2018—2020年黔东南少数民族自治州肠道病毒A71型基因特征分析

目的对2018—2020年黔东南州手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)进行鉴定分析,并对肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EV-A71)VP1编码区进行基因特征分析。方法2018—2020年黔东南州共采集HFMD病例标本2789份,首先,采用荧光定量RT-PCR初筛肠道病毒核酸,阳性病例标本采用人类横纹肌肉瘤(human rhabdomyosarcoma,RD)细胞进行病毒分离,对分离到的病毒株提取病毒核酸,经RT-PCR方法扩增VP1编码区核苷酸序列并进行序列测定。使用MEGA 11.0软件构建遗传进化树进行基因特征分析。结果2789份HFMD标本中检出EV-A71核酸阳性标本为328份,阳性率为11.8%。从部分EV-71阳性患者的咽拭子及肛拭子中,分离培养获得7株病毒株,其中6株来自于轻症病例,另1株为重症病例,均属于EV-A71基因型C4a基因亚型,分成2个不同的簇。7株EV-A71 VP1序列之间核苷酸和氨基酸同源性分别为89.8%~99.9%和98.0%~99.7%;与BrCr原型参考株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为77.1%~78.8%和94.8%~96.6%;并在VP1有18处氨基酸位点发生变异。结论2018—2020年黔东南州EV-A71分离株属于C4a基因亚型,多处氨基酸位点存在变异,可导致多条传播链循环。

2015~2019年黔东南州手足口病流行特征分析

分析2015-2019年黔东南州手足口病流行病学、病原学等特征,为手足口病防控提供依据。方法 利用描述性流行病学方法,对黔东南州2015-2019年在国家传染病报告信息管理系统报告的手足口病病例,以及手足口病相关监测资料进行统计分析。结果 2015-2019年黔东南州共报告手足口病11509例,年均发病率65.62/10万,其中重症病例109例,死亡1例。报告的病例职业以散居儿童为主,占82.34%;主要累及以5岁以下儿童,其中3岁以下儿童发病率最高(占全人群74.25%,占5岁以下儿童77.06%);以男性为主,占64.30%;每年报告的病例主要集中在 4~7月(占50.19%);实验室检测,以EV未型最多,占67%。结论 2015-2019年黔东南州手足口病呈夏秋季高发,5岁以下儿童及散居儿童易感,男性儿童居多,应加强重点时段、重点地区、重点人群的针对性防控措施。

贵州省黔东南州2017—2022年度流感监测结果分析

目的分析黔东南苗族侗族自治州(黔东南州)流感流行趋势及病原学特征,为制定防控措施提供依据。方法描述性分析黔东南州2017—2022年度哨点医院流感样病例(ILI)和病原学监测数据。结果黔东南州2017—2022年度共报告ILI病例70495例,ILI%为9.6%,其中2022年度最高(16.4%),ILI%总体上呈上升趋势(趋势χ^(2)=4955.04,P<0.01);ILI%有冬春季和夏季2个流行高峰;ILI病例主要分布在0~14岁儿童(83.3%,58769例);流感病毒核酸平均阳性率为22.6%(1627/7188),其中A(H3N2)型占比最高(30.2%),6年中流行优势株交替出现;15~24岁阳性率最高(30.8%),<5岁阳性率最低(8.6%,χ^(2)=28.86,P<0.05);<5岁、25~59岁和≥60岁以A(H1N1)pdm09型居多,5~14岁以B-Yam居多,15~24岁以A(H3N2)型居多;报告聚集性疫情94起(甲型流感59起、乙型流感35起),罹患率1.0%(1407/144519),暴发疫情主要发生在学校(93起)。结论黔东南州6年来ILI报告总体上呈上升趋势,流感优势株交替出现,学校是聚集疫情的主要场所,应加强流感监测和疫苗接种工作。

2017年贵州省H7N9禽流感病毒血凝素基因特性分析

为了解2017年贵州省H7N9禽流感病毒的分子特征和疾病风险,运用生物信息学软件对14株病毒HA基因的同源性、遗传进化、受体结合关键位点、致病相关和糖基化位点进行分析,明确了其HA基因核苷酸同源性为95.9%~100%,与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013疫苗株的同源性分别为96.8%~97.8%和96.8%~97.9%;14株毒株均属于长三角分支,来源于5个不同的毒株;其中13株为低致病性禽流感毒株,而A/Guizhou-Weining/CSY01/2017为高致病性禽流感毒株;受体结合关键位点14株毒株均存在G186V的突变,13株存在Q226L的突变;潜在糖基化位点无变异。

2017年黔东南州外环境禽流感疫情检测分析

目的了解2017年黔东南州人感染H7N9高致病性禽流感病毒确诊病例后,在全州16县(市)开展外环境禽流感病毒的监测结果,为采取的防控措施评价及对今后禽流感疫情的研判防控提供科学参考依据。方法 2017年1~3月对全州活禽市场采集地面污水、洗禽污水、禽类饮水、粪便、案板及笼具表面擦拭物标本1 827份,用RT-PCR方法检测,禽流感病毒A型阳性标本,继续做H5、H7、H7N9、H9亚型分型检测。结果全州活禽市场采取防控措施前,共采集标本963份,FluA阳性613份,阳性率为63.66%(613/963),各种病毒亚型型别均检出,在不同类型标本中以地面污水检出率最高为77.98%(131/168);采取防控措施后共采集标本864份,FluA阳性114份,阳性率13.19%(114/864),粪便标本检出率最高为23.08%(3/13)。结论黔东南州外环境存在高致病性禽流感病毒污染且形势较为严峻,引起人感染高致病性禽流感病毒疫情风险较大。

2017-2020年黔东南地区手足口病病原构成及监测分析

目的分析2017-2020年黔东南地区手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)病原构成,了解本地区近几年病原分布及变化趋势。方法对2017-2020年黔东南地区共收集的疑似HFMD病例标本3576份,采用荧光定量RT-PCR法检测肠道病毒核酸,对主要病原进行分型鉴定,对监测结果进行描述性分析。结果2017-2020年黔东南地区从3576份HFMD病例标本中检出阳性标本2272份(2272/3576,63.5%),其中,肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)病原构成比为16.6%,柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)为16.2%,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)为5.9%,柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)为0.2%,其他未分型肠道病毒(Enterovirus,EV)为61.1%。黔东南地区HFMD好发于男性(2264份,63.3%);多数为1~7岁儿童,其检测量占了89.4%;一般4~6月为HFMD检出阳性的高峰期,但个别年份由于新型冠状病毒肺炎疫情会影响HFMD流行趋势。结论2017-2020年黔东南地区HFMD病例病原谱主要为其他未分型EV,且EV-A71、CV-A16、CV-A6交替作为第二优势病原在传播流行,应关注其流行并加强HFMD监测力度。