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鞘氨醇单胞菌TP-3中基因spsK的克隆及生物信息学分析
1
作者
黄海东
詹欣娜
李娜
《天津农学院学报》
CAS
2013年第3期1-4,共4页
以自杀性质粒pUT携带的mini-Tn5转座子对菌株TP-3进行转座诱变,从转座突变库中筛选到不能合成产物鞘氨醇胶Ss的突变株,进而采用Tn5外向扩增与LP-RAPD相结合的方法,得到糖基转移酶编码基因spsK的801 bp序列全长。生物信息学分析表明,其...
以自杀性质粒pUT携带的mini-Tn5转座子对菌株TP-3进行转座诱变,从转座突变库中筛选到不能合成产物鞘氨醇胶Ss的突变株,进而采用Tn5外向扩增与LP-RAPD相结合的方法,得到糖基转移酶编码基因spsK的801 bp序列全长。生物信息学分析表明,其氨基酸序列与迪特胶以及S88合成途径中的糖基转移酶同源性最高,达47%;SpsK蛋白具有典型的G-loop和DXD保守模式,属于糖基转移酶的GT-A家族。
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关键词
鞘氨醇单胞菌
鞘氨醇胶Ss
糖基转移酶
生物信息学
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题名
鞘氨醇单胞菌TP-3中基因spsK的克隆及生物信息学分析
1
作者
黄海东
詹欣娜
李娜
机构
天津农学院农学系
出处
《天津农学院学报》
CAS
2013年第3期1-4,共4页
基金
天津市自然科学基金重点项目"新型鞘氨醇胶合成关键基因的研究"(11JCZDJC16600)
文摘
以自杀性质粒pUT携带的mini-Tn5转座子对菌株TP-3进行转座诱变,从转座突变库中筛选到不能合成产物鞘氨醇胶Ss的突变株,进而采用Tn5外向扩增与LP-RAPD相结合的方法,得到糖基转移酶编码基因spsK的801 bp序列全长。生物信息学分析表明,其氨基酸序列与迪特胶以及S88合成途径中的糖基转移酶同源性最高,达47%;SpsK蛋白具有典型的G-loop和DXD保守模式,属于糖基转移酶的GT-A家族。
关键词
鞘氨醇单胞菌
鞘氨醇胶Ss
糖基转移酶
生物信息学
Keywords
Sphingomonas sp.
sphingan Ss
glycosyl transferase
bioinformatics
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鞘氨醇单胞菌TP-3中基因spsK的克隆及生物信息学分析
黄海东
詹欣娜
李娜
《天津农学院学报》
CAS
2013
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