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Notch4 mRNA在口咽鳞癌组织中表达变化及其敲降癌细胞株增殖迁移侵袭能力观察
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作者 薛绪亭 张宇良 +3 位作者 郑希望 董振 刘红亮 张春明 《山东医药》 CAS 2024年第3期1-5,共5页
目的 观察Notch4 mRNA在口咽鳞癌组织和细胞株中的表达变化及敲降Notch4 mRNA表达的口咽鳞癌细胞株增殖、迁移和侵袭能力。方法 收集12对口咽鳞癌组织与癌旁组织,采用RT-q PCR法检测癌组织、癌旁组织中Notch4 mRNA。培养口咽鳞癌细胞株D... 目的 观察Notch4 mRNA在口咽鳞癌组织和细胞株中的表达变化及敲降Notch4 mRNA表达的口咽鳞癌细胞株增殖、迁移和侵袭能力。方法 收集12对口咽鳞癌组织与癌旁组织,采用RT-q PCR法检测癌组织、癌旁组织中Notch4 mRNA。培养口咽鳞癌细胞株Detroit 562、WSU-HN-30及对照细胞株Ha CaT、2BS,检测细胞株中Notch4 mRNA。将人口咽鳞癌细胞株Detroit 562和WSU-HN-30随机分为si-NC组、si-Notch4-1组和si-Notch4-2组,分别转染si-NC双链核苷酸、si-Notch4-1双链核苷酸、si-Notch4-2双链核苷酸,检测各组细胞株中Notch4 mRNA,使用RTCA法观察各组细胞株的增殖能力(CI值),通过Transwell实验观察各组细胞株的侵袭和迁移能力。结果 与癌旁组织相比,口咽鳞癌组织中Notch4 mRNA相对表达量高(P<0.01);在对照细胞株Ha CaT和2BS中Notch4 mRNA相对表达量差异无统计学意义;与对照细胞株Ha CaT相比,口咽鳞癌细胞株Detroit 562、WSU-HN-30中Notch4 mRNA相对表达量高(P均<0.001)。在口咽鳞癌细胞株Detroit 562、WSU-HN-30中,与si-NC组相比,si-Notch4-1和si-Notch4-2组的细胞株增殖、迁移和侵袭能力降低(P均<0.01)。结论 Notch4 mRNA在口咽鳞癌组织和细胞株中均高表达,敲降Notch4 mRNA表达的口咽鳞癌细胞株增殖、迁移和侵袭能力降低。 展开更多
关键词 Notch家族跨膜受体 口咽鳞状细胞癌 细胞增殖 细胞迁移 细胞侵袭
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基于生物信息学方法的喉鳞癌相分离相关基因调控机制分型分析与预后预测模型构建
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作者 郑希望 薛绪亭 +5 位作者 郭慧娜 张宇良 牛敏 张春明 吴勇延 高伟 《山东医药》 CAS 2023年第2期6-10,共5页
目的根据喉鳞癌患者转录组数据和临床参数,分析喉鳞癌相分离相关基因调控机制分型,并建立用于预测喉鳞癌患者生存时间的预后预测模型。方法从TCGA数据库下载111例喉鳞癌、12例正常组织转录组测序数据作为TCGA队列,以本实验室自有的107... 目的根据喉鳞癌患者转录组数据和临床参数,分析喉鳞癌相分离相关基因调控机制分型,并建立用于预测喉鳞癌患者生存时间的预后预测模型。方法从TCGA数据库下载111例喉鳞癌、12例正常组织转录组测序数据作为TCGA队列,以本实验室自有的107例喉鳞癌及其对应癌旁组织转录组测序数据作为自测队列,进行生物信息学分析。使用R语言DESeq2分析癌组织中的差异表达的相分离相关基因。使用GSEA Preranked算法对每例患者个体进行调控机制评分,使用一致性聚类对患者进行调控机制分子分型;使用STRING在线数据库构建相分离相关基因互作网络,使用cluster Profiler对相分离相关基因进行富集分析;使用Cox回归法从喉鳞癌表达差异的相分离相关基因中筛选与喉鳞癌患者生存时间相关的基因,以此建立喉鳞癌预后预测模型,采用Kaplan-Meier显示相分离相关基因对喉鳞癌患者生存时间的影响;使用LASSO算法构建相分离相关基因喉鳞癌患者预后预测模型。基于预后预测模型和喉鳞癌患者的临床参数构建诺莫图,评估预后预测模型对喉鳞癌患者生存时间的预测能力。结果从两个独立患者队列中共筛选出105个在喉鳞癌组织中呈显著差异表达的相分离相关基因。基于GSEA Preranked算法进行调控机制评分,将喉鳞癌患者分成3个具有不同调控机制的亚型。经过生存分析,13个相分离相关基因(TFRC、SLC7A5、CPEB3、PIMREG、KIF2C、SERPINH1、POU4F1、PRKAA2、SLC3A2、LGALS7B、PIWIL2、SPANXC和TUBB3)与喉鳞癌患者总生存率相关。预后预测模型公式为:0.2067×Ex_(TUBB3)+0.0530×Ex_(SPANXC)+(-0.0129)×Ex_(PIWIL2)+(-0.0897)×Ex_(LGALS7B)+0.1047×Ex_(SERPINH1)+(-0.1032)×Ex_(KIF2C)+(-0.0626)×Ex_(PIMREG)+(-0.1744)×Ex_(CPEB3)+0.1279×Ex_(TFRC)。根据模型对患者进行危险因子评分,将患者分为高、低风险组。高风险组总生存率低于低风险组(HR=5.47,95%CI为2.68~11.15,P<0.01);ROC曲线分析显示,模型风险评分预测喉鳞癌患者1、2、5年总生存率的AUC分别为0.650、0.794和0.727。高危险组无进展间隔率(HR=1.02,95%CI为1.00~1.04,P<0.05)和疾病特异性生存率(HR=1.02,95%CI为1.00~1.04,P<0.05)低于低危险组;ROC曲线分析显示,模型风险评分对喉鳞癌患者1、2、5年的无进展间隔率预测的AUC分别为0.697、0.687和0.71,对疾病特异性生存率预测的AUC分别为0.649、0.654和0.725。诺莫图决策曲线显示,预后预测模型对喉鳞癌患者生存时间具有良好的预测能力。结论喉鳞癌相分离相关基因调控机制可分为3种不同亚型;基于喉鳞癌组织中差异表达的相分离相关基因,成功构建了预后预测模型。 展开更多
关键词 相分离 预后预测模型 生物信息学 喉鳞癌
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棘孢木霉可湿性粉剂研制及杀菌活性测定 被引量:8
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作者 孙丽丽 曹传旺 +2 位作者 薛绪亭 王志英 杜春艳 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期45-52,共8页
以棘孢木霉分生孢子粉、发酵液冻干粉为有效成分制备混配杀菌剂。在测定助剂对棘孢木霉生物活性的基础上,利用正交试验设计法测定助剂对制剂性能的影响,进一步确定助剂种类和含量;通过机械粉碎法将棘孢木霉分生孢子粉、发酵液冻干粉... 以棘孢木霉分生孢子粉、发酵液冻干粉为有效成分制备混配杀菌剂。在测定助剂对棘孢木霉生物活性的基础上,利用正交试验设计法测定助剂对制剂性能的影响,进一步确定助剂种类和含量;通过机械粉碎法将棘孢木霉分生孢子粉、发酵液冻干粉与助剂混合配比加工成可湿性粉剂。室内离体试验法测定棘孢木霉分生孢子粉和发酵液冻干粉不同配比的制剂对油菜菌核病菌抑菌活性,获得最佳比例,并将其加工成可湿性粉剂。结果表明:棘孢木霉孢子粉和发酵液冻干粉可湿性粉剂最佳配比(质量比)为1:1,润湿分散剂为1%Morwet EFW、5%TERWET 1010、5%Morwet D425、7%木质素磺酸钙;紫外保护剂为0.3%纳米氧化锌,以硅藻土为载体补足100%。该配方可湿性粉剂的孢子萌发率为88.57%,质量悬浮率达81.79%,孢子悬浮率80.12%,润湿时间〈10s,平均粒径27μm,符合商品制剂的标准。室内生物测定结果表明,不同混配比例制剂均有一定的增效作用,但该配比可湿性粉剂增效作用最为显著,其中1600倍液对油菜菌核病菌防治效果比孢子粉、发酵液冻干粉单剂分别高21.67%和12.09%,抑制率范围为64.17%-88.67%。该制剂属于环境友好型绿色农药,为农林植物病害的生物防治提供了一种新生防材料。 展开更多
关键词 棘孢木霉 助剂筛选 毒力测定 可湿性粉剂
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表达LdCYP6B53果蝇品系建立及对杀虫剂的敏感性 被引量:2
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作者 薛绪亭 孙丽丽 +2 位作者 刘鹏 王志英 曹传旺 《中国农学通报》 2016年第19期97-101,共5页
旨在探索舞毒蛾CYP6B53基因对百树菊酯、溴氰菊酯、辛硫磷、氯虫苯甲酰胺4种杀虫剂的敏感性。通过转基因技术将LdCYP6B53基因转入果蝇体内,分别建立att P40>CYP6B53和VK5>CYP6B53转基因果蝇品系,并测定杀虫剂对转基因果蝇毒力。... 旨在探索舞毒蛾CYP6B53基因对百树菊酯、溴氰菊酯、辛硫磷、氯虫苯甲酰胺4种杀虫剂的敏感性。通过转基因技术将LdCYP6B53基因转入果蝇体内,分别建立att P40>CYP6B53和VK5>CYP6B53转基因果蝇品系,并测定杀虫剂对转基因果蝇毒力。限制性内切酶消化、RT-PCR和核酸序列测定表明转基因果蝇品系中稳定表达LdCYP6B53基因。与对照att P40、VK5果蝇品系相比,转基因果蝇品系att P40>CYP6B53和VK5>CYP6B53对百树菊酯的敏感性显著降低,LC50分别为对照组的1.83和1.61倍;而对溴氰菊酯敏感性显著增加,LC50分别为对照组的0.52和0.21倍;对辛硫磷和氯虫苯甲酰胺的敏感性与对照组差异不显著。本研究利用转基因技术成功构建了转舞毒蛾P450基因CYP6B53的果蝇品系att P40>CYP6B53和VK5>CYP6B53,可用于杀虫剂筛选,为LdCYP6B53功能研究提供了手段。 展开更多
关键词 转基因果蝇 舞毒蛾 CYP6B53基因 杀虫剂 敏感性
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科研综合智能管理系统的设计与实施 被引量:3
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作者 郑希望 吴勇延 +4 位作者 贾泽川 薛绪亭 牛敏 张宇良 高伟 《无线互联科技》 2021年第18期54-57,62,共5页
针对高校科研创新实验室在科研管理中存在信息孤岛,仪器、耗材和财务缺乏过程与动态管理,科研成果、荣誉和奖励缺乏整理、分析、评价与反馈手段等问题,该研究基于实验室日常科研管理经验,设计和实现了一套基于云服务器B/S架构的、通过... 针对高校科研创新实验室在科研管理中存在信息孤岛,仪器、耗材和财务缺乏过程与动态管理,科研成果、荣誉和奖励缺乏整理、分析、评价与反馈手段等问题,该研究基于实验室日常科研管理经验,设计和实现了一套基于云服务器B/S架构的、通过多层次设计实现的科研综合管理系统。该系统实现了对省级重点基础科研实验室科研业务的高效便捷管理,大幅度提高了科研运行效率,解放了人力、节约了财力。 展开更多
关键词 管理信息系统 科研管理系统 科研管理 实验室管理 B/S框架
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