珠江流域黄颡鱼群体的形态度量学与遗传多样性分析

为了解珠江流域黄颡鱼不同群体的遗传分化,以黄颡鱼为材料,通过形态度量学和分子生物学的方法对其进行研究。形态度量学的主成分分析(PCA)的散点图显示都柳江群体与漓江群体聚集于一处,东江群体与都柳江、漓江群体分开,表明东江群体与其它两个群体形态上有分化,漓江群体与都柳江群体形态间分化较小。D-loop序列分析最终检测到176个变异位点,单倍型36个,3个群体的平均碱基组成差异很小,且A+T含量(59.6%)高于G+C含量(40.4%),3个群体平均Nm=3.234,表明群体间存在较大基因流,单倍型NJ树显示漓江群体与都柳江群体聚为一支,东江群体聚为一支。3个群体21个微卫星标记位点的分析结果显示:3个群体有15个位点属于高度多态位点(PIC>0.5),3个群体基于Nei's遗传距离构建的UAPGM聚类结果与mt DNA D-loop聚类结果一致,与地理分布呈一定相关性。综合形态度量学与分子生物学标记结果可以看出,黄颡鱼3个群体存在一定形态差异,3个黄颡鱼野生群体遗传多样性水平较高。

珠江流域野生黄颡鱼Pelteobagrus fulvidraco的Cyt b基因序列分析

利用PCR技术扩增得到珠江水系5个江段共190尾野生黄颡鱼Pelteobagrus fulvidraco样品的线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因片段,并测定其序列,确定野生黄颡鱼的Cyt b基因片段全长为1 109 bp。在190尾样品中检测到43种不同的单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.848 57和0.04 817,呈高单倍型、低核苷酸多样性的分布模式,表明其遗传多样性属于中等水平。利用Clustal-X 1.81和MEGA 5.0软件对190尾样品进行同源基因序列分析,其A+T含量(55.1%)显著高于G+C含量(44.8%),碱基组成差异不大,分布比较平均。使用最大似然率法构建分子系统发生树,结果表明都匀江段与左江江段的遗传分化程度最大(Fst=0.414 30)。AMOVA分析显示,珠江水系野生黄颡鱼的遗传变异均来自群体内,达到75.23%,表明地理因素对黄颡鱼的遗传分化产生了一定的影响,聚类结果与地理分布存在一定的相关性。中性检验结果表明,各群体间没有发生过种群扩张,种群数量相对稳定。