鸡主要组织相容性复合体B区域多态性分析

为研究不同品种间BF1基因的结构变异,B-F exon2多态性以及TAPBP、BRD2、DMA、DMB2、TAP1、TAP2基因上14个SNPs位点的多态性,以农大3号矮小鸡、白来航鸡和藏鸡三个品种为研究对象,通过PCR扩增不同品种B-F1基因检测B-F1基因及启动子序列增强子A的缺失现象。同时利用红色原鸡B-F exon2序列设计引物后测序;选择TAPBP、TAP1、TAP2、BRD2、DMA、DMB2基因上的部分SNPs利用KASP技术进行分型。结果显示:根据缺失情况,将BF1基因分为A、B和Bdel三种,从而决定了AA、AB、ABdel、BB、BBdel和BdelBdel六种基因型,农大3号矮小鸡中存在两种基因型,白来航鸡存在四种基因型;藏鸡存在三种基因型。利用测序发现农大3号矮小鸡、白来航鸡和藏鸡在B-F exon 2序列上分别存在45、37、37个突变位点。通过KASP分型技术检测TAPBP、BRD2、DMA、DMB2、TAP1、TAP2基因上14个SNPs位点的多态性,发现农大3号矮小鸡、白来航鸡、藏鸡分别存在14、9、13个突变位点。