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含有L-对硝基苯丙氨酸的BAFF改构体的分子动力学模拟与分析 被引量:2
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作者 蔡棣 田浤 姚文兵 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期227-232,共6页
建立含有L-对硝基苯丙氨酸(p-nitro-L-phenylalanine,pNO_2Phe)蛋白的分子动力学模拟方法,分析了含有pNO_2Phe的蛋白具有免疫原性的构效关系,为其他含有非天然氨基酸蛋白的动力学模拟研究提供参考。使用CGenFF-paramchem计算天然氨基酸... 建立含有L-对硝基苯丙氨酸(p-nitro-L-phenylalanine,pNO_2Phe)蛋白的分子动力学模拟方法,分析了含有pNO_2Phe的蛋白具有免疫原性的构效关系,为其他含有非天然氨基酸蛋白的动力学模拟研究提供参考。使用CGenFF-paramchem计算天然氨基酸中不存在的L-对硝基苯丙氨酸的新的成键、键角、二面角信息与能量,将新成键的键长、键角、二面角参数与相应的能量信息写入CHARMM(chemistry at Harvard macromolecular mechanics)力场参数文件中。重新定义L-对硝基苯丙氨酸的CHARMM力场参数后,利用纳米分子动力学(NAMD)成功对含有L-对硝基苯丙氨酸的B淋巴细胞刺激因子(BAFF)进行动力学模拟。统计动力学模拟过程中的每一帧体系的温度,作出的温度分布图符合正态分布,证明了新定义力场参数的稳定性。模拟结果中,蛋白的均方根偏差(RMSD)在趋近于2.5,pNO_2Phe残基的均方根涨落(RMSF)为3.7,显著高于分子的其他部位,表明pNO_2Phe残基运动剧烈,蛋白在该残基附近结构的可变性较大,可能会产生新的构象表位,为含有pNO_2Phe蛋白成为自体疫苗的设计提供了理论上的可行性。 展开更多
关键词 纳米分子动力学(NAMD) 可视化分子动力学(VMD) 分子动力学模似 CHARMM L-对硝基苯丙氨酸 B淋巴细胞刺激因子
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含对硝基苯丙氨酸的B淋巴细胞刺激因子疫苗对狼疮肾炎模型小鼠的保护作用 被引量:2
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作者 戴辉腾 田浤 +4 位作者 黄捷 陈超 蔡棣 高向东 姚文兵 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期483-489,共7页
考察含对硝基苯丙氨酸的B淋巴细胞刺激因子(BAFF)治疗BAFF过表达的自身免疫性疾病的效果。利用本研究前期构建的工程菌,表达纯化了B淋巴细胞刺激因子的可溶型突变体(sm BAFF)以及在其65位定点引入了对硝基苯丙氨酸的改构体(pNO_2Phe^(65... 考察含对硝基苯丙氨酸的B淋巴细胞刺激因子(BAFF)治疗BAFF过表达的自身免疫性疾病的效果。利用本研究前期构建的工程菌,表达纯化了B淋巴细胞刺激因子的可溶型突变体(sm BAFF)以及在其65位定点引入了对硝基苯丙氨酸的改构体(pNO_2Phe^(65)sm BAFF)。通过考察pNO_2Phe^(65)sm BAFF体外促小鼠淋巴细胞增殖活性、免疫原性以及所诱导的抗血清对天然BAFF活性的抑制作用,评价了其用于治疗BAFF过表达的自身免疫性疾病的可行性;同时采用了cGVHD(graft-versus-host disease)诱导的狼疮肾炎小鼠模型评价了pNO_2Phe^(65)sm BAFF的药理活性。结果表明:定点引入了对硝基苯丙氨酸的pNO_2Phe^(65)sm BAFF不具有促进小鼠淋巴细胞增殖的能力;由于对硝基苯丙氨酸的引入显著增强了蛋白的免疫原性,诱导机体产生了可以抑制天然BAFF活性的交叉抗体;在cGVHD诱导的狼疮肾炎小鼠模型中,pNO_2Phe^(65)sm BAFF可显著减轻疾病症状。定点引入了对硝基苯丙氨酸的pNO_2Phe^(65)sm BAFF可以作为治疗BAFF过表达的自身免疫性疾病的候选分子。 展开更多
关键词 B淋巴细胞刺激因子 对硝基苯丙氨酸 免疫原性 CGVHD
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认真整治环境切实转换机制——搞活国营汽运企业途径初探
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作者 蔡棣 邱以海 《广东公路交通》 1992年第2期37-40,共4页
增强国营大中型企业的活力,是当前经济体制改革的一项突出任务。所谓活为,就运输企业而言,主要是指企业的市场竞争力,更新改造能力和凝聚力。以目前国营汽运企业的状况来看,普遍是活力不足,困难重重,前景可忧,如何去搞活这些企... 增强国营大中型企业的活力,是当前经济体制改革的一项突出任务。所谓活为,就运输企业而言,主要是指企业的市场竞争力,更新改造能力和凝聚力。以目前国营汽运企业的状况来看,普遍是活力不足,困难重重,前景可忧,如何去搞活这些企业呢?本文试就肇庆市国营汽运企业的实际情况,谈一点粗线的看法,供专家、同行们共同商讨。 展开更多
关键词 运输企业 转换机制 大中型企业 经济体制改革 市场竞争力 同行 肇庆市 途径 初探 实际
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向管理要效益 以稳定求发展
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作者 蔡棣 邱以海 《广东公路交通》 1991年第2期72-74,共3页
关键词 公路运输企业 企业管理 资产管理 运输成本 经营承包 企业改革 企业素质 生产结构调整
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治疗自身免疫性疾病的抗细胞因子疫苗
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作者 陈超 蔡棣 +1 位作者 田浤 高向东 《药学进展》 CAS 2014年第6期426-431,共6页
抗细胞因子疫苗是针对疾病相关细胞因子而设计与构建的一类能激发体液免疫应答的主动免疫治疗性疫苗,是用于自身免疫性疾病的一种极具潜力的新型疗法。目前研究与开发的抗细胞因子疫苗主要有2种类型,一种是通过偶联载体或直接修饰为细... 抗细胞因子疫苗是针对疾病相关细胞因子而设计与构建的一类能激发体液免疫应答的主动免疫治疗性疫苗,是用于自身免疫性疾病的一种极具潜力的新型疗法。目前研究与开发的抗细胞因子疫苗主要有2种类型,一种是通过偶联载体或直接修饰为细胞因子引入外源表位而构建的蛋白疫苗,另一种则是可表达细胞因子免疫原的核酸疫苗。这两类疫苗在临床前及临床研究中,对各种自身免疫性疾病均显现出治疗活性。简介各类抗细胞因子疫苗及其作用机制,综述用于治疗类风湿性关节炎、多发性硬化症、系统性红斑狼疮等各种自身免疫性疾病的抗细胞因子疫苗研究进展。 展开更多
关键词 细胞因子 外源表位 主动免疫 疫苗 自身免疫性疾病
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