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甘肃省部分地区2020-2021年新报告HIV/AIDS患者治前耐药及分子传播网络特征分析
被引量:
7
1
作者
乔瑞娟
张林才
+4 位作者
冯毅
屠爱霞
王晓蕊
石林
蔺续霞
《中国艾滋病性病》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期860-865,共6页
目的分析甘肃省部分地区新报告HIV/AIDS患者分子传播网络特征,为精准干预相关人群中HIV-1传播提供实验室依据。方法反转录和巢式PCR扩增样本pol区基因并测序,采用MEGA 7.0软件构建系统进化树分析亚型,通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库...
目的分析甘肃省部分地区新报告HIV/AIDS患者分子传播网络特征,为精准干预相关人群中HIV-1传播提供实验室依据。方法反转录和巢式PCR扩增样本pol区基因并测序,采用MEGA 7.0软件构建系统进化树分析亚型,通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线软件工具分析耐药突变位点,Hyphy和Cytoscape 3.9.1软件生成分子网络,Logistic回归模型对入网率的影响因素进行分析。结果收集甘肃省部分地区2020-2021年新报告病例血浆样本331份,成功获得pol区基因序列303条,共发现11种亚型和流行重组型,主要为CRF07_BC(58.1%)、CRF01_AE(21.1%)、B(6.9%)和CRF55_01B(5.3%)。治疗前耐药率为4.0%,NNRTI类耐药率最高为3.3%,主要耐药位点是K103 N/S(1.7%)。分子网络最适基因距离为1.2%,在此基因距离时共形成33个分子簇,91条序列入网,入网率为30.0%。对进入网络的影响因素进行分析,多因素Logistic回归结果显示,CRF07_BC(与CRF01_AE相比)、河西地区(与陇东南地区相比)更容易进入网络。结论甘肃省部分地区新报告HIV/AIDS患者治疗前耐药率仍处低水平。HIV-1分子传播簇内的毒株呈现地区聚集性,应加强性伴追踪和针对性干预,有效遏制艾滋病的传播。
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关键词
艾滋病病毒
耐药
分子传播网络
原文传递
题名
甘肃省部分地区2020-2021年新报告HIV/AIDS患者治前耐药及分子传播网络特征分析
被引量:
7
1
作者
乔瑞娟
张林才
冯毅
屠爱霞
王晓蕊
石林
蔺续霞
机构
甘肃省疾病预防控制中心
中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心
出处
《中国艾滋病性病》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期860-865,共6页
基金
2020年甘肃省卫生行业科研计划项目(GSWSKY2020-22)
2020年甘肃省第十批省级科技计划项目(20JR10RA418)。
文摘
目的分析甘肃省部分地区新报告HIV/AIDS患者分子传播网络特征,为精准干预相关人群中HIV-1传播提供实验室依据。方法反转录和巢式PCR扩增样本pol区基因并测序,采用MEGA 7.0软件构建系统进化树分析亚型,通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线软件工具分析耐药突变位点,Hyphy和Cytoscape 3.9.1软件生成分子网络,Logistic回归模型对入网率的影响因素进行分析。结果收集甘肃省部分地区2020-2021年新报告病例血浆样本331份,成功获得pol区基因序列303条,共发现11种亚型和流行重组型,主要为CRF07_BC(58.1%)、CRF01_AE(21.1%)、B(6.9%)和CRF55_01B(5.3%)。治疗前耐药率为4.0%,NNRTI类耐药率最高为3.3%,主要耐药位点是K103 N/S(1.7%)。分子网络最适基因距离为1.2%,在此基因距离时共形成33个分子簇,91条序列入网,入网率为30.0%。对进入网络的影响因素进行分析,多因素Logistic回归结果显示,CRF07_BC(与CRF01_AE相比)、河西地区(与陇东南地区相比)更容易进入网络。结论甘肃省部分地区新报告HIV/AIDS患者治疗前耐药率仍处低水平。HIV-1分子传播簇内的毒株呈现地区聚集性,应加强性伴追踪和针对性干预,有效遏制艾滋病的传播。
关键词
艾滋病病毒
耐药
分子传播网络
Keywords
HIV
molecular transmission networks
drug resistance
分类号
R373.9 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘肃省部分地区2020-2021年新报告HIV/AIDS患者治前耐药及分子传播网络特征分析
乔瑞娟
张林才
冯毅
屠爱霞
王晓蕊
石林
蔺续霞
《中国艾滋病性病》
CAS
CSCD
北大核心
2023
7
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