Illumina测序16S rRNA标签法分析细菌性阴道病患者阴道菌群多样性

目的从菌群总体角度分析和比较健康育龄期女性和细菌性阴道病(BV)患者阴道菌群差异。方法采集临床Amsel标准及Nugent评分筛选的37例BV患者及37例健康育龄期女性阴道穹窿分泌物标本,提取总基因组DNA,对16S rRNA V6区基因进行扩增,所有扩增的PCR产物经IIlumina测序后,通过BIPES、UCHIME、TSC、GAST最终得到样品的物种信息。结果健康育龄期女性阴道分泌物乳酸杆菌占95%以上,单独以惰性乳酸杆菌或卷曲乳酸杆菌为主,或者两者比例相当,同时存在少量加德纳氏菌属,颗粒链球菌属,链球菌属,普氏菌菌属,埃希氏杆菌属和其它菌属;30例BV患者阴道菌群Alpha多样性明显增加(P<0.001),Beta多样性也发生了明显变化,表现为乳酸杆菌明显减少,其相对比例从45%到1%(24例),以惰性乳酸杆菌为主,部分患者(6例)甚至未检出,同时加德纳氏菌属,普氏菌菌属,颗粒链球菌属,厌氧球菌,微单胞菌属,Peptoniphilus.harei-消化链球菌属,戴阿李斯特杆菌属等相对丰富度增加,不同于既往研究的是7例BV患者以少见的格氏乳杆菌,嗜酸乳杆菌为优势菌群,约占75%～50%。结论健康育龄女性阴道菌群以乳酸杆菌占绝对优势,单独以惰性乳酸杆菌或卷曲乳酸杆菌为主,或者两者相当,并与多种微生物并存;大部分BV患者阴道菌群表现为乳酸杆菌显著减少甚至缺失,小部分BV患者以少见的格氏乳酸杆菌、嗜酸乳酸杆菌为优势菌群。

叶酸在预防胎源性子宫内膜异位症易感基因HOXA10异常甲基化中的作用

目的通过检测和比较子宫内膜异位症（EMS）孕妇有无补充叶酸其女性胎儿脐血EMs易感基因HOXA10启动CpG岛甲基化状态，探讨叶酸优化官内环境的作用。方法收集标本2010年1月,--2012年12月21例患有EMS孕妇服用和15例未服用叶酸的女陛胎儿脐血标本，利用甲基化特异性聚合酶链反应（MsP）及亚硫酸氢盐g-c,后测序（BSP）检测和比较各组HOXA10的甲基化率。结果补充叶酸组女性胎JLEMS易感基因HOXA10甲基化率显著降低，两组差异有统计学意义（P〈0．05）。结论提示叶酸在预防胎源性EMS易感基因HOXA10异常甲基化中可能起一定作用。

子宫内膜异位症孕妇女性胎儿HOXA10基因异常甲基化观察及意义

目的检测子宫内膜异位症孕妇及正常孕妇其女性胎儿脐血子宫内膜异位症易感基因HOXA10甲基化状态,分析内异症的家族遗传性。方法收集15例内异症孕妇及26例正常孕妇女性胎儿的脐血标本(分别为内异症组及正常组)。分别采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)及亚硫酸氢盐修饰后测序法(BSP)检测两组HOXA10基因的甲基化程度。结果两种方法检测内异症组HOXA10甲基化率均显著高于正常组,P均<0.05。结论从表观遗传学上讲内异症可能具有家族遗传性。