 0.05);相关性分析结果显示,新3、新4菌株的褐变度均与PPO活性呈极显著负相关(p <0.01),SCAU1菌株的褐变度与PPO活性呈显著负相关(p <0.05),相关性从高到低依次为新3菌株>新4菌株> SCAU1菌株,此外,新3菌株的褐变度与TYR活性呈显著负相关(p <0.05)。该结果可为巨大口蘑优良菌株的选育和褐变内在机理的揭示提供依据。

空间多组学测序为组织原位的转录调控研究提供新的机遇

Spatial techniques can profile omics information while preserving the spatial coordinates of tissues.Compared with single-cell sequencing,the additional spatial information is vital in studying the intercellular communication underlying development and disease[1].In the past,spatial techniques can only capture one layer of omics at a time,such as transcriptome[2],epigenome[3–5]。