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辣椒miR169家族在非生物胁迫下的表达及启动子顺式作用元件分析
被引量:
1
1
作者
黄渺
宋泽洋
+2 位作者
蔡骏一
南红
肇瑾
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2023年第1期165-174,共10页
miRNA169(miR169)是植物中保守且规模较大的一类miRNA基因家族,其在非生物胁迫下的功能被广泛报道。为深入研究辣椒miR169基因家族(Can-miR169)在非生物胁迫下的表达及上游转录调控机制,以‘遵辣一号’(Zunla-1)为研究对象,利用生物信...
miRNA169(miR169)是植物中保守且规模较大的一类miRNA基因家族,其在非生物胁迫下的功能被广泛报道。为深入研究辣椒miR169基因家族(Can-miR169)在非生物胁迫下的表达及上游转录调控机制,以‘遵辣一号’(Zunla-1)为研究对象,利用生物信息学手段分析辣椒与其他植物miR169成熟体和前体保守性和进化关系。采用real-time PCR技术对干旱、低温、高盐、高温胁迫下辣椒miR169基因家族前体进行应答检测。克隆辣椒Can-miR169基因家族12个成员启动子,进行顺式作用元件预测及元件功能验证。结果显示:(1)miR169成熟体在植物中保守性强。(2)4种非生物胁迫下,辣椒miR169家族成员前体表达量相对于对照组差异显著。(3)成功克隆了Can-miR169基因家族12个启动子,顺式作用元件预测其家族启动子中含有大量与非生物胁迫相关的元件,如MYB、MYC、MBS、ABRE、LTR、DRE等。(4)经验证明,这些元件为干旱、低温、高盐等胁迫应答元件。本研究结果为进一步挖掘非生物胁迫下调控Can-miR169的转录因子,明确其上游调控机制提供新信息,为辣椒分子育种及品种改良提供新视野。
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关键词
辣椒
miR169家族
启动子
非生物胁迫
顺式作用元件
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职称材料
题名
辣椒miR169家族在非生物胁迫下的表达及启动子顺式作用元件分析
被引量:
1
1
作者
黄渺
宋泽洋
蔡骏一
南红
肇瑾
机构
贵州大学农学院
出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2023年第1期165-174,共10页
基金
国家自然科学基金地区基金(32260799)
贵州省科技厅一般基金项目(黔科合基础[2021]1Y11210)
贵州大学培育项目(贵大培育[2019]42号)。
文摘
miRNA169(miR169)是植物中保守且规模较大的一类miRNA基因家族,其在非生物胁迫下的功能被广泛报道。为深入研究辣椒miR169基因家族(Can-miR169)在非生物胁迫下的表达及上游转录调控机制,以‘遵辣一号’(Zunla-1)为研究对象,利用生物信息学手段分析辣椒与其他植物miR169成熟体和前体保守性和进化关系。采用real-time PCR技术对干旱、低温、高盐、高温胁迫下辣椒miR169基因家族前体进行应答检测。克隆辣椒Can-miR169基因家族12个成员启动子,进行顺式作用元件预测及元件功能验证。结果显示:(1)miR169成熟体在植物中保守性强。(2)4种非生物胁迫下,辣椒miR169家族成员前体表达量相对于对照组差异显著。(3)成功克隆了Can-miR169基因家族12个启动子,顺式作用元件预测其家族启动子中含有大量与非生物胁迫相关的元件,如MYB、MYC、MBS、ABRE、LTR、DRE等。(4)经验证明,这些元件为干旱、低温、高盐等胁迫应答元件。本研究结果为进一步挖掘非生物胁迫下调控Can-miR169的转录因子,明确其上游调控机制提供新信息,为辣椒分子育种及品种改良提供新视野。
关键词
辣椒
miR169家族
启动子
非生物胁迫
顺式作用元件
Keywords
Capsicum annuum L.
miR169 family
promoter
abiotic stress
cis-acting elements
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
辣椒miR169家族在非生物胁迫下的表达及启动子顺式作用元件分析
黄渺
宋泽洋
蔡骏一
南红
肇瑾
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2023
1
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