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克罗恩病CNTNAP3基因拷贝数变异及其意义
1
作者
黄美兰
乔宇琪
+4 位作者
沈骏
蔡晨雯
徐锡涛
陈胜良
冉志华
《胃肠病学》
2017年第6期325-330,共6页
背景:DNA拷贝数变异是人类疾病的重要致病因素,可能参与了炎症性肠病(IBD)的发病机制和病理过程。目的:探讨CNTNAP3基因在克罗恩病(CD)中的拷贝数变异情况及其意义。方法:纳入2009年7月—2010年12月上海交通大学医学院附属仁济医院收治...
背景:DNA拷贝数变异是人类疾病的重要致病因素,可能参与了炎症性肠病(IBD)的发病机制和病理过程。目的:探讨CNTNAP3基因在克罗恩病(CD)中的拷贝数变异情况及其意义。方法:纳入2009年7月—2010年12月上海交通大学医学院附属仁济医院收治的活动期CD患者101例,同期80例健康体检者作为正常对照。采集CD患者外周血或肠黏膜标本,以比较基因组杂交芯片(a CGH,n=8)和荧光定量PCR(n=93)筛选、验证CNTNAP3基因拷贝数变异,ELISA法(n=55)检测CNTNAP3编码蛋白表达。结果:a CGH检测显示初发CD患者染色体9p13区域(含CNTNAP3基因)存在大片段拷贝数扩增;荧光定量PCR验证并确认CD组外周血CNTNAP3基因拷贝数显著高于正常对照组,非激素治疗组差异更为明显(208 616.4±126 984.7和233 453.3±113 520.8对161 750.2±53 940.3,P<0.05和P<0.01)。在各项CD临床参数中,仅吸烟史与CNTNAP3基因拷贝数扩增显著相关(P<0.05),但拷贝数明显扩增者的血浆CNTNAP3水平与正常对照组无明显差异(P>0.05),与简化CD内镜评分无相关性(P>0.05)。结论:CNTNAP3基因拷贝数扩增可能参与了中国CD人群的发病,激素治疗和吸烟可能是影响该基因拷贝数变异的因素;血浆CNTNAP3水平不能用于区分CD患者与健康人。本研究结论有待进一步验证。
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关键词
炎症性肠病
CROHN病
DNA拷贝数变异
CNTNAP3基因
比较基因组学
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职称材料
转染及表达细小病毒H-1非结构蛋白1基因对人胃癌细胞的抑制作用
2
作者
赵笛
蔡晨雯
+2 位作者
刘炯
萧树东
郑青
《中华消化杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期460-464,共5页
目的探讨细小病毒H-1非结构蛋白1(NS1)基因对人胃癌细胞的抑制作用及其可能的机制。方法构建表达增强型绿色荧光蛋白(eGFP)标记的NS1重组质粒(peGFP-C1-NS1),分别使用peGFP—C1-NS1(实验组)或空载体质粒(peGFP-C1,阴性对照...
目的探讨细小病毒H-1非结构蛋白1(NS1)基因对人胃癌细胞的抑制作用及其可能的机制。方法构建表达增强型绿色荧光蛋白(eGFP)标记的NS1重组质粒(peGFP-C1-NS1),分别使用peGFP—C1-NS1(实验组)或空载体质粒(peGFP-C1,阴性对照组)转染人胃癌SGC7901细胞株,空白对照组则予等量磷酸盐缓冲液处理。转染后在荧光显微镜下观察细胞内荧光信号分布,检测NS1基因及蛋白表达情况。绘制细胞生长曲线,检测细胞衰老相关β-半乳糖苷酶(SA-13-Gal)的表达,并使用流式细胞仪分析细胞周期分布变化。两组间比较行t检验。结果转染peGFP-C1-NS1后SGC7901细胞表达NS1基因及蛋白,与阴性对照组相比,实验组细胞荧光信号集中于细胞核内。实验组SA-8-Gal阳性细胞比例[(30.5±1.4)%]高于阴性对照组[(4.4±1.1)%],差异有统计学意义(t=12.931,P〈0.01)。转染peGFP—C1-NS1后1、2、3、4dSGC7901细胞的抑制率分别为45%、62%、73%、77%。表达eGFP—NS1融合蛋白的SGC7901细胞细胞周期被阻滞于G0/G1期。结论细小病毒H-1NS1在胃癌SGC7901细胞核内发挥作用,可将细胞周期阻滞于G0/G1期,有效抑制SGC7901细胞生长。
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关键词
胃肿瘤
细小病毒H-1
病毒非结构蛋白质类
基因
肿瘤抑制
细胞衰老
细胞周期
原文传递
转录组测序分析吲哚美辛对小鼠小肠类器官的影响
3
作者
宋东娟
童锦禄
+4 位作者
郑青
蔡晨雯
沈骏
赵笛
冉志华
《中华炎性肠病杂志(中英文)》
2017年第3期171-176,共6页
目的 探讨吲哚美辛对小鼠小肠类器官转录组的影响.方法 采用四唑盐比色法检测吲哚美辛对小肠类器官存活率的影响,Illumina Hiseq测序技术筛选吲哚美辛组与对照组小肠类器官之间的差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(GO)、京都...
目的 探讨吲哚美辛对小鼠小肠类器官转录组的影响.方法 采用四唑盐比色法检测吲哚美辛对小肠类器官存活率的影响,Illumina Hiseq测序技术筛选吲哚美辛组与对照组小肠类器官之间的差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能注释与富集分析.结果 四唑盐比色法检测结果显示100,250,300,400,500 μM吲哚美辛作用于小鼠小肠类器官48 h后的存活率分别为80.34%,70.17%,61.94%,54.38%,42.22%.250 μM吲哚美辛作用于小鼠小肠类器官24h、48 h、72 h后的存活率分别为80.56%,70.17%,59.30%.GO富集分析发现在细胞组分分类上,差异表达基因主要富集在微体与过氧化物酶体(P<0.01),在分子功能组上,氧化还原活性、谷胱甘肽转移酶、羧酸结合是显著富集的类型(P<0.01),有机酸代谢过程、含氧酸代谢过程与羧酸代谢过程是显著富集的GO生物过程(P<0.01).KEGG富集分析发现差异表达基因显著富集在化学致癌作用、异源物质细胞色素P450代谢、细胞色素P450药物代谢、PPAR信号通路(P<0.01).结论 吲哚美辛以时间与浓度依赖性方式抑制小鼠小肠类器官的增殖.小肠类器官可能存在抗氧化应激作用抵御吲哚美辛引起的小肠损伤.逆转氧化应激有望成为非甾体抗炎药小肠损伤的治疗靶点.
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关键词
吲哚美辛
小肠类器官
高通量测序
原文传递
题名
克罗恩病CNTNAP3基因拷贝数变异及其意义
1
作者
黄美兰
乔宇琪
沈骏
蔡晨雯
徐锡涛
陈胜良
冉志华
机构
上海交通大学医学院附属仁济医院南院消化内科
上海交通大学医学院附属仁济医院消化内科上海市消化疾病研究所上海市炎症性肠病研究中心
出处
《胃肠病学》
2017年第6期325-330,共6页
基金
国家自然科学基金(81500422)
文摘
背景:DNA拷贝数变异是人类疾病的重要致病因素,可能参与了炎症性肠病(IBD)的发病机制和病理过程。目的:探讨CNTNAP3基因在克罗恩病(CD)中的拷贝数变异情况及其意义。方法:纳入2009年7月—2010年12月上海交通大学医学院附属仁济医院收治的活动期CD患者101例,同期80例健康体检者作为正常对照。采集CD患者外周血或肠黏膜标本,以比较基因组杂交芯片(a CGH,n=8)和荧光定量PCR(n=93)筛选、验证CNTNAP3基因拷贝数变异,ELISA法(n=55)检测CNTNAP3编码蛋白表达。结果:a CGH检测显示初发CD患者染色体9p13区域(含CNTNAP3基因)存在大片段拷贝数扩增;荧光定量PCR验证并确认CD组外周血CNTNAP3基因拷贝数显著高于正常对照组,非激素治疗组差异更为明显(208 616.4±126 984.7和233 453.3±113 520.8对161 750.2±53 940.3,P<0.05和P<0.01)。在各项CD临床参数中,仅吸烟史与CNTNAP3基因拷贝数扩增显著相关(P<0.05),但拷贝数明显扩增者的血浆CNTNAP3水平与正常对照组无明显差异(P>0.05),与简化CD内镜评分无相关性(P>0.05)。结论:CNTNAP3基因拷贝数扩增可能参与了中国CD人群的发病,激素治疗和吸烟可能是影响该基因拷贝数变异的因素;血浆CNTNAP3水平不能用于区分CD患者与健康人。本研究结论有待进一步验证。
关键词
炎症性肠病
CROHN病
DNA拷贝数变异
CNTNAP3基因
比较基因组学
Keywords
Inflammatory Bowel Disease
Crohn Disease
DNA Copy Number Variations
CNTNAP3 Gene
Comparative Genomics
分类号
R574.62 [医药卫生—消化系统]
下载PDF
职称材料
题名
转染及表达细小病毒H-1非结构蛋白1基因对人胃癌细胞的抑制作用
2
作者
赵笛
蔡晨雯
刘炯
萧树东
郑青
机构
上海交通大学医学院附属仁济医院消化内科上海市消化疾病研究所
南京军区南京总医院消化内科
出处
《中华消化杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期460-464,共5页
文摘
目的探讨细小病毒H-1非结构蛋白1(NS1)基因对人胃癌细胞的抑制作用及其可能的机制。方法构建表达增强型绿色荧光蛋白(eGFP)标记的NS1重组质粒(peGFP-C1-NS1),分别使用peGFP—C1-NS1(实验组)或空载体质粒(peGFP-C1,阴性对照组)转染人胃癌SGC7901细胞株,空白对照组则予等量磷酸盐缓冲液处理。转染后在荧光显微镜下观察细胞内荧光信号分布,检测NS1基因及蛋白表达情况。绘制细胞生长曲线,检测细胞衰老相关β-半乳糖苷酶(SA-13-Gal)的表达,并使用流式细胞仪分析细胞周期分布变化。两组间比较行t检验。结果转染peGFP-C1-NS1后SGC7901细胞表达NS1基因及蛋白,与阴性对照组相比,实验组细胞荧光信号集中于细胞核内。实验组SA-8-Gal阳性细胞比例[(30.5±1.4)%]高于阴性对照组[(4.4±1.1)%],差异有统计学意义(t=12.931,P〈0.01)。转染peGFP—C1-NS1后1、2、3、4dSGC7901细胞的抑制率分别为45%、62%、73%、77%。表达eGFP—NS1融合蛋白的SGC7901细胞细胞周期被阻滞于G0/G1期。结论细小病毒H-1NS1在胃癌SGC7901细胞核内发挥作用,可将细胞周期阻滞于G0/G1期,有效抑制SGC7901细胞生长。
关键词
胃肿瘤
细小病毒H-1
病毒非结构蛋白质类
基因
肿瘤抑制
细胞衰老
细胞周期
Keywords
Stomach neoplasms
H-1 parvovirus
Viral nonstructural proteins
Genes, tumor suppressor
Cell aging
Cell cycle
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
转录组测序分析吲哚美辛对小鼠小肠类器官的影响
3
作者
宋东娟
童锦禄
郑青
蔡晨雯
沈骏
赵笛
冉志华
机构
上海交通大学医学院附属仁济医院消化内科上海市消化疾病研究所上海市炎症性肠病研究中心
出处
《中华炎性肠病杂志(中英文)》
2017年第3期171-176,共6页
基金
国家自然科学基金(81370508,81470820)
上海交通大学医学院附属仁济医院MDT培育项目(PYMDT-005).
文摘
目的 探讨吲哚美辛对小鼠小肠类器官转录组的影响.方法 采用四唑盐比色法检测吲哚美辛对小肠类器官存活率的影响,Illumina Hiseq测序技术筛选吲哚美辛组与对照组小肠类器官之间的差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能注释与富集分析.结果 四唑盐比色法检测结果显示100,250,300,400,500 μM吲哚美辛作用于小鼠小肠类器官48 h后的存活率分别为80.34%,70.17%,61.94%,54.38%,42.22%.250 μM吲哚美辛作用于小鼠小肠类器官24h、48 h、72 h后的存活率分别为80.56%,70.17%,59.30%.GO富集分析发现在细胞组分分类上,差异表达基因主要富集在微体与过氧化物酶体(P<0.01),在分子功能组上,氧化还原活性、谷胱甘肽转移酶、羧酸结合是显著富集的类型(P<0.01),有机酸代谢过程、含氧酸代谢过程与羧酸代谢过程是显著富集的GO生物过程(P<0.01).KEGG富集分析发现差异表达基因显著富集在化学致癌作用、异源物质细胞色素P450代谢、细胞色素P450药物代谢、PPAR信号通路(P<0.01).结论 吲哚美辛以时间与浓度依赖性方式抑制小鼠小肠类器官的增殖.小肠类器官可能存在抗氧化应激作用抵御吲哚美辛引起的小肠损伤.逆转氧化应激有望成为非甾体抗炎药小肠损伤的治疗靶点.
关键词
吲哚美辛
小肠类器官
高通量测序
Keywords
Indomethacin
Enteroids
High—throughput sequencing
分类号
R57 [医药卫生—消化系统]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
克罗恩病CNTNAP3基因拷贝数变异及其意义
黄美兰
乔宇琪
沈骏
蔡晨雯
徐锡涛
陈胜良
冉志华
《胃肠病学》
2017
0
下载PDF
职称材料
2
转染及表达细小病毒H-1非结构蛋白1基因对人胃癌细胞的抑制作用
赵笛
蔡晨雯
刘炯
萧树东
郑青
《中华消化杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
原文传递
3
转录组测序分析吲哚美辛对小鼠小肠类器官的影响
宋东娟
童锦禄
郑青
蔡晨雯
沈骏
赵笛
冉志华
《中华炎性肠病杂志(中英文)》
2017
0
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