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紫花苜蓿不育系与保持系线粒体全基因组比较分析
1
作者
贾雪
蔡回彩
+2 位作者
于澜
李沛
徐博
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期2737-2748,共12页
细胞质雄性不育(Cytoplasmic male sterility,CMS),它可以极大地减少人工去雄所带来的人工成本。本试验以紫花苜蓿(Medicago sativa L.)不育系MSGN-1A及其保持系MSGN-1B为试验材料,采用二代Illumina Hiseq测序技术结合三代PacBio测序技...
细胞质雄性不育(Cytoplasmic male sterility,CMS),它可以极大地减少人工去雄所带来的人工成本。本试验以紫花苜蓿(Medicago sativa L.)不育系MSGN-1A及其保持系MSGN-1B为试验材料,采用二代Illumina Hiseq测序技术结合三代PacBio测序技术,并以三代Naopore测序作为辅助进行gap补平,对2份材料的线粒体基因组测序后进行组装,并比较分析不育系和保持系的线粒体基因组结构和基因差异。结果显示紫花苜蓿MSGN-1A和MSGN-1B线粒体基因组大小分别为297940 bp和310534 bp,两份材料均注释到蛋白编码基因31个,tRNA基因分别为18个和17个,均注释到3个rRNA基因。不育系和保持系对比发现存在大量的SNPs和InDels,导致部分蛋白编码基因的编码产物发生变化。预测编码开放阅读框(Open reading frame,ORFs)分别为67个和71个,预测到不育系特有的ORFs为20个,其中8个含有跨膜结构域。最终筛选出atp8,nad4,rps3,ccmFn四个蛋白编码基因和orf145a,orf135b两个ORFs,可能与紫花苜蓿细胞质雄性不育有关。
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关键词
紫花苜蓿
细胞质雄性不育
线粒体基因组
差异基因
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职称材料
16个紫花苜蓿杂交组合农艺、产量与品质性状综合评价
2
作者
李沛
王英哲
+5 位作者
于澜
蔡回彩
张书赫
贾雪
刘永莉
徐博
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024年第9期85-90,119,共7页
为了综合评价紫花苜蓿杂交组合农艺、产量与品质性状,试验以16个优良紫花苜蓿为父本、以雄性不育系MS-JN为母本培育了16个杂交组合(M01~M16),采用方差分析、聚类分析、相关性分析和灰色关联分析相结合的方法,对杂交组合材料的主要农艺...
为了综合评价紫花苜蓿杂交组合农艺、产量与品质性状,试验以16个优良紫花苜蓿为父本、以雄性不育系MS-JN为母本培育了16个杂交组合(M01~M16),采用方差分析、聚类分析、相关性分析和灰色关联分析相结合的方法,对杂交组合材料的主要农艺性状指标(叶长、叶宽、株高、分枝数、单株鲜重、单株干重、鲜干比)和品质性状指标(粗脂肪、粗纤维、中性洗涤纤维、酸性洗涤纤维、水分、干物质、灰分、粗蛋白、叶茎比)进行综合评价,计算等权关联度和加权关联度。结果表明:16个紫花苜蓿杂交组合的各农艺、产量和品质性状指标间存在不同的差异,对农艺性状与草产量性状进行聚类分析,M01(新星)为第Ⅰ类;对品质性状进行聚类分析,M14(骑士T)和M13(可汗)为第Ⅰ类。株高、分枝数与单株鲜重和单株干重呈显著或极显著正相关(P≤0.05或P≤0.01)。M10(佰牧401)的相对饲喂价值为190.83,饲料分级指数为20.42,均较高,综合表现较好。M02(康赛Ⅰ)的等权关联度和加权关联度均最高,各性状综合表现突出。说明株高和分枝数可作为培育高产紫花苜蓿的重要参考指标,M02(康赛Ⅰ)可作为优异种子资源材料用于选育紫花苜蓿新品种。
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关键词
紫花苜蓿
农艺性状
品质分析
灰色关联度
相关性分析
原文传递
野生朝鲜碱茅光合特性和农艺性状的综合评价
3
作者
于澜
李沛
+4 位作者
蔡回彩
王英哲
贾雪
金旭
徐博
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024年第10期71-75,115,共6页
为了筛选适合吉林省西部地区草原栽培的优质朝鲜碱茅材料,试验于白城市、洮南市、通榆县、大安市等的主要盐碱地采集11份(编号为J01~J11)野生朝鲜碱茅(Puccinellia chinampoensis Ohwi)种子,在吉林农业大学温室内育苗后移栽至大田,测定...
为了筛选适合吉林省西部地区草原栽培的优质朝鲜碱茅材料,试验于白城市、洮南市、通榆县、大安市等的主要盐碱地采集11份(编号为J01~J11)野生朝鲜碱茅(Puccinellia chinampoensis Ohwi)种子,在吉林农业大学温室内育苗后移栽至大田,测定其光合特性指标(净光合速率、胞间CO_(2)浓度、蒸腾速率、水分利用效率、气孔导度)、农艺性状指标(叶长、叶宽、叶面积和株高)及单株干草产量,并对以上10个指标进行单因素方差分析、相关性分析、灰色关联分析和主成分分析,根据主成分得分建立综合评价模型对11份材料进行综合排名。结果表明:J03和J10的水分利用效率与单株干草产量均较高,且水分利用效率与叶长、叶面积呈显著正相关(P<0.05);10个指标中水分利用效率、叶长、株高、叶宽、净光合速率与单株干草产量的关联度较大;通过主成分分析将10个指标简化成2个主成分,累积贡献率达到84.402%,综合得分由高到低为J05、J09、J06、J03、J01、J08、J07、J11、J10、J02、J04。说明朝鲜碱茅的光合特性与产量密切相关,水分利用效率、叶长、株高、叶宽和净光合速率对产量影响较大,可作为育种研究的选种依据,J05、J09和J06 3份优良种质适宜在吉林省西部地区推广。
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关键词
朝鲜碱茅
光合特性
农艺性状
主成分分析
综合评价
原文传递
题名
紫花苜蓿不育系与保持系线粒体全基因组比较分析
1
作者
贾雪
蔡回彩
于澜
李沛
徐博
机构
吉林农业大学林学与草学学院
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期2737-2748,共12页
基金
科技创新2030-重大项目(2022ZD04012)资助。
文摘
细胞质雄性不育(Cytoplasmic male sterility,CMS),它可以极大地减少人工去雄所带来的人工成本。本试验以紫花苜蓿(Medicago sativa L.)不育系MSGN-1A及其保持系MSGN-1B为试验材料,采用二代Illumina Hiseq测序技术结合三代PacBio测序技术,并以三代Naopore测序作为辅助进行gap补平,对2份材料的线粒体基因组测序后进行组装,并比较分析不育系和保持系的线粒体基因组结构和基因差异。结果显示紫花苜蓿MSGN-1A和MSGN-1B线粒体基因组大小分别为297940 bp和310534 bp,两份材料均注释到蛋白编码基因31个,tRNA基因分别为18个和17个,均注释到3个rRNA基因。不育系和保持系对比发现存在大量的SNPs和InDels,导致部分蛋白编码基因的编码产物发生变化。预测编码开放阅读框(Open reading frame,ORFs)分别为67个和71个,预测到不育系特有的ORFs为20个,其中8个含有跨膜结构域。最终筛选出atp8,nad4,rps3,ccmFn四个蛋白编码基因和orf145a,orf135b两个ORFs,可能与紫花苜蓿细胞质雄性不育有关。
关键词
紫花苜蓿
细胞质雄性不育
线粒体基因组
差异基因
Keywords
Alfalfa(Medicago sativa L.)
Cytoplasmic male sterility
Mitochondrial genome
Differential genes
分类号
S812 [农业科学—草业科学]
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职称材料
题名
16个紫花苜蓿杂交组合农艺、产量与品质性状综合评价
2
作者
李沛
王英哲
于澜
蔡回彩
张书赫
贾雪
刘永莉
徐博
机构
吉林农业大学林学与草学学院
吉林省农业科学院
吉林市农业科学院作物研究所
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024年第9期85-90,119,共7页
基金
科技创新2030重大项目(2022ZD04012)
吉林省科学技术厅科技发展计划项目(20210202069nc)
+1 种基金
内蒙古自治区“揭榜挂帅”项目“优质苜蓿新品种选育及产业化示范”(2022JBGS0020)
国际科技合作项目(20210402041G H)。
文摘
为了综合评价紫花苜蓿杂交组合农艺、产量与品质性状,试验以16个优良紫花苜蓿为父本、以雄性不育系MS-JN为母本培育了16个杂交组合(M01~M16),采用方差分析、聚类分析、相关性分析和灰色关联分析相结合的方法,对杂交组合材料的主要农艺性状指标(叶长、叶宽、株高、分枝数、单株鲜重、单株干重、鲜干比)和品质性状指标(粗脂肪、粗纤维、中性洗涤纤维、酸性洗涤纤维、水分、干物质、灰分、粗蛋白、叶茎比)进行综合评价,计算等权关联度和加权关联度。结果表明:16个紫花苜蓿杂交组合的各农艺、产量和品质性状指标间存在不同的差异,对农艺性状与草产量性状进行聚类分析,M01(新星)为第Ⅰ类;对品质性状进行聚类分析,M14(骑士T)和M13(可汗)为第Ⅰ类。株高、分枝数与单株鲜重和单株干重呈显著或极显著正相关(P≤0.05或P≤0.01)。M10(佰牧401)的相对饲喂价值为190.83,饲料分级指数为20.42,均较高,综合表现较好。M02(康赛Ⅰ)的等权关联度和加权关联度均最高,各性状综合表现突出。说明株高和分枝数可作为培育高产紫花苜蓿的重要参考指标,M02(康赛Ⅰ)可作为优异种子资源材料用于选育紫花苜蓿新品种。
关键词
紫花苜蓿
农艺性状
品质分析
灰色关联度
相关性分析
Keywords
alfalfa
agronomic traits
quality analysis
gray correlation
correlation analysis
分类号
S541.9 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
野生朝鲜碱茅光合特性和农艺性状的综合评价
3
作者
于澜
李沛
蔡回彩
王英哲
贾雪
金旭
徐博
机构
吉林农业大学林学与草学学院
吉林省农业科学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024年第10期71-75,115,共6页
基金
吉林省科学技术厅科技发展计划项目(20210202069nc)
国家林业和草原局应急科技揭榜挂帅项目(20220101)。
文摘
为了筛选适合吉林省西部地区草原栽培的优质朝鲜碱茅材料,试验于白城市、洮南市、通榆县、大安市等的主要盐碱地采集11份(编号为J01~J11)野生朝鲜碱茅(Puccinellia chinampoensis Ohwi)种子,在吉林农业大学温室内育苗后移栽至大田,测定其光合特性指标(净光合速率、胞间CO_(2)浓度、蒸腾速率、水分利用效率、气孔导度)、农艺性状指标(叶长、叶宽、叶面积和株高)及单株干草产量,并对以上10个指标进行单因素方差分析、相关性分析、灰色关联分析和主成分分析,根据主成分得分建立综合评价模型对11份材料进行综合排名。结果表明:J03和J10的水分利用效率与单株干草产量均较高,且水分利用效率与叶长、叶面积呈显著正相关(P<0.05);10个指标中水分利用效率、叶长、株高、叶宽、净光合速率与单株干草产量的关联度较大;通过主成分分析将10个指标简化成2个主成分,累积贡献率达到84.402%,综合得分由高到低为J05、J09、J06、J03、J01、J08、J07、J11、J10、J02、J04。说明朝鲜碱茅的光合特性与产量密切相关,水分利用效率、叶长、株高、叶宽和净光合速率对产量影响较大,可作为育种研究的选种依据,J05、J09和J06 3份优良种质适宜在吉林省西部地区推广。
关键词
朝鲜碱茅
光合特性
农艺性状
主成分分析
综合评价
Keywords
Puccinellia chinampoensis Ohwi
agronomic traits
photosynthetic properties
principal component analysis
comprehensive evaluation
分类号
S548 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
紫花苜蓿不育系与保持系线粒体全基因组比较分析
贾雪
蔡回彩
于澜
李沛
徐博
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
16个紫花苜蓿杂交组合农艺、产量与品质性状综合评价
李沛
王英哲
于澜
蔡回彩
张书赫
贾雪
刘永莉
徐博
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024
0
原文传递
3
野生朝鲜碱茅光合特性和农艺性状的综合评价
于澜
李沛
蔡回彩
王英哲
贾雪
金旭
徐博
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024
0
原文传递
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