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TRIP13通过同源重组通路提高肺腺癌细胞的放射抗性
1
作者
葛舒童
谷润川
+3 位作者
杨雄涛
许长丹
王诗杰
朱广迎
《中国肺癌杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期1-12,共12页
背景与目的放疗是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)最常用的治疗手段之一。然而,一部分肿瘤细胞对放射线的不敏感是放疗疗效差、患者预后不良的重要原因之一,探究放射抵抗背后的深层机制是解决这一临床难题的关键。本研...
背景与目的放疗是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)最常用的治疗手段之一。然而,一部分肿瘤细胞对放射线的不敏感是放疗疗效差、患者预后不良的重要原因之一,探究放射抵抗背后的深层机制是解决这一临床难题的关键。本研究旨在寻找与肺腺癌(lungadenocarcinoma,LUAD)放射抵抗相关的分子,初步经数据库筛选锁定甲状腺素受体结合因子13(thyroid hormone receptor interactor 13,TRIP13)为主要研究对象,并探索TRIP13是否与LUAD的放射抵抗有关及具体机制,以期为临床接受放疗的LUAD患者的联合治疗提供理论依据和潜在靶点。方法选取基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中的GSE18842、GSE19188和GSE33532共3个数据集,借助R 4.1.3软件分别筛选3个数据集中差异表达的基因(|logFC|>1.5,P<0.05),之后使用Venn diagram找出在3个数据集中共有的差异表达基因。随后,借助STRING在线工具和Cytoscape软件,对筛选出来的差异基因进行蛋白质相互作用分析和模块分析,借助Kaplan-Meier Plotter数据库对各基因进行生存预后分析,并确定TRIP13基因作为后续主要研究分子。随后,采用亚致死性剂量照射法对人LUAD细胞系H292进行多次X射线照射,以构建具有放射抗性的细胞系H292DR。采用细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)实验和克隆形成实验验证H292DR细胞的放射抗性能力。Western blot检测H292细胞和H292DR细胞中TRIP13蛋白的表达水平。使用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)沉默H292DR细胞中TRIP 13蛋白的表达并进行Western blot检测。观察TRIP13沉默后H292DR细胞的克隆形成能力和迁移能力,随后检测共济失调-毛细血管扩张突变(ataxia telangiectasia mutated,ATM)蛋白等与同源重组密切相关的蛋白的表达水平变化。结果经多个GEO数据集筛选、外部数据集的验证以及生存分析发现,TRIP13在LUAD中高表达,并与接受过放疗的LUAD患者的不良预后有关;并且,TRIP13基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)的结果提示,TRIP13可能通过促进放疗后的同源重组修复而与LUAD放射抵抗有密切关联。经实验检测发现,TRIP13的表达在H292DR中上调,而沉默TRIP13后能够增加H292DR细胞对放射线的敏感性。结论TRIP13与接受放疗后的LUAD患者的预后不良有关,可能是通过促进同源重组修复途径来介导LUAD细胞对放射线的抵抗。
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关键词
肺肿瘤
放射抵抗
TRIP13蛋白
同源重组
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职称材料
局限期小细胞肺癌同步放化疗中不同靶区勾画模式对疗效及毒性反应影响的对比研究
被引量:
3
2
作者
高立伟
杨雄涛
+2 位作者
谷润川
许长丹
朱广迎
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期390-394,400,共6页
目的探讨局限期小细胞肺癌(LD-SCLC)同步放化疗中原发灶大体靶区(GTV_(primary))扩大与不扩大临床靶区(CTV)2种靶区勾画模式对疗效及毒性反应的影响。方法回顾性分析2016年10月至2020年10月中日友好医院放射肿瘤科收治的89例接受同步放...
目的探讨局限期小细胞肺癌(LD-SCLC)同步放化疗中原发灶大体靶区(GTV_(primary))扩大与不扩大临床靶区(CTV)2种靶区勾画模式对疗效及毒性反应的影响。方法回顾性分析2016年10月至2020年10月中日友好医院放射肿瘤科收治的89例接受同步放化疗的LD-SCLC病例资料,其中,45例接受了GTV_(primary)外扩的治疗方案(A组),44例接受了GTV_(primary)不外扩的治疗方案(B组)。比较分析2组治疗的有效率、毒性反应发生率及远期生存等指标。结果86例患者中位随访时间21.3个月(3.2~60.8个月)。A组与B组患者的近期有效率分别为79.1%和76.7%(P=0.795),总体局部进展率为37.2%,中位无进展生存时间分别为13.2和12.1个月(P=0.648),中位总生存时间分别为21.5和20.3个月(P=0.667),包括一线治疗进展模式在内,2组间均无统计学差异。3度及以上放射性肺炎A组为16.3%,B组为4.5%,A组有增高的趋势(P=0.078)。结论同步放化疗过程中,原发灶肿瘤靶区GTV_(primary)不外扩CTV并不影响患者的近期和远期疗效,且能降低放化疗过程中的3度及以上放射性肺炎的发生概率。
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关键词
肺癌
局限期小细胞肺癌
同步放化疗
放射治疗靶区
放射性肺炎
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职称材料
外壳蛋白ε在非小细胞肺癌中作用的探索
3
作者
谷润川
杨雄涛
+4 位作者
王国辉
许长丹
葛舒童
王昊
高立伟
《中日友好医院学报》
CAS
2022年第5期272-277,F0002,共7页
目的:对外壳蛋白ε与非小细胞肺癌的关系、唾液酸化免疫球蛋白G的结合及其与肺癌的关系进行探索。方法:通过细胞照射、免疫沉淀联合质谱分析研究唾液酸化免疫球蛋白与外壳蛋白ε的结合;依托TCGA、GEO、GTEx、HPA、EGA及KM plotter公共...
目的:对外壳蛋白ε与非小细胞肺癌的关系、唾液酸化免疫球蛋白G的结合及其与肺癌的关系进行探索。方法:通过细胞照射、免疫沉淀联合质谱分析研究唾液酸化免疫球蛋白与外壳蛋白ε的结合;依托TCGA、GEO、GTEx、HPA、EGA及KM plotter公共数据库数据,使用R对外壳蛋白ε与非小细胞肺癌的关联及机制进行分析。结果:外壳蛋白ε与唾液酸化免疫球蛋白G结合且在射线照射后升高,在非小细胞肺癌中高表达并与分期和不良预后相关,其与多种促肿瘤通路正相关并与多种抗肿瘤通路负相关。结论:外壳蛋白ε与唾液酸化免疫球蛋白相互作用,并在非小细胞肺癌中发挥促肿瘤效应。
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关键词
唾液酸化免疫球蛋白G
外壳蛋白ε
非小细胞肺癌
生物信息学
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职称材料
题名
TRIP13通过同源重组通路提高肺腺癌细胞的放射抗性
1
作者
葛舒童
谷润川
杨雄涛
许长丹
王诗杰
朱广迎
机构
北京大学中日友好临床医学院放射肿瘤科
中日友好临床研究所
北京市昌平区医院肿瘤科
中国医学科学院北京协和医学院中日友好医院放射肿瘤科
出处
《中国肺癌杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期1-12,共12页
基金
中日友好医院人才引进科研启动基金项目(No.2016-RC-4)资助。
文摘
背景与目的放疗是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)最常用的治疗手段之一。然而,一部分肿瘤细胞对放射线的不敏感是放疗疗效差、患者预后不良的重要原因之一,探究放射抵抗背后的深层机制是解决这一临床难题的关键。本研究旨在寻找与肺腺癌(lungadenocarcinoma,LUAD)放射抵抗相关的分子,初步经数据库筛选锁定甲状腺素受体结合因子13(thyroid hormone receptor interactor 13,TRIP13)为主要研究对象,并探索TRIP13是否与LUAD的放射抵抗有关及具体机制,以期为临床接受放疗的LUAD患者的联合治疗提供理论依据和潜在靶点。方法选取基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中的GSE18842、GSE19188和GSE33532共3个数据集,借助R 4.1.3软件分别筛选3个数据集中差异表达的基因(|logFC|>1.5,P<0.05),之后使用Venn diagram找出在3个数据集中共有的差异表达基因。随后,借助STRING在线工具和Cytoscape软件,对筛选出来的差异基因进行蛋白质相互作用分析和模块分析,借助Kaplan-Meier Plotter数据库对各基因进行生存预后分析,并确定TRIP13基因作为后续主要研究分子。随后,采用亚致死性剂量照射法对人LUAD细胞系H292进行多次X射线照射,以构建具有放射抗性的细胞系H292DR。采用细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)实验和克隆形成实验验证H292DR细胞的放射抗性能力。Western blot检测H292细胞和H292DR细胞中TRIP13蛋白的表达水平。使用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)沉默H292DR细胞中TRIP 13蛋白的表达并进行Western blot检测。观察TRIP13沉默后H292DR细胞的克隆形成能力和迁移能力,随后检测共济失调-毛细血管扩张突变(ataxia telangiectasia mutated,ATM)蛋白等与同源重组密切相关的蛋白的表达水平变化。结果经多个GEO数据集筛选、外部数据集的验证以及生存分析发现,TRIP13在LUAD中高表达,并与接受过放疗的LUAD患者的不良预后有关;并且,TRIP13基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)的结果提示,TRIP13可能通过促进放疗后的同源重组修复而与LUAD放射抵抗有密切关联。经实验检测发现,TRIP13的表达在H292DR中上调,而沉默TRIP13后能够增加H292DR细胞对放射线的敏感性。结论TRIP13与接受放疗后的LUAD患者的预后不良有关,可能是通过促进同源重组修复途径来介导LUAD细胞对放射线的抵抗。
关键词
肺肿瘤
放射抵抗
TRIP13蛋白
同源重组
Keywords
Lung neoplasms
Radioresistance
TRIP13 protein
Homologous recombination
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
局限期小细胞肺癌同步放化疗中不同靶区勾画模式对疗效及毒性反应影响的对比研究
被引量:
3
2
作者
高立伟
杨雄涛
谷润川
许长丹
朱广迎
机构
中日友好医院放射肿瘤科
北京大学中日友好临床医学院放射肿瘤科
出处
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期390-394,400,共6页
基金
科技部国家重点研发计划(2018YFC1313202)。
文摘
目的探讨局限期小细胞肺癌(LD-SCLC)同步放化疗中原发灶大体靶区(GTV_(primary))扩大与不扩大临床靶区(CTV)2种靶区勾画模式对疗效及毒性反应的影响。方法回顾性分析2016年10月至2020年10月中日友好医院放射肿瘤科收治的89例接受同步放化疗的LD-SCLC病例资料,其中,45例接受了GTV_(primary)外扩的治疗方案(A组),44例接受了GTV_(primary)不外扩的治疗方案(B组)。比较分析2组治疗的有效率、毒性反应发生率及远期生存等指标。结果86例患者中位随访时间21.3个月(3.2~60.8个月)。A组与B组患者的近期有效率分别为79.1%和76.7%(P=0.795),总体局部进展率为37.2%,中位无进展生存时间分别为13.2和12.1个月(P=0.648),中位总生存时间分别为21.5和20.3个月(P=0.667),包括一线治疗进展模式在内,2组间均无统计学差异。3度及以上放射性肺炎A组为16.3%,B组为4.5%,A组有增高的趋势(P=0.078)。结论同步放化疗过程中,原发灶肿瘤靶区GTV_(primary)不外扩CTV并不影响患者的近期和远期疗效,且能降低放化疗过程中的3度及以上放射性肺炎的发生概率。
关键词
肺癌
局限期小细胞肺癌
同步放化疗
放射治疗靶区
放射性肺炎
Keywords
lung cancer
limited disease small cell lung cancer
concurrent chemoraditherapy
radiation target
radiation pneumonia
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
外壳蛋白ε在非小细胞肺癌中作用的探索
3
作者
谷润川
杨雄涛
王国辉
许长丹
葛舒童
王昊
高立伟
机构
中日友好临床医学研究所
昌平区医院肿瘤科
天津市第一中心医院放射治疗科
北京大学中日友好临床医学院
中日友好医院放射肿瘤科
出处
《中日友好医院学报》
CAS
2022年第5期272-277,F0002,共7页
文摘
目的:对外壳蛋白ε与非小细胞肺癌的关系、唾液酸化免疫球蛋白G的结合及其与肺癌的关系进行探索。方法:通过细胞照射、免疫沉淀联合质谱分析研究唾液酸化免疫球蛋白与外壳蛋白ε的结合;依托TCGA、GEO、GTEx、HPA、EGA及KM plotter公共数据库数据,使用R对外壳蛋白ε与非小细胞肺癌的关联及机制进行分析。结果:外壳蛋白ε与唾液酸化免疫球蛋白G结合且在射线照射后升高,在非小细胞肺癌中高表达并与分期和不良预后相关,其与多种促肿瘤通路正相关并与多种抗肿瘤通路负相关。结论:外壳蛋白ε与唾液酸化免疫球蛋白相互作用,并在非小细胞肺癌中发挥促肿瘤效应。
关键词
唾液酸化免疫球蛋白G
外壳蛋白ε
非小细胞肺癌
生物信息学
Keywords
sialylated immunoglobulin G
coatomer subunitε
non-small cell lung cancer
bioinformatics
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
TRIP13通过同源重组通路提高肺腺癌细胞的放射抗性
葛舒童
谷润川
杨雄涛
许长丹
王诗杰
朱广迎
《中国肺癌杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
局限期小细胞肺癌同步放化疗中不同靶区勾画模式对疗效及毒性反应影响的对比研究
高立伟
杨雄涛
谷润川
许长丹
朱广迎
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
下载PDF
职称材料
3
外壳蛋白ε在非小细胞肺癌中作用的探索
谷润川
杨雄涛
王国辉
许长丹
葛舒童
王昊
高立伟
《中日友好医院学报》
CAS
2022
0
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职称材料
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