目的:研究昆明山海棠-鸡血藤药对治疗类风湿关节炎的作用机制。方法:通过检索治疗靶点数据库(TTD)、药物银行(DrugBank)和DisGeNET数据库获取类风湿关节炎靶点,并构建靶点互作(PPI)网络筛选关键靶点。以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性...目的:研究昆明山海棠-鸡血藤药对治疗类风湿关节炎的作用机制。方法:通过检索治疗靶点数据库(TTD)、药物银行(DrugBank)和DisGeNET数据库获取类风湿关节炎靶点,并构建靶点互作(PPI)网络筛选关键靶点。以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18、半衰期(HL)≥4 h为指标,借助中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)和中药综合数据库(TCMID)获取昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分,并预测其靶点,构建昆明山海棠-鸡血藤药对活性成分-靶点网络;借助Systems Dock Web Site在线平台、Genomics平台筛选昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分和类风湿关节炎的共有靶点,然后利用Cytoscape3.2.1软件中Cluego插件分析共有靶点的京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路。结果:共检索到类风湿关节炎靶点1 956个,其中关键靶点11个[包括白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等];昆明山海棠-鸡血藤药对共筛选出30种活性成分(包括木犀草素、芒柄花黄素、β-谷甾醇、雷公藤甲素等)和229个靶点。昆明山海棠-鸡血藤药对和类风湿关节炎的共有靶点有37个[包括基质金属蛋白2(MMP2)、TNF、VEGFA等];参与的KEGG信号通路有细胞凋亡、IL-17信号通路、Th17细胞分化信号通路、TNF信号通路等。结论:昆明山海棠-鸡血藤药对可能通过MMP2、TNF、VEGFA等靶点作用于细胞凋亡、IL-17信号通路等多条信号通路发挥治疗类风湿关节炎的作用,本研究结果可为进一步研究昆明山海棠-鸡血藤药对治疗类风湿关节炎的作用机制提供参考。展开更多
目的:探讨牛膝-续断药对治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的药效物质基础与潜在的作用机制。方法:依托Therapeutic Target Database(TTD)、DrugBank疾病数据库检索出RA已知的靶点,通过中药系统药理学分析平台(Traditional Chi...目的:探讨牛膝-续断药对治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的药效物质基础与潜在的作用机制。方法:依托Therapeutic Target Database(TTD)、DrugBank疾病数据库检索出RA已知的靶点,通过中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)找出牛膝-续断的所有化学成分。根据药物口服生物利用度(oral bioavailability,OB)、类药性(drug-likeness,DL)、药物半衰期(drug half-life,HL)等条件筛选成分,列出与其相关的所有潜在靶点。使用韦恩图工具得出疾病靶点和中药成分靶点的共同靶点信息。运用STRING数据库,构建靶蛋白互作(proteinprotein interaction,PPI)网络模型。运用Cytoscape软件插件ClueGO进行KEGG通路注释分析,筛选并得出通路。运用Cytoscape软件构建成分-信号通路-共同靶点网络图。结果:得到RA靶点241个,续断4个成分,牛膝8个成分,药对总计201个靶点。疾病与成分共同靶点为39个。KEGG通路注释分析共得出62条通路。通过网络图预测出药对关键作用成分为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、黄芩素、龙胆根素,关键靶点为TNF,JUN,PTGS2,NFKBIA,IL6,MAPK14,IL1B,关键信号通路为IL-17信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、NOD样受体信号通路、破骨细胞分化、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路、NF-κB信号通路、类风湿关节炎。结论:牛膝-续断药对通过槲皮素、山柰酚等成分,作用于TNF,JUN,PTGS2等靶点,IL-17信号通路、TNF信号通路等通路参与其中,在RA中发挥抗炎、免疫保护等治疗作用。展开更多
文摘目的:研究昆明山海棠-鸡血藤药对治疗类风湿关节炎的作用机制。方法:通过检索治疗靶点数据库(TTD)、药物银行(DrugBank)和DisGeNET数据库获取类风湿关节炎靶点,并构建靶点互作(PPI)网络筛选关键靶点。以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18、半衰期(HL)≥4 h为指标,借助中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)和中药综合数据库(TCMID)获取昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分,并预测其靶点,构建昆明山海棠-鸡血藤药对活性成分-靶点网络;借助Systems Dock Web Site在线平台、Genomics平台筛选昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分和类风湿关节炎的共有靶点,然后利用Cytoscape3.2.1软件中Cluego插件分析共有靶点的京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路。结果:共检索到类风湿关节炎靶点1 956个,其中关键靶点11个[包括白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等];昆明山海棠-鸡血藤药对共筛选出30种活性成分(包括木犀草素、芒柄花黄素、β-谷甾醇、雷公藤甲素等)和229个靶点。昆明山海棠-鸡血藤药对和类风湿关节炎的共有靶点有37个[包括基质金属蛋白2(MMP2)、TNF、VEGFA等];参与的KEGG信号通路有细胞凋亡、IL-17信号通路、Th17细胞分化信号通路、TNF信号通路等。结论:昆明山海棠-鸡血藤药对可能通过MMP2、TNF、VEGFA等靶点作用于细胞凋亡、IL-17信号通路等多条信号通路发挥治疗类风湿关节炎的作用,本研究结果可为进一步研究昆明山海棠-鸡血藤药对治疗类风湿关节炎的作用机制提供参考。
文摘目的:探讨牛膝-续断药对治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的药效物质基础与潜在的作用机制。方法:依托Therapeutic Target Database(TTD)、DrugBank疾病数据库检索出RA已知的靶点,通过中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)找出牛膝-续断的所有化学成分。根据药物口服生物利用度(oral bioavailability,OB)、类药性(drug-likeness,DL)、药物半衰期(drug half-life,HL)等条件筛选成分,列出与其相关的所有潜在靶点。使用韦恩图工具得出疾病靶点和中药成分靶点的共同靶点信息。运用STRING数据库,构建靶蛋白互作(proteinprotein interaction,PPI)网络模型。运用Cytoscape软件插件ClueGO进行KEGG通路注释分析,筛选并得出通路。运用Cytoscape软件构建成分-信号通路-共同靶点网络图。结果:得到RA靶点241个,续断4个成分,牛膝8个成分,药对总计201个靶点。疾病与成分共同靶点为39个。KEGG通路注释分析共得出62条通路。通过网络图预测出药对关键作用成分为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、黄芩素、龙胆根素,关键靶点为TNF,JUN,PTGS2,NFKBIA,IL6,MAPK14,IL1B,关键信号通路为IL-17信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、NOD样受体信号通路、破骨细胞分化、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路、NF-κB信号通路、类风湿关节炎。结论:牛膝-续断药对通过槲皮素、山柰酚等成分,作用于TNF,JUN,PTGS2等靶点,IL-17信号通路、TNF信号通路等通路参与其中,在RA中发挥抗炎、免疫保护等治疗作用。
