基于链接聚类的代谢网络社团结构研究

社团结构分析有助于识别代谢网络中的功能模块,有助于理解代谢网络的结构和功能关系,是代谢网络研究领域的一个重要研究课题。然而,当前的社团结构分析方法均依赖于对网络中的节点进行聚类分析,导致每个节点只能属于某一个社团。采用了一种对复杂网络中的链接进行聚类分析的方法,对高质量金黄色葡萄球菌代谢网络模型的巨强连通体进行了社团结构分析,得到了10个具有生物学意义的功能模块,结果表明链接聚类可用于识别新陈代谢网络中的功能社团。

基于PB和ORACLE的物流管理系统设计开发

物流管理系统是一个公司不可缺少的一部分,它能够为用户提供充足的信息和快捷的数据处理手段,保证了数据的完整和安全,实现了对商品的有效管理,从而提高企业市场竞争力。基于某一农药公司的物流管理需求,本文利用Power Builder和Oracle数据库工具设计一个合适的物流管理系统。该系统满足了该公司的物流管理需求,其功能包括基础信息的录入,基本信息的简单查询,以及对基础数据的统计。经过系统测试运行结果表明,基于PB和ORACLE设计的物流管理系统能够满足该公司的物流管理需要,并有助于该公司的办公自动化。

基于邻域信息的代价敏感三支决策文本情感分析模型

通常数据集的情感倾向具有代价敏感性,现有的分类算法并未考虑代价损失问题,使得分类损失较高。基于此,提出一种基于三支决策分类模型的文本情感分析模型,即基于邻域信息的代价敏感三支决策情感分析模型(EATWD)来挖掘文本中的情感类别。首先基于最小构造性覆盖的三支决策模型(MinCA)将所得文本向量划分为正域/负域和边界域。接着采用基于邻域信息的代价敏感方法进一步划分边界域,使得情感分析更加精确,降低分类损失。实验结果表明EATWD算法可以获得较高的准确率、较低的分类损失,在文本情感分析问题求解上具有一定的优势。

代谢网络结构与功能的复杂网络分析

细胞的新陈代谢过程可以抽象地描述成交互的复杂网络,越来越多的证据表明这种描述和分析有助于理解代谢网络的结构和功能。本文首先对高质量金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)代谢网络数据进行整理,构建了该网络中的所有代谢反应列表。随后用代谢物图(即节点表示代谢物,连线表示代谢反应)来表示这些反应,形成的网络包含了855个节点和1353条连线。最后用复杂网络理论分析了该网络的全局结构特征、巨强连通体的功能模块和关键节点等,并深入分析了网络的蝴蝶结结构,得到的功能模块以及关键节点的生物学功能意义。