芯片数据标准化方法比较研究

在基因芯片实验中,基因表达水平之间的相关性在推断基因间相互关系时起到非常重要的作用.未经标准化处理的芯片数据基因之间往往都呈现出很强的相关性,这些高相关性一部分是由基因表达水平变化引起的,而另外一部分是由系统偏差引起的.对芯片数据进行标准化处理的目的之一是消除系统偏差引起的高相关性,同时保留由真正生物学原因引起的基因表达水平高相关性.虽然目前对标准化方法已经有了不少比较研究,但还较少有人研究标准化方法对基因之间相关系数的影响,以及哪种方法最有利于恢复基因之间的相关性结构.通过对基因表达水平数据的模拟,具体比较了几种常用标准化方法的效果,从而给出最有利于恢复基因之间相关性结构的那种标准化方法.

谣言传播的Potts模型中的正则和微正则相变

使用1个新的非扩展能量模型研究统计物理学中的系综等效性问题.利用模型系统的配分函数和自旋组态数,分别在正则和微正则系综下计算系统的热力学函数自由能和熵等.计算结果显示,模型系统在正则描述下出现一级相变,而在微正则描述下不出现,表明正则和微正则系综对该系统相变级数的描述不等效.通过与其它模型比较可以预见,系综不等效可能是所有非扩展能量类系统共同的性质.这一结果为非扩展统计力学框架内的系综等效性研究提供新的证据.

50株麻风菌基因分型的初步研究

目的了解中国麻风菌基因分型图谱,以选择合适麻风病流行病学研究的基因位点。方法从云南省文山州的37例、其他省市的13例麻风患者的皮损活检中,提取麻风菌DNA。以麻风菌基因组内的可变数目的串联重复序列(VNTR)为基因分型的基础,对11个位点进行聚合酶链反应,确定其重复序列的拷贝数。结果中国麻风菌株在GGT5、12-5、21-3、23-3位点的同一性高达 100％;12-5位点仅表现为3个拷贝;AC8、18-8、27-5、rpoT的同一性分别达97％、94％、97％、85％; GTA9、6-7、AC9位点有非常明显的多样性,但GTA9的多样性与其他国家不同。结论中国麻风菌株多数位点的基因型与印度、菲律宾的菌株一致,提示中国麻风菌株与印度和菲律宾的菌株相近; 12-5位点可作为区别中国与周边国家麻风菌株基因分型的标记物;VNTR基因分型方法可应用于麻风病传播链和分布的流行病学研究。