云南萝芙木异胡豆苷合成酶基因的克隆与分析

以云南萝芙木叶片为材料,通过RT-PCR方法首次克隆了云南萝芙木萜类吲哚生物碱(terpenoid indole alkaloids,TIAs)次生代谢的合成途径中重要的限速酶——异胡豆苷合成酶(strictosidine synthase,STR)的基因并进行了生物信息学分析。生物信息学分析表明,该基因的编码区长度为1 038 bp,编码345个氨基酸的多肽,等电点为5.06,N-端有一长度为27个氨基酸参与分泌的信号肽。二级结构预测指出,延伸链和不规则盘绕是STR蛋白质最大量的结构元件,而α-螺旋和β-转角则散布于整个蛋白质。同源性分析则表明,云南萝芙木中的STR和其它植物来源的STR同源,使用MEGA5.1构建了植物的STR分子系统进化树。

中国桃金娘群落分布北线的划定及其与气候因子的关系

桃金娘是一种对温度变化敏感,传播迅速,具有气候指示作用的热带性灌木。调查其群落分布现状,分析气候因子与群落分布的关系可以为气候变化研究提供有力的依据。本研究通过调查桃金娘群落分布确定了其分布北线为25°18′N至26°18′N,从贵州荔波县逐渐向北偏斜至福建连江县。利用标准差SD分析法确定了影响桃金娘分布的主导气候因子为积温和生长季节的温暖程度(>10℃),最低平均气温和降水量为非主导因子。

广西壳菜果遗传多样性的ISSR研究

利用ISSR分子标记技术,对广西壳菜果4个自然种群共43个个体进行了遗传多样性研究.结果表明,广西壳菜果天然种群总体水平的遗传多样性较高,各个种群的遗传多样性水平存在差异,其中广西凭祥种群的遗传多样性水平最高,广西那坡种群的最低.通过PopGen32分析表明:有82.43%的遗传变异存在于种群内,而17.57%的遗传变异存在于种群间,遗传分化系数(Gst)为0.175 8,种群间的基因流(Nm)为2.344 7,种群间的遗传分化程度较低,基因流动足以抵制遗传漂变的影响.利用UPGMA法对4个种群进行聚类分析显示:广西凭祥、广西德保和广西靖西3个种群聚为一类,广西那坡种群单独聚为一类.

壳菜果ISSR-PCR反应体系的建立与优化

为建立一个稳定、可重复的壳菜果ISSR-PCR反应体系,以壳菜果的总DNA为试验材料,通过单因素试验、正交试验和方差分析对模板DNA浓度、dNTPs浓度、镁离子浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶浓度5个因素进行研究,确定了壳菜果ISSR-PCR反应的最优体系为:在20μL的反应体系中模板DNA为30ng,dNTPs浓度为0.20mmol/L,Mg2+浓度为2.75mmol/L,引物浓度为0.6μmol/L,TaqDNA聚合酶为2.2U。方差分析表明:5个因素中只有Mg2+浓度对反应体系影响最大,达到了显著性水平。