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基于生物信息学分析血管抑制蛋白2在乳腺癌中的表达及临床意义
1
作者
王卫
王红丽
+5 位作者
阿力比亚提·艾尼
吴军
衣力亚尔·肉苏
阿依努尔
丁晓琴
杨亮
《中国医药科学》
2023年第12期13-17,共5页
目的基于生物信息学分析血管抑制蛋白2(VASH2)在乳腺癌(BC)中的表达和临床意义。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)联合基因组织表达数据库(GTEx)、基因表达数据库(GEO)及UALCAN检测在BC与正常组织样本中VASH2的表达差异。运用Kaplan-Meier ...
目的基于生物信息学分析血管抑制蛋白2(VASH2)在乳腺癌(BC)中的表达和临床意义。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)联合基因组织表达数据库(GTEx)、基因表达数据库(GEO)及UALCAN检测在BC与正常组织样本中VASH2的表达差异。运用Kaplan-Meier plotter分析VASH2表达水平与患者总生存期的关系。利用UALCAN与cBioPortal协同分析VASH2的表达与甲基化水平的相关性。采用LinkedOmics和Metascape网站进行基因富集分析,研究VASH2在BC发生发展中涉及的分子功能和相关通路。使用TIMER分析VASH2与BC免疫浸润细胞关联性。结果VASH2在BC组织中与正常组相比表达水平显著提高。生存曲线提示高表达VASH2的BC患者总生存期较差。在BC中下调VASH2基因的甲基化修饰程度可能是VASH2表达上调的原因之一。VASH2可能参与细胞周期、BRCA2协作PALB2同源重组修复、有丝分裂G1期和G1/S过渡等信号通路。结论在BC组织中VASH2表达升高且与BC分化程度、淋巴结转移和临床预后相关,可能作为乳腺癌诊断、治疗和预后预测的新分子指标。
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关键词
血管抑制蛋白2
乳腺癌
生物信息学
免疫浸润
细胞周期
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题名
基于生物信息学分析血管抑制蛋白2在乳腺癌中的表达及临床意义
1
作者
王卫
王红丽
阿力比亚提·艾尼
吴军
衣力亚尔·肉苏
阿依努尔
丁晓琴
杨亮
机构
新疆医科大学附属肿瘤医院头颈外科
出处
《中国医药科学》
2023年第12期13-17,共5页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2020D01C211)。
文摘
目的基于生物信息学分析血管抑制蛋白2(VASH2)在乳腺癌(BC)中的表达和临床意义。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)联合基因组织表达数据库(GTEx)、基因表达数据库(GEO)及UALCAN检测在BC与正常组织样本中VASH2的表达差异。运用Kaplan-Meier plotter分析VASH2表达水平与患者总生存期的关系。利用UALCAN与cBioPortal协同分析VASH2的表达与甲基化水平的相关性。采用LinkedOmics和Metascape网站进行基因富集分析,研究VASH2在BC发生发展中涉及的分子功能和相关通路。使用TIMER分析VASH2与BC免疫浸润细胞关联性。结果VASH2在BC组织中与正常组相比表达水平显著提高。生存曲线提示高表达VASH2的BC患者总生存期较差。在BC中下调VASH2基因的甲基化修饰程度可能是VASH2表达上调的原因之一。VASH2可能参与细胞周期、BRCA2协作PALB2同源重组修复、有丝分裂G1期和G1/S过渡等信号通路。结论在BC组织中VASH2表达升高且与BC分化程度、淋巴结转移和临床预后相关,可能作为乳腺癌诊断、治疗和预后预测的新分子指标。
关键词
血管抑制蛋白2
乳腺癌
生物信息学
免疫浸润
细胞周期
Keywords
Vashohibin-2
Breast cancer
Bioinformatics
Immune infiltrati on
Cell cycle
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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被引量
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1
基于生物信息学分析血管抑制蛋白2在乳腺癌中的表达及临床意义
王卫
王红丽
阿力比亚提·艾尼
吴军
衣力亚尔·肉苏
阿依努尔
丁晓琴
杨亮
《中国医药科学》
2023
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