目的:鉴定0-36-40-44 h大鼠短间隔连续部分肝切除(0- 36-40-44 h SISPH)中与肝再生有关的基因,并分析他们在肝再生中的表达动态和作用. 方法:从0-36-40-44h SISPH再生肝消减cDNA文库中筛选与肝再生有关的基因,用基因芯片技术分析其在肝...目的:鉴定0-36-40-44 h大鼠短间隔连续部分肝切除(0- 36-40-44 h SISPH)中与肝再生有关的基因,并分析他们在肝再生中的表达动态和作用. 方法:从0-36-40-44h SISPH再生肝消减cDNA文库中筛选与肝再生有关的基因,用基因芯片技术分析其在肝再生中的表达动态,并用GeneMath软件对有关基因进行聚类分析. 结果:用基因芯片技术分析的551个与肝再生有关基因中, 157个基因至少在肝再生的—个时间点表达变化达2倍以上,其中,上调表达的基因有87个,下调表达的基因有70个;157个基因中的71个属未报道的基因,86个为已报道基因,但在此之前尚不清楚他们与肝再生有关;聚类分析和统计学分析表明,0-36-40-44 h SISPH的基因表达模式分为6类,即早期诱导,中期诱导,晚期诱导,早期抑制,中期抑制,晚期抑制.与PH相比,38个基因在0-36-40-44 h SISPH中特异性表达,119个基因在这两个模型中表达趋势相同,但在各时间点的表达丰度不同. 结论:0-36-40-44 h SISPH中,上调和下调表达的基因数目相差不大;晚期表达的基因多于早期表达的基因,远多于中期表达的基因;表达幅度小的基因(2-5倍)多于表达幅度大的基因.展开更多
文摘目的:鉴定0-36-40-44 h大鼠短间隔连续部分肝切除(0- 36-40-44 h SISPH)中与肝再生有关的基因,并分析他们在肝再生中的表达动态和作用. 方法:从0-36-40-44h SISPH再生肝消减cDNA文库中筛选与肝再生有关的基因,用基因芯片技术分析其在肝再生中的表达动态,并用GeneMath软件对有关基因进行聚类分析. 结果:用基因芯片技术分析的551个与肝再生有关基因中, 157个基因至少在肝再生的—个时间点表达变化达2倍以上,其中,上调表达的基因有87个,下调表达的基因有70个;157个基因中的71个属未报道的基因,86个为已报道基因,但在此之前尚不清楚他们与肝再生有关;聚类分析和统计学分析表明,0-36-40-44 h SISPH的基因表达模式分为6类,即早期诱导,中期诱导,晚期诱导,早期抑制,中期抑制,晚期抑制.与PH相比,38个基因在0-36-40-44 h SISPH中特异性表达,119个基因在这两个模型中表达趋势相同,但在各时间点的表达丰度不同. 结论:0-36-40-44 h SISPH中,上调和下调表达的基因数目相差不大;晚期表达的基因多于早期表达的基因,远多于中期表达的基因;表达幅度小的基因(2-5倍)多于表达幅度大的基因.
基金the Doctoral Start-up Funding of Zhengzhou University of Light Industry(No.2017BSJJ030)Henan Province Science Fund for Excellent Young Scholars(No.202300410494)+4 种基金the Beijing Municipal Science and Technology Commission(No.Z191100007219009)for supportsthe VSC(Flemish Supercomputer Center),funded by the Research Foundation-Flanders(FWO)the Flemish Government-department EWIthe support of Xi’an Jiaotong University via the“Young Talent Support Plan”the“Fundamental Research Funds for Central Universities”。