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无色杆菌HZ01细胞色素P450的生物信息学分析
1
作者
洪跃辉
李文哲
+2 位作者
陈栋华
薛金满
王江海
《生物化工》
2019年第6期1-6,共6页
采用生物信息学方法分析无色杆菌HZ01细胞色素P450的理化参数、开放阅读框、系统进化树、亲疏水性、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构和蛋白功能域。结果表明,P450基因中最长的开放阅读框长度为2355 nt;序列中有较多区域表现出亲水性...
采用生物信息学方法分析无色杆菌HZ01细胞色素P450的理化参数、开放阅读框、系统进化树、亲疏水性、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构和蛋白功能域。结果表明,P450基因中最长的开放阅读框长度为2355 nt;序列中有较多区域表现出亲水性,不存在信号肽;与木糖氧化无色杆菌的P450亲缘关系较近。该P450可能是可溶的非跨膜蛋白;在其二级结构中,无规卷曲所占比例最高;根据三级结构模型推断该P450属于球状蛋白;预测出该P450含有2个低复杂区域。本研究揭示了无色杆菌HZ01细胞色素P450的基本性质,有助于后续进行更深入的研究,为该P450的应用奠定了基础。
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关键词
无色杆菌
细胞色素P450
生物信息学
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题名
无色杆菌HZ01细胞色素P450的生物信息学分析
1
作者
洪跃辉
李文哲
陈栋华
薛金满
王江海
机构
广东江门中医药职业学院
中山大学海洋科学学院
出处
《生物化工》
2019年第6期1-6,共6页
基金
广东省普通高校青年创新人才项目(2018GkQNCX050)
文摘
采用生物信息学方法分析无色杆菌HZ01细胞色素P450的理化参数、开放阅读框、系统进化树、亲疏水性、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构和蛋白功能域。结果表明,P450基因中最长的开放阅读框长度为2355 nt;序列中有较多区域表现出亲水性,不存在信号肽;与木糖氧化无色杆菌的P450亲缘关系较近。该P450可能是可溶的非跨膜蛋白;在其二级结构中,无规卷曲所占比例最高;根据三级结构模型推断该P450属于球状蛋白;预测出该P450含有2个低复杂区域。本研究揭示了无色杆菌HZ01细胞色素P450的基本性质,有助于后续进行更深入的研究,为该P450的应用奠定了基础。
关键词
无色杆菌
细胞色素P450
生物信息学
Keywords
Achromobacter
Cytochrome P450
Bioinformatics
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
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作者
出处
发文年
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操作
1
无色杆菌HZ01细胞色素P450的生物信息学分析
洪跃辉
李文哲
陈栋华
薛金满
王江海
《生物化工》
2019
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