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大豆GmAAP基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
1
作者
王俊皓
谢五洋
+3 位作者
徐华祥
袁学顺
周莹
崔喜艳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期705-712,共8页
本研究以大豆Williams 82为实验材料,采用RT-PCR技术克隆到了GmAAP基因,其开放阅读框长度为1440 bp,编码479个氨基酸。生物信息学分析表明,GmAAP蛋白分子量为53.286 kD,理论等电点为8.93,不稳定指数为34.04,属于稳定的蛋白结构;其二级...
本研究以大豆Williams 82为实验材料,采用RT-PCR技术克隆到了GmAAP基因,其开放阅读框长度为1440 bp,编码479个氨基酸。生物信息学分析表明,GmAAP蛋白分子量为53.286 kD,理论等电点为8.93,不稳定指数为34.04,属于稳定的蛋白结构;其二级结构中α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规卷曲分别占据47.18%、15.66%、2.71%、34.45%;跨膜区与疏水性分析显示其含有10个跨膜区,且构成跨膜区的氨基酸多为疏水性氨基酸;GmAAP与野生大豆AAP6亲缘关系最为相近,且序列比对的一致性为100%,可能为大豆AAP6基因。构建融合表达载体,利用PEG-Ca2+介导法转化拟南芥原生质体进行亚细胞定位分析,结果显示GmAAP定位在质膜上。AAP能提高豆科植物对外源氮的吸收与利用率,进而增加种子内贮藏蛋白含量,提升大豆品质。本研究的结果可为GmAAP功能的进一步研究奠定基础,同时也为氮素的高效利用提供候选基因。
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关键词
大豆
氨基酸通透酶
基因克隆
生物信息学分析
亚细胞定位
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职称材料
题名
大豆GmAAP基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
1
作者
王俊皓
谢五洋
徐华祥
袁学顺
周莹
崔喜艳
机构
吉林农业大学生命科学学院
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期705-712,共8页
基金
吉林省自然科学基金项目(主题科学家专项)(20180101026)
吉林省教育厅“十三五”科学技术项目基金(JJKH20170307KJ)
吉林农业大学国家级大学生创新项目(201610193047)
文摘
本研究以大豆Williams 82为实验材料,采用RT-PCR技术克隆到了GmAAP基因,其开放阅读框长度为1440 bp,编码479个氨基酸。生物信息学分析表明,GmAAP蛋白分子量为53.286 kD,理论等电点为8.93,不稳定指数为34.04,属于稳定的蛋白结构;其二级结构中α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规卷曲分别占据47.18%、15.66%、2.71%、34.45%;跨膜区与疏水性分析显示其含有10个跨膜区,且构成跨膜区的氨基酸多为疏水性氨基酸;GmAAP与野生大豆AAP6亲缘关系最为相近,且序列比对的一致性为100%,可能为大豆AAP6基因。构建融合表达载体,利用PEG-Ca2+介导法转化拟南芥原生质体进行亚细胞定位分析,结果显示GmAAP定位在质膜上。AAP能提高豆科植物对外源氮的吸收与利用率,进而增加种子内贮藏蛋白含量,提升大豆品质。本研究的结果可为GmAAP功能的进一步研究奠定基础,同时也为氮素的高效利用提供候选基因。
关键词
大豆
氨基酸通透酶
基因克隆
生物信息学分析
亚细胞定位
Keywords
soybean
amino acid permease
gene cloning
bioinformatics analysis
subcellular localization
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆GmAAP基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
王俊皓
谢五洋
徐华祥
袁学顺
周莹
崔喜艳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
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