枣TCP家族基因鉴定及其表达分析

为了揭示枣TCP基因家族在枣生长发育中的作用,本文利用枣全基因组数据库搜索TCP家族基因,对该类基因进行鉴定、染色体分布等生物信息学和表达分析。结果表明,枣TCP基因家族包含22个成员,蛋白长度范围为172~590个氨基酸,等电点为4.88~5.25,全部为亲水蛋白;其中15个基因分布在6条染色体上,5号染色体最多,有4个;聚类分析发现,该类基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ2类,ClassⅡ又分为CYC/TB1和CIN亚类;组织特异性表达分析表明,该类基因主要在叶、蕾、花和果中表达;同时,植原体侵染对该类基因的表达有显著影响。蛋白互作预测发现ZjTCP和其他蛋白以及同一家族蛋白内部之间均可以发生互作。本研究结果为进一步研究该类基因的功能提供了重要线索和依据。

枣E类MADS基因在花和果中的表达及其蛋白互作研究

以‘金丝小枣’花和果实为试材进行E类MADS-box基因的生物信息、表达、亚细胞定位及蛋白互作研究。3个E-type MADS-box基因分别位于SEP1/2、SEP3和SEP4进化支。与其他物种的同源序列相比,E类蛋白在进化中非常保守。3个E类基因在枣的花和果实中均有表达,ZjSEP1/2在花不同发育时期表达比较稳定,ZjSEP3和ZjSEP4在花发育前期高表达,在感染枣疯病的花变叶中3个基因的表达均显著受抑制。3个蛋白均定位于细胞核。酵母单杂交结果表明ZjSEP1/2和ZjSEP3具有转录激活活性,可以作为转录因子调控下游基因,而ZjSEP4不具有此活性。酵母双杂交结果表明3个E类MADS蛋白都可以和A类、C/D类蛋白发生互作,ZjSEP4与ZjSEP1/2均可与自身互作,但ZjSEP3自身不发生互作。综上,3个E类MADS基因在枣花发育中具有重要作用,但功能和调控模式不同,ZjSEP3不能形成同源二聚体,ZjSEP1/2、ZjSEP4均可形成同源二聚体,3个E类蛋白均可与A、C/D类蛋白形成异源二聚体。