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菊花R病毒杭白菊分离株全基因组序列测定与分析 被引量:4
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作者 裴燕妮 咸珅 +3 位作者 齐永红 张丽 王德富 牛颜冰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期217-224,共8页
杭白菊作为著名的中药"浙八味"之一,种植规模和产区不断扩大,但其病毒病的发生也日益严重,对其产量和品质造成严重影响。本研究利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplificati... 杭白菊作为著名的中药"浙八味"之一,种植规模和产区不断扩大,但其病毒病的发生也日益严重,对其产量和品质造成严重影响。本研究利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)等方法,对感病杭白菊病原物进行鉴定,为杭白菊病毒病原的检测构建一套快速和简便的方法。结果表明,感病杭白菊被菊花R病毒(Chrysanthemum virus R,CVR)侵染,将其命名为CVR-TX。通过对其全基因组进行序列扩增与分析,获得其全长基因组为8872 bp,编码6个ORF,具有Carlavirus属病毒的典型特征。基于全基因组核酸序列以及复制酶、外壳蛋白氨基酸的序列比对发现,CVR-TX与CVR-BJ同源性最高,分别为85.5%、96.0%和96.3%;与Carlavirus属其他病毒同源性分别在48.2%~54.4%、46.9%~55.3%和36.8%~59.5%,因此CVR被确定为一种新的Carlavirus属病毒。系统进化分析表明,基于全长基因组、复制酶(replicase)基因和外壳蛋白(coat protein,CP)基因与CVR-BJ聚为一簇,亲缘性最近。本研究获得了CVR-TX的全长基因组,丰富了CVR的基因组信息,通过生物信息学分析明确其种属关系和区域变化情况,从而为建立CVR可靠灵敏的分子检测手段和有效的防控措施提供理论基础。 展开更多
关键词 杭白菊 菊花R病毒 全基因组序列
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小RNA深度测序技术分析西瓜花叶病毒蜀葵分离物 被引量:3
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作者 张丽 于沛侠 +4 位作者 齐永红 裴燕妮 咸珅 王德富 牛颜冰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期324-332,共9页
蜀葵病毒病害的发生对其生长造成严重影响,明确蜀葵病毒病害的种类及变异进化对蜀葵病毒病害的防治具有重要意义。利用小RNA深度测序技术对具有明显脉明、花叶症状的蜀葵叶片进行鉴定。结果发现,感病蜀葵被西瓜花叶病毒(Watermelon mosa... 蜀葵病毒病害的发生对其生长造成严重影响,明确蜀葵病毒病害的种类及变异进化对蜀葵病毒病害的防治具有重要意义。利用小RNA深度测序技术对具有明显脉明、花叶症状的蜀葵叶片进行鉴定。结果发现,感病蜀葵被西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus, WMV)、锦葵脉明病毒(Mala vein cleaning virus, MVCV)和一种新的RNA病毒[暂命名为蜀葵病毒1号(Althaea rosea virus1, ArV1)]所侵染。为进一步明确WMV蜀葵分离物(WMV-Tg)的进化关系,对病毒WMV-Tg全基因组进行扩增,获得全长为10 046个核苷酸序列(nt)。序列分析结果显示,WMV-Tg与已报道的WMV分离物基因组核苷酸序列的同源性为83.3%~90.2%。系统进化关系表明,WMV-Tg与WMV-Pg聚为一簇,亲缘关系最近。对蜀葵WMV-Tg来源的小RNA(WMV-derived small interfering RNAs, WMV-vsiRNAs)的长度分布、5′碱基偏好性、极性分布以及热点区分布的分析,有助于加深对WMV-vsiRNAs的了解,并为进一步研究病毒来源的小RNA(virus-derived small interfering RNAs, vsiRNAs)在抗病毒防御中的功能,以及为蜀葵病毒病的防治奠定理论基础。 展开更多
关键词 蜀葵 西瓜花叶病毒 小RNA深度测序
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建设高校二手书市场的分析与建议 被引量:12
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作者 王津 高文秀 裴燕妮 《科技创新导报》 2014年第7期208-209,共2页
随着二手书市场的逐渐增大,书籍的重复利用成为一种趋势,大学生作为图书市场重要的消费者之一,废旧教材数量之多,为了提高学生书籍的重复利用率,本文通过对二手书市场进行各方面的分析提出了建设高校二手书市场。
关键词 高校二手书市场 学生 分析与建议
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油用牡丹籽仁中茋类化合物超声波提取及其抑菌活性研究 被引量:8
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作者 申少斐 裴燕妮 +2 位作者 张丽 王德富 牛颜冰 《山西农业科学》 2018年第5期742-747,共6页
茋类化合物属于多酚类化合物,具有天然性,有较高的应用价值。试验以凤丹油用牡丹的籽仁为原料,以茋类化合物的提取量为评价指标,采用Folin-Ciocalteu比色,单因素试验和响应面分析等方法,研究了液料比、超声时间、超声功率对油用牡丹籽... 茋类化合物属于多酚类化合物,具有天然性,有较高的应用价值。试验以凤丹油用牡丹的籽仁为原料,以茋类化合物的提取量为评价指标,采用Folin-Ciocalteu比色,单因素试验和响应面分析等方法,研究了液料比、超声时间、超声功率对油用牡丹籽仁中茋类化合物提取量的影响程度及最佳提取方案。结果表明,当液料比、超声时间、超声功率依次为34∶1(m L/g),40 min,200 W时,茋类化合物提取量最佳,可达到0.465 4 mg/g。最后,借助大肠杆菌与金黄色葡萄球菌的抑菌圈试验,论证了油用牡丹仁中的茋类提取物具有较好的抑菌性能。 展开更多
关键词 油用牡丹 茋类化合物 响应面分析法 超声提取 抑菌活性
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黄芩中FNSII-1与CHS-2真核表达载体的构建 被引量:1
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作者 咸珅 王德富 +1 位作者 裴燕妮 牛颜冰 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第1期11-16,共6页
[目的]FNSII-1与CHS-2分别是黄芩叶与根中合成黄芩活性物质通路中的关键酶基因,本试验拟通过构建FNSII-1和CHS-2与载体pYES-dest52的重组质粒,进行酵母真核表达,为探索黄芩活性物质体外大规模合成途径奠定基础。[方法]通过设计特异性引... [目的]FNSII-1与CHS-2分别是黄芩叶与根中合成黄芩活性物质通路中的关键酶基因,本试验拟通过构建FNSII-1和CHS-2与载体pYES-dest52的重组质粒,进行酵母真核表达,为探索黄芩活性物质体外大规模合成途径奠定基础。[方法]通过设计特异性引物,RT-PCR扩增目的基因,利用Gateway重组技术将目的基因FNSII-1和CHS-2整合至目的载体pYES-dest52上得到重组质粒,随后将其转到酿酒酵母INVSc1菌株中,通过SDS-PAGE检测分析并确定酵母蛋白表达最佳条件。[结果]经RT-PCR扩增得到的目的基因FNSII-1与CHS-2,其片段长度分别为1491 bp、1205 bp,与理论值相符。重组质粒经测序与比对,2个基因与其相应NCBI数据库的信息相似性分别为94.18%和91.77%。酵母菌株在5种不同OD 600值下蛋白均能稳定表达。[结论]本研究成功构建了pYES-dest52-FNSII-1和pYES-dest 52-CHS-2重组载体和FNSII-1和CHS-2蛋白表达体系,为黄芩中活性物质的体外合成奠定基础。 展开更多
关键词 FNSII-1 CHS-2 Gateway重组技术 载体构建
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阿莫西林和阿莫西林-克拉维酸钾的不良反应研究 被引量:1
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作者 裴燕妮 《中国处方药》 2017年第3期55-56,共2页
目的比较阿莫西林和阿莫西林-克拉维酸钾的不良反应。方法随机抽取2014~2016年收治的100例感染性疾病患者作为观察对象。根据治疗方法不同将患者分为对照组和试验组。给予对照组阿莫西林,给予试验组阿莫西林-克拉维酸钾,根据两组服药后... 目的比较阿莫西林和阿莫西林-克拉维酸钾的不良反应。方法随机抽取2014~2016年收治的100例感染性疾病患者作为观察对象。根据治疗方法不同将患者分为对照组和试验组。给予对照组阿莫西林,给予试验组阿莫西林-克拉维酸钾,根据两组服药后的反应情况,分析两组患者发生不良反应的情况。结果试验组出现严重不良反应10例、非严重不良反应15例,总体不良反应发生率为50%,而对照组出现严重不良反应14例、非严重不良反应21例,总体不良反应发生率为70%,两组病例出现的不良反应较为相似,但对照组不良反应累及范围更广,同时经比较两组病例的严重不良反应发生率、总体不良反应发生率,组间差异有统计学意义(P<0.05)。结论对于感染性疾病患者而言,阿莫西林-克拉维酸钾临床效果较好,安全性高。 展开更多
关键词 阿莫西林 阿莫西林-克拉维酸钾 不良反应
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孟鲁司特钠联合全程化药学服务对社区COPD患者肺功能及血气指标的影响
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作者 李莉 彭甫生 裴燕妮 《现代医学与健康研究电子杂志》 2020年第19期96-98,共3页
目的探讨孟鲁司特钠联合全程化药学服务对社区COPD患者肺功能及血气指标的影响。方法按随机数字表法将2016年2月至2019年1月湖北省汉川市仙女山社区卫生服务中心收治的COPD患者分为对照组(给予布地奈德雾化吸入治疗)和研究组(给予孟鲁... 目的探讨孟鲁司特钠联合全程化药学服务对社区COPD患者肺功能及血气指标的影响。方法按随机数字表法将2016年2月至2019年1月湖北省汉川市仙女山社区卫生服务中心收治的COPD患者分为对照组(给予布地奈德雾化吸入治疗)和研究组(给予孟鲁司特钠片联合布地奈德雾化吸入治疗),每组各46例,两组患者均在治疗过程中实施全程化药学服务,两组患者治疗周期均为3个月。比较两组患者治疗前后肺功能指标及血气指标变化、治疗期间药物不良反应总发生率。结果与治疗前相比,治疗后两组患者FVC、FEV1%pred、MVV%pred、血pH值、PaO2水平均升高,且研究组高于对照组;两组患者PaCO2水平均降低,且研究组低于对照组;研究组患者药物不良反应总发生率为21.73%,低于对照组的56.51%(均P<0.05)。结论孟鲁司特钠联合全程化药学服务可有效改善社区COPD患者的肺功能及血气指标,且安全性较高。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 全程化药学服务 肺功能 血气指标 安全性
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大豆花叶病毒半夏分离物侵染性克隆构建及鉴定 被引量:3
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作者 张丽 王德富 +2 位作者 裴燕妮 咸珅 牛颜冰 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期949-958,共10页
大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)作为半夏(Pinellia ternata(Thunb.)Breit.)主要病毒病害之一,已对其产量和品质造成严重影响。构建病毒侵染性克隆是反向遗传学研究病毒基因功能、病毒与宿主相互作用的有力工具,为明确SMV侵染... 大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)作为半夏(Pinellia ternata(Thunb.)Breit.)主要病毒病害之一,已对其产量和品质造成严重影响。构建病毒侵染性克隆是反向遗传学研究病毒基因功能、病毒与宿主相互作用的有力工具,为明确SMV侵染半夏的分子机制,开展SMV全长cDNA侵染性克隆的构建特别重要。因此文中利用Gibson体外重组系统对大豆花叶病毒山西半夏分离物(SMV-SXBX)侵染性克隆进行组装,通过农杆菌浸润法接种健康半夏;进一步通过机械传代、逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)证实SMV-SXBX侵染性克隆3′末端含有poly(A)尾56 nt时具有稳定侵染性。该方法便捷、高效,且避免了SMV侵染性克隆在大肠杆菌中的不稳定问题。SMV全长侵染性cDNA克隆的构建,为进一步研究SMV复制和发病的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 侵染性克隆 大豆花叶病毒 Gibson组装 多聚腺苷酸尾 半夏
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