基于稀疏自编码的多维数据去重聚类算法分析

随着科技信息的不断发展,数据量与数据类型与日俱增,针对数据集维度高、重复数据多导致有效信息提取复杂的问题,提出基于改进稀疏自编码器的多维数据聚类算法。算法分为数据处理与聚类分析两大部分,数据处理时首先利用S-SAE中逐层贪婪的原理将高维数据集降维至每组6维的数据集;接着采用映射值匹配机制对降维后的数据集进行重复数据清洗处理,被清洗的值用0替代;然后将处理好的数据投入到K-Means++聚类算法中进行聚类分析;最终构建出TS-SAE-K-Means++多维数据聚类模型,并通过最优化分析得出其最优化参数设置情况。通过对不同基线组合算法的仿真对比分析表明,TS-SAE-K-Means++在聚类轮廓系数S与模型特征值F1评价体系中均优于其它算法组合。这表明提出的算法在解决高维数据内有效信息提取的问题上具有一定的优越性。

基于云计算的线上商品智能推荐系统设计与应用

受用户行为和商品属性的影响,线上商品推荐的可靠性难以得到保障,为此,设计基于云计算的线上商品智能推荐系统。将密集计算型ic5云服务器作为系统的硬件装置;在软件设计阶段,利用云计算技术对用户行为进行综合分析,并将其与商品属性进行匹配分析,确定最终的推荐结果。应用测试结果显示,该系统在不同数据集上的接受者操作特性曲线下面积(Area Under Curve,AUC)表现出了较高的稳定性,且均在0.88以上,表明该系统具有较高的应用价值。

激光点云数据离群点删除下的多视点场景虚拟重构

单纯的激光扫描技术在现实场景虚拟重构时,有效点云数据过少,坐标均衡性较差,混乱坐标较多。为提高虚拟现实重构精度,设计基于激光点云离群点删除的多视点场景虚拟重构方法。提取多视点场景激光点云数据,包括激光数据角点特征提取,以及视觉数据角点特征提取。设置离群阈值,计算三维坐标轴中非离群点数据集所包含的空间长度,设置离群点坐标栅格结构。通过点激光云数据提取值,计算移除离群点前后点云数据之间的平均距离,完成无用数据移除,实现虚拟重构。实验结果可知:移除前后平均距离差距显著,可见离群点的移除对虚拟现实重构技术有明显作用;在使用所提方法得到的虚拟现实重构场景中,可以得到明显的房间轮廓,且大型物体重构影像也十分清晰。

不同保存条件对组织样本总RNA提取的影响

RNA是重要的生物医学研究对象,分离获得质量合格的RNA是研究RNA生物学功能的重要前提[1]。目前常用的RNA检测方法,如实时定量PCR、Northern blot、转录组测序等,都对RNA的质量有很高的要求。真核生物体内的RNA多以单链形式存在,稳定性较差,容易在样本采集、预处理和存储过程中发生降解[2]。

浅谈“创客教育”下的小学信息技术教学实践

“创客教育理念渗透于教学实践”,小学信息技术课程教学迎来发展学生创客素养的良好契机。在创客思想引导下,计算机教学可以实现以学生兴趣为方向,培养学生创新、合作、实践意识,优化传统育人模式机制,满足新课程建设要求,为学生学科素养技能的发展打下基础。基于此,本文将围绕小学信息技术发展学生创客素养来展开论述。

大数据RSA公钥加密安全双向检测仿真

大数据中心的数据量巨大,存储方法通常为分布式存储,导致数据保护方法相对简单,黑客易利用相关漏洞窃取关键信息。且大部分数据隐私保护技术是针对单向静态数据的,因此如何有效地应对大数据动态风险问题是当前最为关键的问题之一。提出基于RSA公钥加密的大数据安全性双向检测方法。设计RSA公钥加密机制,通过用户的安全需求度选择不同的数据安全度,以满足各个等级的大数据安全需求。基于分类算法评价指标,引入动态选择算法,并将评价指标聚类成簇,利用精确度选择各个簇中的最优算法。确定权重取值,通过距离函数将不同权值组合处理形成组合权值,将其代入加权投票算法,最终获取大数据安全性双向检测结果。实验结果证明:对多类别大数据的安全性双向检测,研究方法的检测率高达98%,且误报率低于0.4%,约登指数接近0.9,以上所得实验数据均表明研究方法具有应用优势,实用性更强。

报告基因的选择及其研究趋向

报告基因是一种编码某种易于检测蛋白质或酶的基因,通过它的表达产物来标定目的基因的表达调控。由于具有灵敏度高、检测方便等特点,报告基因技术在转基因、启动子分析以及药物筛选等领域有了广泛的应用。近年来,随着荧光分析方法和技术的进步,荧光素酶和绿色荧光蛋白成为众多报告基因中的后起之秀,本文以这两个报告基因为重点,综述了报告基因的特点、应用、近年来的进展以及未来发展方向。

Sp1和Sp3介导的转录调控

基本转录因子Sp1和Sp3对转录调控区GC盒有很强的亲和力,参与几乎所有细胞功能,包括细胞增殖、凋亡、分化和新生物的转化.但在同一细胞中Sp1和Sp3对不同基因的作用并不相同,二者对基因特异性的转录调控是Sp1和Sp3研究领域的重要问题.近年来发现,Sp1和Sp3自身表达水平、结合的靶序列、磷酸化、糖基化等翻译后修饰,其他蛋白质的结合以及染色质结构与修饰等方面均可影响Sp1和Sp3的转录活性.本文从Sp1和Sp3蛋白参与转录调节的机制以及影响其基因特异性转录活性的诸方面因素这两大侧面,介绍了近年来的最新进展.

临床生物样本库管理系统建设与应用

临床生物样本作为国家战略性资源一直受到广泛重视[1]。样本库信息管理系统对于实体生物样本和样本关联临床信息的管理至关重要。临床样本合法规范的管理可以有效地促进基于样本的下游科学研究[2]。但目前各地生物样本库的信息管理系统缺乏统一的模式,功能模块也各不相同,因此不利于后续的开放共享。北京大学第三医院生物样本库以样本科学为导向建设信息管理系统,系统中不仅记录生物样本库中存储的生物材料包括离体器官、组织、细胞、血液、分泌物、排泄物及其衍生的生物大分子等样本信息,同时兼顾生物样本关联患者的诊疗信息、护理、病理、随访、伦理审批、知情同意等数据及图像信息[3-4](图1)。该系统在样本库运行过程中,根据需要不断完善与添加模块,集成医院数据中心(hospital data repository,HDR)实现临床治疗信息的规范化收集,对生物样本库管理系统实现了生物样本的质量控制,有效准确地追踪样本实体从产生到应用的全过程,实现全闭环管理,形成完整的样本全生命周期管理的标准化流程,提升了生物样本的科研价值。此文旨在介绍北医三院生物样本库管理系统建设情况及应用案例,以期为其他样本库的建设提供参考借鉴。

基于密度可达的多密度聚类算法

为对多密度数据集聚类,提出一种基于密度可达的多密度聚类算法。使用网格划分技术来提高计算每个点密度值的效率,每次聚类都是从最高密度点开始,根据密度可达的概念和广度优先的策略逐步向外扩展进行聚类。实验表明,该算法能够有效地对任意形状、大小的均匀数据集和多密度数据集进行聚类,并能较好地识别出孤立点和噪声,其精度和效率优于SNN算法。

共转染技术在基因表达与功能方面的应用

共转染是将两个基因一同转染至宿主细胞的过程,共转染技术在研究基因的表达、转录调控以及基因治疗等方面有广泛的应用。本文简述了共转染在上述几方面的应用以及该过程中一些需注意的问题,并与单独转染进行了比较,同时也指出了目前存在的问题及改进方法。

转录因子HOXA5在乳腺癌细胞中的下游信号通路

目的探究转录因子HOXA5在乳腺癌进展中的作用。方法构建过表达HOXA5的稳定转染BT549和SUM159细胞系,在稳转BT549细胞系中利用Transwell检测细胞的转移能力;Western blotting检测上皮-间质转化(EMT)相关蛋白表达水平的变化;平板克隆实验检测细胞的增殖能力;转录组测序技术(RNA-seq)进一步分析HOXA5的调控基因,利用软件Cluster 3.0,Tree View和DAVID生物信息数据库(DAVID Bioinformatics Resources)以及Enrichr分析京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路,绘制热图(heatmap)。结果 BT549细胞系中,稳定转染HOXA5后的实验组细胞迁移能力显著降低(P<0.001),且上皮标志物E-cadherin蛋白表达水平显著上调,间质标志物N-cadherin,Twist1、Slug蛋白表达水平显著下调;平板克隆结果表明,实验组形成的克隆数目明显减少(P<0.05),克隆大小明显降低。结论 HOXA5通过促进细胞由间质向上皮转化,抑制乳腺癌细胞迁移,并且抑制细胞增殖;HOXA5通过调节糖脂代谢途径调节癌细胞增殖,并且还通过调节细胞运动和黏附相关的基因抑制肿瘤细胞的迁移,通过肿瘤坏死因子(TNF)信号通路发挥抗肿瘤作用。总之,转录因子HOXA5对乳腺癌的发展和恶化起着显著的抑制作用。

miR-31通过激活NF-κB信号通路而促进结肠癌细胞增殖

微小RNA(microRNA)在肿瘤的发生发展中发挥重要作用。有研究表明,在结肠癌患者肿瘤组织中,miR-31表达水平增高。然而,定量PCR只能检测所在组织miR-31的整体表达水平,而无法观察miR-31在特定组织与特定细胞中的表达分布。目前,尚未见关于miR-31在结肠癌中原位表达的报道。本文从研究miR-31在结肠癌中的原位表达入手,进一步探究miR-31在结肠癌细胞中的功能及作用机制。原位杂交实验结果显示,miR-31在结肠癌肿瘤细胞中的原位表达明显升高;体外过表达或敲减miR-31证实,其可以促进结肠癌细胞增殖和集落形成;荧光定量PCR与Western印迹和双荧光素酶报告基因实验证实,在结肠癌细胞中,NF-κB通路的抑制因子丝氨酸/苏氨酸激酶40(STK40)是miR-31下游靶基因,miR-31靶向作用于STK40而激活NF-κB通路;反之,抑制NF-κB通路,miR-31的促增殖能力明显下降。上述结果提示,miR-31可能通过激活NF-κB信号通路而促进结肠癌的细胞增殖。

Polycomb蛋白复合体对细胞衰老的表观遗传学调控

细胞衰老在表观遗传学上的调控越来越受到人们的关注.Polycomb蛋白复合体(polycombgroup proteins)通过对组蛋白的修饰,尤其是甲基化修饰发挥对靶基因的沉默作用,并因此广泛参与到发育、增殖、分化以及肿瘤发生等重要生命过程.目前,有一系列的研究报道了polycomb的各组份参与了细胞衰老的调控.本文对polycomb发挥基因沉默作用机制的最新研究进展进行了归纳总结,并以衰老过程中的重要分子p16为重点,详细介绍了polycomb调节p16表达,影响细胞衰老进程的机制.研究表明,多种polycomb成员同时结合在p16INK4a基因座,它们的结合表现出相互依赖的同时又有各自的作用.这为进一步深入理解细胞衰老提供了表观遗传学的证据.

2010—2014年度国家自然科学基金“康复医学”领域项目申请和资助情况分析

康复医学是一门相对年轻的新兴学科,是现代医学的重要组成部分.国家自然科学基金委员会（National Natural Science Foundation of China,NSFC）十分重视对康复医学基础研究的支持和引导,尤其是2009年9月成立医学科学部以来,专门设立一级代码H17管理康复医学领域的项目受理和资助.现阶段国家自然科学基金（以下简称科学基金）项目指南规定：康复医学主要资助运动系统、神经系统及其他系统疾病所致功能障碍的康复机制,以及临床康复评价、治疗的科学问题研究.医学科学部自2010年开始正式受理康复医学（H17）各类基金项目申请,至2014年的5年里,共受理各类项目申请1028项,资助179项.本文就2010-2014年度科学基金康复医学领域项目受理与资助情况进行回顾.

电离辐射对HelaS_3细胞凋亡与细胞周期的影响

研究了电离辐射对HelaS3 细胞凋亡和细胞周期的影响 ,进一步探讨细胞凋亡与细胞周期的关系 ,为肿瘤放化疗方案的制定提供基础资料。采用PI、Hoechst33342双染和PI单染 ,用流式细胞术检测细胞凋亡和细胞周期。结果表明 ,给予 0 .5 - 4 .0GyX射线照射后 8h细胞凋亡开始增加 ,12h达最大值 ,12 - 2 4h有下降趋势 ,但 2 4h开始又逐渐增加 ,到 72h时又接近 12h水平。S期和G2 /M期细胞均明显增加 ,并呈剂量依赖性 ,G0 /G1期细胞则呈剂量依赖性减少 ,且这种变化在受照射后 2 4h最明显。说明一定剂量电离辐射可以诱导明显的G2 /M阻滞和S期阻滞 ,并可诱导HelaS3 细胞凋亡的产生 ,两者之间有一定的关系。

一种新型SUMO E3连接酶CBX4的化学修饰作用

多梳蛋白家族(polycomb group proteins,Pc G)是一类在染色质水平上通过表观遗传修饰抑制靶基因转录的调节因子,它在调节细胞周期、DNA修复、细胞分化、衰老和死亡中起到重要作用。CBX4作为Pc G家族中唯一具有SUMO E3连接酶活性的成员,可以作用于多种底物,包括HIPK2、SIP1、Ct BP、CTCF、Dnmt3a和HIF-1α等。底物的SUMO化修饰依赖于特定的结构基础,而且SUMO化的底物功能也会相应发生改变。同时,CBX4还可以被其它分子,如HIPK2,SENP2等进行磷酸化以及去SUMO化等修饰。本篇综述详细阐述了CBX4对底物的SUMO化修饰、自身被修饰及其生物学功能的变化。

参与细胞衰老的蛋白质结构域

大多数正常体细胞有有限的复制周期,并最终进入生长停滞状态被称为复制性衰老.迄今比较公认的3条细胞衰老信号转导途径是:p16INK4a/Rb、p19ARF/p53/p21Waf1以及PTEN/p27.目前发现,在基因转录水平上,有些转录因子的结构域对调节p16INK4a、p53/p21Waf1以及p27等与细胞衰老相关基因的表达有重要作用,如E2DBD、环指域(RINGfinger)等;其次,各条通路要发挥作用,必然要借助其上下游蛋白质的相互作用,其中结构域发挥了纽带作用.本文对其中某些蛋白质相互作用的结构域进行了描述.最后,还总结了其他一些参与细胞衰老的结构域.

浅谈SQL Server数据库中游标的使用

游标实际上提供了一种能对数据库中结果集进行逐条处理的方法,本文从游标使用应遵循的四个步骤对游标进行了详细的阐述,并通过综合应用进一步介绍了如何使用游标对数据遍历。