广西北部湾局部海域海洋沉积物细菌多样性及生物活性评估

为有效探究海洋新型天然微生物资源,本研究以广西北部湾局部海域海洋沉积物样品为研究对象,采用高通量测序技术和纯培养分离方法分析海洋沉积物样品中细菌群落组成及多样性,利用双层琼脂扩散法检测纯培养菌株的抗菌活性,通过PCR扩增法筛选基因组中含有7种功能基因的阳性菌株。高通量测序结果显示:海洋沉积物中检测到1407个操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs);在门水平上,变形菌门(Proteobacteria)的物种丰度最高,其次是厚壁菌门(Firmicutes)和酸杆菌门(Acidobacteria)。纯培养分离纯化鉴定出278株菌,分布在3门5纲16目24科31属,其中YIM 150853为1个潜在新分离单元。生物活性评估实验表明,76.34%的纯培养菌株至少对1种指示菌有抑制作用,其中链霉菌YIM 150601、YIM 150634抑菌谱广、抑菌活性强,放线菌的功能基因检出率高于非放线菌。广西北部湾局部海域海洋沉积物中蕴藏着丰富的细菌资源,纯培养菌株具有抗菌及合成生物活性产物的潜力,是开发新型天然产物的新菌源。

广西北部湾石角红树林根际红酵母的筛选鉴定,基因组分析及细胞组成测定

对广西北部湾石角红树林根际微生物群落中的红酵母(Rhodotorula)进行筛选、分离和鉴定,得到3株红酵母菌株(B1、B5、B6),通过真菌核糖体基因转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)测序比对和系统发育分析,并结合菌落形态,判定3株筛选得到的红酵母均属于胶红酵母(Rhodotorula mucilaginosa)。使用Illumina Novaseq测序平台对菌株B1基因组进行测序分析,对得到的全基因组序列进行基因注释,并构建全基因组图谱。同时,利用antiSMASH注释和分析了胶红酵母基因组中次生代谢产物生物合成基因簇之间的差异。对胶红酵母菌株B1的细胞组分进行了分析,结果显示其含有多种脂肪酸,其中油酸含量最高,占总脂肪酸的52.00%,检测到16种氨基酸,其中谷氨酸含量大,占总氨基酸的17.49%,同时含有β-胡萝卜素和1种未鉴定色素。