人类资源库生物安全概要及自检表单

根据经济合作与发展组织(OECD)的定义,“生物样本库是一种集中保存各种人类生物材料,用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统”^([1])。

人类遗传资源保藏活动全流程成本核算的探讨

人类遗传资源是一种重要战略资源,具有重大的科学、社会与经济价值,对于基础理论探索以及实际应用发挥着重要作用,对于人们认识生命本质、探索疾病发生发展的原理和机制、研发疾病预防干预策略、促进人口健康也具有重要意义。我国在未来巨大的新药开发和医疗保健领域中能否获得更多的自主知识产权,很重要的一个方面与能否有效地收集、保护并开发利用我国宝贵的人类遗传资源密切相关。

冻存温度、冻融次数和冻存时间对血清生化指标稳定性的影响

目的分析在生物样本库中,冻存温度、冻存时间及反复冻融效应对血清常规生化指标的影响,以探讨血清常规生化指标在生物样本库中的稳定性。方法以2014年7月江苏省泰兴市人民医院160例健康体检者为研究对象,取空腹静脉血制备混合血清。24 h内检测新鲜混合血清的12项常规生化指标作为基准值。将混合血清样本随机分组:A组贮存于-20℃,B组、C组、D组、E组均贮存于-80℃,其中C组、D组、E组分别于冻存开始的1、5、10 d内,每天进行一次冻融处理。在第1,3,5,7,9个月时进行重复检测。运用配对t检验比较各时点检测值与基准值的差异,运用线性混合效应模型分析冻存温度、冻融循环次数、冻存时间效应对各指标含量稳定性的影响。结果 9个月的冻存中,12项生化指标的含量均不稳定。导致含量不稳定的因素有冻存温度、反复冻融次数、冻存时间,冻存温度、冻融次数与冻存时间分别产生的交互效应。结论血清样本不宜在生物样本库中冻存,应选择新鲜样本进行血清常规生化指标的检测,否则会降低检测结果的准确性。

肠道微生物测序研究中不同实验来源差异的综合评价以及应用

肠道微生物测序研究具有将微生物结果转化为人类健康的巨大潜力。16S扩增子测序和宏基因组鸟枪测序(whole-metagenome shotgun,WMS)是微生物组研究中的两大主要方法,各具优势。然而,研究样品的异质性、测序仪和文库制备方法的差异如何影响肠道微生物测序结果的可重复性仍有待深入研究。该研究旨在通过比较粪便样本中微生物组成的差异,为测序技术的选择提供参考标准。3种广泛采用的测序仪的结果显示,WMS法中技术重复相关性(r=0.94)较高,而生物学重复相关性(r=0.69)较低。Bray-Curtis距离表明,生物学重复的差异大于技术重复(P<0.001)。此外,16S和WMS数据集间具有明显的分类学图谱差异。研究结果表明,同质化是样品DNA提取前的一个必要步骤;测序仪对分类学变异的贡献小于文库制备方法。我们开发了经验贝叶斯方法,即在计算中“借用信息”,利用标准化数据和(非)参数先验分布分析批次效应参数,提高了16S和WMS之间的群体可比性,为进一步应用于融合分析已发表的16S和微生物数据集提供了依据。

生物样本库知情同意书规范化设计

知情同意书的签署是生物样本库伦理建设的核心,其结构包括"知情告知"和"自主同意"两部分主体内容。本文依据现阶段生物样本库的特点,提出生物样本库知情同意书的规范化设计,具体描述从"生物样本库完备告知"到"捐赠者充分知情"两部分核心内容和要求,以供生物样本库实践者参考和借鉴。

如何做好我国少数民族人群遗传资源样本采集的知情同意

我国人口资源丰富,环境异质性强,各民族人群从体质特征到生理数据、从遗传表型到基因型均丰富多样,为开展地方疾病、家族谱系疾病、人群迁移以及基因人类学研究提供了最好资源。在进行人类遗传资源研究之前,基于伦理学原则,按照相关行政管理程序,做好人类遗传资源样本采集知情同意非常重要。然而,少数民族文化习俗、知识背景、民族信仰等因素的差别,给人类遗传资源样本采集知情同意的签署带来了挑战。本文就开展我国少数民族地区人群遗传资源样本采集时,有关知情同意书签署应该注意的问题进行阐述,主要包括知情同意模式选择、少数民族知情同意的程序、知情同意应充分考虑民族文化的特性和相关禁忌等内容,以供科研工作者借鉴。