Bionano-DNA全长光学图谱技术在血友病A携带者基因诊断中的应用

目的:尝试将Bionano Saphyr可视化全长DNA光学图谱技术应用于血友病A携带者的精准基因诊断。方法:针对2例应用常规二代测序技术无法诊断的可疑F8基因缺陷女性携带者,采用DNA全长光学图谱技术,检测扫描获得样本X染色体全长可视化单倍型特征性图谱,与正常人群DNA图谱库进行比对,获得待测样本的基因结构变异信息。结果:2例检测样本F8基因的X染色体DNA分子平均荧光标记长度大于2.5 Mbp,平均拷贝数大于20×。经比对分析,其中1例样本为F8基因22号内含子近端倒位,1例为22号内含子倒位同时伴有多处大片段缺失。结论:Bionano技术对于长度大、变异复杂的基因缺陷有很好的检出率。在无先证者或缺少先证者精准基因诊断结果的情况下,应用该技术检出F8基因的杂合复杂变异对血友病携带者的优生优育、孕前诊断有重要意义。

肿瘤二代测序生物信息学分析规范化管理江苏专家共识

生物信息学分析是二代测序(NGS)技术中不可缺失的重要组成部分,对最终检测结果的准确性起决定性作用。目前各种生物信息分析软件和数据库参差不齐、分析流程的建立及其验证尚无统一认识、质量控制和管理规范缺乏统一标准,以致对同一份NGS测序数据,由于生物信息学分析差异产生不同的分析结果,进而影响临床诊疗决策。为此,特制定本专家共识,以推动肿瘤NGS生物信息学分析过程的规范管理。

中国江苏地区人群血红蛋白病基因型分析

目的:了解中国江苏地区人群血红蛋白病的分布情况和基因型。方法:对4 115人进行血红蛋白病筛查,采用血细胞平均体积(MCV),红细胞渗透脆性试验及高效液相色谱技术(HPLC)三种方法联合进行。筛查阳性标本采用跨越断裂点多聚酶链反应(gap-PCR)和PCR结合反向点杂交技术(RDB)技术进行地中海贫血基因确诊,以PCR-DNA测序法及PCR-电泳法作为RDB技术的补充及异常血红蛋白(除Hb E)突变的鉴定。结果:中国江苏地区人群血红蛋白病筛查阳性率6.10%(251/4 115)。其中对232例进行地中海贫血基因诊断,确诊195例,分别为α-地中海贫血占31.28%(61/232),β-地中海贫血66.15%(129/232),α地中海贫血复合β-地贫1.54%(3/232),SEA-HPFH 0.43%(1/232),SEA-HPFH复合β-地中海贫血0.43%(1/232);α-地中海贫血以东南亚缺失型(--SEA)为主,β-地中海贫血以IVS-Ⅱ-654位点突变率最高;另确诊异常血红蛋白携带者11例,为Hb E3例,Hb Kenitra、Hb Seattle、Hb Saitama、Hb Bushw ick、Hb Koln以及Hb M-M ilw aukee-2各1例。结论:中国江苏地区人群中血红蛋白病以地中海贫血为主,HPLC对筛查血红蛋白病发挥重要作用。本研究对开展遗传咨询,产前诊断具有重要意义。

SET-NUP214融合基因在急性T淋巴细胞白血病患者中的表达及临床意义

本研究旨在探讨SET-NUP214融合基因在急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)中的表达,分析伴有SET-NUP214的T-ALL的临床及分子生物学特征。运用RT-PCR检测58例T-ALL患者骨髓标本中SET-NUP214的表达,以间期荧光原位杂交(FISH)及微阵列比较基因组杂交(Array-CGH)检测9q34缺失,基因测序法检测PHF6和NOTCH1基因突变。结果表明,仅在6例T-ALL患者中检测到SET-NUP214融合基因的表达。除T系抗原标记外,这些患者均表达髓系抗原CD13和(或)CD33,其中4例患者经FISH检测到9q34缺失,3例患者经Array-CGH检测到del(9)(q34.11q34.33)。6例SET-NUP214阳性的T-ALL患者中有4例检测到PHF6基因突变,5例检测到NOTCH1基因突变。结论:SET-NUP214融合基因多由染色体9q34的缺失所致,SET-NUP214阳性的T-ALL常伴有PHF6及NOTCH1基因突变。

ARMS-PCR结合毛细管电泳可以定量检测淋巴瘤MYD88基因L265P突变

目的:研究ARMS-PCR结合毛细管电泳法对提高淋巴瘤患者MYD88基因L265P突变的检测灵敏度和定量检测突变比例的可行性。方法:采用ARMS-PCR方法对淋巴瘤患者MYD88基因进行扩增,使用ABI3730测序仪对扩增产物进行毛细管电泳检测L265P的突变比例;同时采用基因组DNA直接测序法对MYD88基因5号外显子开放阅读框区域进行双向测序。结果:经过对梯度稀释的质粒标准品的检测,ARMS-PCR结合毛细管电泳和直接测序法检测L265P突变的灵敏度分别为0. 2%和5%,对184例既往淋巴瘤患者的检出率分别为13. 59%和8. 28%(p <0. 001)。而前者更可以对突变比例进行定量,拟合优度(R2=0. 979)和可重复性(CV=2. 86%、1. 94%、5. 49%)均较为理想。结论:ARMS-PCR结合毛细管电泳可以对淋巴瘤患者MYD88基因L265P突变进行定量检测,检测灵敏度显著高于传统的直接测序法,因而可作为对后者的补充,可以有效地进行早期诊断和监测微小残留。

以门静脉系统血栓形成为首发表现的原发性血小板增多症1例分析并文献复习

原发性血小板增多症（essential thrombocythemia,ET）属于获得性造血细胞克隆性疾病骨髓增殖性肿瘤（myelo-proliferative neoplasm,MPN）的一种。发病率较低,在1.2~3/10万之间,患者年龄常较大,发病高峰年龄在50~70岁之间。

381例血液病患者造血干细胞移植术后相关感染的临床分析

造血干细胞移植（HSCT）作为血液病的一种治疗手段已日趋成熟,其疗效肯定,但移植术后早期感染已成为HSCT患者死亡的主要原因之一.现将我院2013年进行HSCT的381例血液病患者临床资料作一回顾性分析,探讨血液病患者HSCT早期感染的临床特征及其相关危险因素.

JAK2V617F突变和BCR-ABL融合基因双阳性骨髓增殖性肿瘤二例

例1，男，58岁，2016年4月因乏力就诊。血常规：HGB 196 g/L，WBC 5.4×10/L，PLT 127×10/L。骨髓检查示真性红细胞增多症待排。入院进一步检查，染色体核型：46,XY,t（9;22）（q34;q11）[1]/46,XY[19]，FISH检测BCR-ABL融合基因阳性率9%。JAK2V617F突变检测显示突变率100%，诊断：Ph慢性髓性白血病伴JAK2V617F突变。给予羟基脲和干扰素治疗。后患者失访。

伴4号染色体三体异常的t（8；21）急性髓系白血病c-kit基因突变的发生及患者预后

目的探讨伴有4号染色体三体异常的t（8；21）急性髓系白血病（AML）c－kit基因突变的发生率及患者预后。方法回顾性分析2005年2月至2013年1月145例初治t（8；21）AML患者的实验室及临床资料。所有骨髓样本均采用R显带技术进行核型分析。采用PCR方法检测c—kit基因8号、17号外显子突变情况，并分析患者的临床预后。结果145例t（8；21）AML患者中，12例（813％）伴有4号染色体三体异常，其c－kit基因突变发生率为91．7％（11／12），明显高于其他患者[26．3％（35／133）]（P〈0．01）。生存分析显示，伴有4号染色体三体异常的t（8；21）AML患者的3年总体生存（OS）率及无病生存（DFS）率（15％、0）均低于其他t（8；21）AML患者（56％、51％）（P〈0．01）。同时伴有4号染色体三体及c－kif基因突变的t（8；21）AML患者的OS率及DFS率均较不伴有或不同时伴有4号染色体三体及c－kit基因突变的患者低（均／P〈0．05）。结论伴有4号染色体三体异常的t（8；21）AML患者c．kit基因突变发生率高，且预后不佳。4号染色体三体异常或联合c—kit基因突变是影响t（8；21）AML患者生存的主要因素。

Bcl-2抑制剂维奈克拉联合用药治疗IDH1/2突变阳性急性髓系白血病的疗效及安全性分析

异柠檬酸脱氢酶(IDH1/2)突变是成人急性髓系白血病(AML)中常见的基因突变,IDH1及IDH2基因在成人AML中的突变率分别为5.5%~10.4%及8.6%~17.7%[1]。伴有IDH1和IDH2的患者常预后不良[2],在国内对特异的靶向药物IDH1抑制剂ivosidenib和IDH2抑制剂enasidenib可及性不高的情况下,我们采用Bcl-2抑制剂维奈克拉(VEN)治疗30例伴IDH1/2基因突变的AML患者,观察其疗效及不良反应,现报道如下。