DNA测序技术的发展历史与最新进展

DNA测序技术是现代分子生物学研究中最常用的技术。从1977年第一代测序技术的出现,经过30多年的发展,DNA测序技术取得重大进展,以高通量为特点的第二代测序技术逐步成熟并商业化,以单分子测序为特点的第三代测序技术也已经出现。介绍每一代测序技术的特点,并重点介绍了第二代测序技术及其应用。展望新的测序技术对于未来生物学研究及人们自身健康与人类疾病等方面研究的影响。

高校课程思政元素的挖掘与融入——以基因组学课程为例

当前我国经济已经进入新常态,大力培养更多符合社会发展需求的人才成为了一项重要任务。为有效转变一直以来教育现代化水平不高、经济发展大于文化发展的现状,习近平总书记明确提出课程思政理念,把思政内容渗透到学校人才培养的整个环节中来,始终坚持以立德树人出发,引导学生深入理解认识社会主义核心价值观,从而真正实现为国育人、为党育才的目标。为进一步推动课程思政建设工作,充分发挥出相关专业课程的育人功能,需要不断挖掘并利用好课程中的思政内容,并将其渗透到教学教育的全过程。本文以基因组学课程为例,阐述高校课程思政建设的目标,分析了怎样科学高效地挖掘思政内容并将其纳入到实践教学中来,实现潜移默化的育人作用。

校园生物多样性数据库建设及其在普通生物学教学中的作用

校园生物多样性数据库建设是信息技术在普通生物学教学中应用的初步尝试,对于培养学生的学习兴趣,巩固在课堂上学到的理论知识,辅助进行野外实习教学等方面起了良好的作用,对普通生物学的理论和实践教学具有重要的促进作用。

应用驱动的生物信息学专业英语教学体系

生物信息学是较新的交叉学科,大部分文献资料都是英文的,对学生的专业英语能力要求较高,仅靠开几门课远远不够。应用驱动的生物信息学专业英语教学体系在大学英语和专业英语课程的基础上,以应用为驱动和引导,以网络资源查询、专业软件使用及专业文献资料的阅读及写作为核心内容,使学生在课程设计、综合实验及科研等实践过程中提高专业英语水平,收到了良好的效果。

高校课程翻转课堂学习平台建设及应用实践

课程平台是课程实施翻转课堂的有力保证,目前的公共慕课平台并不能完全满足课程的个性化需求。专门为生物信息处理技术课程搭建的课程平台包含课程所需的文字材料、课件、教学视频等资料,并提供过关游戏式的练习、测试等功能,在该课程翻转课堂的实施过程中发挥了重要作用。

生物信息学专业之数据挖掘教学实践与思考

数据挖掘在生物信息学领域中应用前景非常广阔,关于数据挖掘技术在生物信息学专业中教学研究具有重要的意义。从师资、教材、学生基础等方面分析了目前生物信息学本科专业的数据挖掘课程教学存在的问题,并在有关六年来教学实践经验总结基础上,提出了数据挖掘在生物信息学本科专业教学中改革的几点思考。

生物信息学综合大实验体系构建与实践

生物信息学综合大实验是生物信息学本科专业开设的一门重要实验课程,关于其体系构建研究实践具有重要意义。根据几年来在生物信息学综合大实验体系构建中经验,先对生物信息学综合大实验设置背景、综合大实验体系构建重要性和建设目标进行了阐述,然后对体系具体内容建设进行了探索,最后对综合大实验体系实施效果进行总结和对其发展进行了展望。

遗传学教学改革的思考与实践

遗传学是当代生命科学的核心和前沿学科,对于丰富和完善学生的知识面、培养学生的创新意识和能力都有着重要影响。就近几年来关于遗传学的教学实践,从教学内容、教学手段和教学方法等方面进行了合理的改进,以期全面提高教学质量,努力培养高素质的专业人才。

系统发育基因组学研究进展

系统发育基因组学是利用全基因组数据构建系统发育树的新领域。全基因组数据能有效消除横向基因转移和类群间基因进化速率差异等因素对系统发育树的影响。根据所使用的全基因组数据的类型,可以将系统发育基因组学方法分为以下5类:多基因联合建树方法,基于基因含量的方法,基于基因排列信息的方法,基于序列短串含量特征信息的方法及基于代谢途径的方法。文章系统地总结了每一类方法的原理、速度、准确性、适用范围及在各个生物类群中的应用,并对系统发育基因组学的前景及面临的挑战进行了概述。

生物医学数据库课程思政的教学设计和反思

生物医学数据库作为生物信息学专业的重要课程,旨在教授学生对生物医学数据整合、存储、管理和分析的能力,为生物医学研究和临床诊疗培养人才。然而,生物医学数据库教学中往往重视知识体系教育,而缺乏思政教育的引导,未能强化学生的国家认同、社会责任感和职业道德。以课程思政为指导,探讨了生物医学数据库课程中的思政育人问题,并提出了相关的教学策略。

生物信息学大实验教学改革的探索与实践

随着科学技术的进步、交叉学科的迅猛发展,社会对生物信息专业学生的知识、能力和素质提出了更高的要求。为了顺应生物信息学学科的快速发展,必须深化教学改革,加强实践性教学环节,加强对学生动手能力的培养。本文针对生物信息学大实验,从教学内容、教学手段和教学方法等方面进行了改革探索,以期全面提高教学质量,努力培养高素质的专业人才。

基因组转座子鉴别与注释方法研究进展

转座子是一类可以在基因组不同位置间移动的、重复的序列,广泛存在于真核和原核生物基因组中,并对基因组的结构、功能和进化有着重要影响。转座子鉴别与注释是基因组注释工作的重要一步,相关软件可分为3类:从头算法、基于同源性的算法和联合算法,不同的软件实现方法和功能各不相同,并各有优缺点。文中对此进行了综述,并提出在今后的开发中将会出现更多结合多种算法的综合流程程序包,它们整合多种方法的优点,针对性强,可根据不同的需求来解决实际问题。

《生物统计学》自主学习平台的设计与开发

生物统计学是生物学研究中进行数据收集、整理、分析、解释的一门科学,对现代生物学的研究来说是一种不可或缺的研究工具,可以有效帮助学生提高科学研究和分析问题的综合实践应用能力。对大多高等院校生物类专业的学生来说,《生物统计学》这门课程的学习是不可避免的,而共享资源的网络教学模式在信息技术快速发展的今天越来越重要,甚至已经成为高校教学形式的发展方向。为了提高学生的学习效率,通过对网站开发相关理论的研究,针对《生物统计学》这门课程设计并实现了一个线上学习网站。

海葵等四种动物粘多糖碱提取的比较研究

采用碱提取法从绿疣海葵等 4种海洋无脊椎动物中提取酸性粘多糖 ,其粗品产率分别为 :绿疣海葵 9.9% ,绒毛近方蟹 4 .9% ,毛肤石鳖 4 .3% ,平背蜞 3.6% .用蒽酮比色法和酚 硫酸法测定产品糖含量 ,考马斯亮蓝法测定蛋白质含量 .醋酸纤维素薄膜电泳显示粘多糖的电泳迁移率相似 ,海葵粘多糖与甲苯胺蓝染色呈蓝色 ,绒毛近方蟹、平背蜞粘多糖呈紫色 .

生物信息学专业的Linux课程翻转课堂教学实践

翻转课堂颠覆了传统的教学方式,也改变了教师在教学中的角色。生物信息学专业的Linux课程侧重Linux常用命令、Shell编程及它们在生物信息学数据处理中的应用,非常适合用翻转课堂的教学模式。学院为该课程开发了专门的学习平台,提供学生在线学习、练习和测试,有效地支持了该课程翻转课堂的实施,收到了良好的教学效果。

基于谱图库的蛋白质鉴定策略研究进展

基于质谱的蛋白质组学快速发展,蛋白质质谱数据也呈指数式增长。寻找速度快、准确度高以及重复性好的鉴定方法是该领域的一项重要任务。谱图库搜索策略直接比较实验谱图与谱图库中的真实谱图,充分利用了谱图中的丰度、非常规碎裂模式和其他的一些特征,使得搜索更加快速和准确,成为蛋白质组学的主流鉴定方法之一。文中介绍基于谱图库的蛋白质组质谱数据鉴定策略,并针对其中两个关键步骤——谱图库构建方法和谱图库搜索方法进行深入介绍,探讨了谱图库策略的进展和挑战。

植物种子特异基因调控网络研究

通过比较种子植物与蕨类植物的基因及其调控网络,为研究种子性状出现的分子机制提供更多的信息。下载拟南芥(Arabidopsis thaliana)种子特异基因和基因网络数据,构建拟南芥种子特异基因调控网络,并与江南卷柏(Selaginella moellendorffii)基因组数据比较,发现其中重要的调控节点。分析得到构成调控网络的1053个拟南芥种子特异基因,其中的969个基因形成一个复杂的调控网络。该网络的核心模块包括39个基因,形成哑铃状的子网络,其中重要节点基因AT1G54860只存在于种子植物基因组中。AT1G54860基因编码GPI锚定蛋白,参与细胞壁的形成、细胞间信号传导及生长分化等过程,推测其在种子形成中具有重要地位,可能起了“开关”的作用。