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陆地棉突变体腺体形成时期的基因表达谱
1
作者
陈敏
江明锋
+14 位作者
蔡应繁
孙全
何晓红
江怀仲
谢永芳
莫剑川
高运玲
潘正
陈珺
伍婷玉
王玲
朱小燕
张锐
袁友禄
石玉真
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2010年第3期476-481,共6页
为了解棉花腺体形成时期相关基因的表达谱,分别抽提陆地棉湘棉-18和N5在腺体形成时期的RNA,采用Affymetrix芯片,扫描采集数据后进行分析。结果显示,在腺体形成时期有明显差异表达的基因共有514条,包括209条上调基因和305条下调基因;在51...
为了解棉花腺体形成时期相关基因的表达谱,分别抽提陆地棉湘棉-18和N5在腺体形成时期的RNA,采用Affymetrix芯片,扫描采集数据后进行分析。结果显示,在腺体形成时期有明显差异表达的基因共有514条,包括209条上调基因和305条下调基因;在514条差异表达基因中有275条(53.5%)与GenBank中已知的基因具有较高的相似性,这些基因主要涉及防御反应及异戊二烯生物合成等,有239条(46.5%)在GenBank中无任何注释。KOBAS分析结果显示,这些差异基因在KEGG数据库上涉及19条生化途径。说明,腺体形成过程是一个复杂的基因网络调控过程,涉及多条萜类化合物生物合成途径及其他与防御基因相关的途径。
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关键词
棉花
棉酚
腺体形成
基因芯片
表达谱
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职称材料
题名
陆地棉突变体腺体形成时期的基因表达谱
1
作者
陈敏
江明锋
蔡应繁
孙全
何晓红
江怀仲
谢永芳
莫剑川
高运玲
潘正
陈珺
伍婷玉
王玲
朱小燕
张锐
袁友禄
石玉真
机构
西南民族大学生命科学与技术学院
重庆邮电大学生物信息学院
中国农业科学院棉花研究所
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2010年第3期476-481,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30771311、30440032)
重庆自然科学基金项目(2007BB1328、BB1329)
文摘
为了解棉花腺体形成时期相关基因的表达谱,分别抽提陆地棉湘棉-18和N5在腺体形成时期的RNA,采用Affymetrix芯片,扫描采集数据后进行分析。结果显示,在腺体形成时期有明显差异表达的基因共有514条,包括209条上调基因和305条下调基因;在514条差异表达基因中有275条(53.5%)与GenBank中已知的基因具有较高的相似性,这些基因主要涉及防御反应及异戊二烯生物合成等,有239条(46.5%)在GenBank中无任何注释。KOBAS分析结果显示,这些差异基因在KEGG数据库上涉及19条生化途径。说明,腺体形成过程是一个复杂的基因网络调控过程,涉及多条萜类化合物生物合成途径及其他与防御基因相关的途径。
关键词
棉花
棉酚
腺体形成
基因芯片
表达谱
Keywords
cotton
gossypol
gland morphogenesis
gene chip
expression profile
分类号
S562.01 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陆地棉突变体腺体形成时期的基因表达谱
陈敏
江明锋
蔡应繁
孙全
何晓红
江怀仲
谢永芳
莫剑川
高运玲
潘正
陈珺
伍婷玉
王玲
朱小燕
张锐
袁友禄
石玉真
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2010
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