犬葡萄糖激酶调节蛋白的生物信息学分析

试验旨在探讨犬葡萄糖激酶调节蛋白(glucokinase regulatory protein,GCKR)的结构、功能及表达。试验采用生物信息学方法对犬GCKR蛋白的理化性质、亲/疏水性、同源性和保守基序、信号肽和跨膜区、二级结构、结构域、三级结构、磷酸化修饰、相互作用蛋白质和GO注释、亚细胞定位、基因结构、启动子和转录调控进行了研究。结果显示:犬GCKR蛋白是一种不稳定酸性亲水蛋白质,与马的亲缘关系较近,没有信号肽和跨膜区;二级结构由α-螺旋(47.36%)、延伸链(12.00%)、β-转角(4.48%)和无规则卷曲(36.16%)构成,含有2个糖异构酶结构域;三级结构以马GCKR蛋白为模板构建且质量较高。犬GCKR蛋白含有28个磷酸化位点,其相互作用蛋白包括葡萄糖激酶、酰胺水解酶结构域2、锌指蛋白512等,并参与糖代谢,主要定位于内质网;其基因具有19个外显子和18个内含子,启动子位于第1 302~1 352 bp,转录因子如Ncx、POU1F1a、C/EBPdelta可与启动子结合。研究表明,犬GCKR蛋白可能参与犬糖尿病的发生机制,可作为研发相关药物的潜在靶标。