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ITS2序列作为DNA条形码鉴定几种虎耳草科植物的有效性研究
被引量:
1
1
作者
任瑶瑶
郑颖
+3 位作者
柯家伟
姚雨庭
谢浈
蒋合众
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2023年第4期20-24,32,共6页
利用DNA条形码分子诊断技术对几种虎耳草科药用植物进行鉴定并评价ITS2序列对虎耳草科植物鉴定的有效性,为虎耳草科植物鉴定提供一种新思路。于不同区域采集13份虎耳草科植物样本,提取基因组DNA后,利用ITS2序列扩增引物进行PCR扩增及测...
利用DNA条形码分子诊断技术对几种虎耳草科药用植物进行鉴定并评价ITS2序列对虎耳草科植物鉴定的有效性,为虎耳草科植物鉴定提供一种新思路。于不同区域采集13份虎耳草科植物样本,提取基因组DNA后,利用ITS2序列扩增引物进行PCR扩增及测序,并从GenBank数据库中下载11条同属及同科序列。基于HHMer注释方法去掉两端区段获得ITS2序列,采用MEGA7.0软件进行序列长度、碱基含量对比,并基于K2P模型计算并分析种内、种间遗传距离,采用邻接法构建NJ系统进化树,采用靴带检验法(1000次重复)检验各分支的支持率,于ITS2数据库网站预测并比较ITS2序列的二级结构。结果显示,虎耳草科植物种间遗传距离大于种内遗传距离,能将各物种区分;系统进化树中各属分别聚为一支,同属内各物种大多分别聚为一小支,部分物种的鉴定需要进一步研究;各物种ITS2二级结构均存在不同差异,可对物种鉴定进行辅助分析。利用ITS2序列作为DNA条形码可有效地区分鉴别几种虎耳草科药用植物。
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关键词
虎耳草科
DNA条形码
ITS2序列
分子鉴定
遗传距离
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职称材料
高能重离子碰撞中心快度区鉴别粒子的平均横动量
2
作者
谢浈
李景行
+6 位作者
郑华
张文超
朱励霖
刘星泉
谭志光
周代梅
Bonasera Aldo
《物理学报》
SCIE
EI
CAS
2024年第18期98-111,共14页
末态粒子的平均横动量T>是高能重离子碰撞实验中的一个重要观测量.它反映了软质强子的特性和热核物质的性质,对其研究有助于获取碰撞系统的演化信息与规律.基于相对论重离子对撞机(RHIC)上的STAR、PHENIX实验组和大型强子对撞机(LHC)...
末态粒子的平均横动量T>是高能重离子碰撞实验中的一个重要观测量.它反映了软质强子的特性和热核物质的性质,对其研究有助于获取碰撞系统的演化信息与规律.基于相对论重离子对撞机(RHIC)上的STAR、PHENIX实验组和大型强子对撞机(LHC)的ALICE实验组提供的金核-金核(Au+Au)和铅核-铅核(Pb+Pb)碰撞中心快度区实验数据,唯象公式能很好地描述不同碰撞能量下,鉴别粒子平均横动量T>随碰撞中心度、每核子对的平均碰撞次数、每核子对平均产生的带电粒子多重数赝快度密度及每次碰撞平均产生的带电粒子多重数赝快度密度的依赖关系.结果表明,鉴别粒子平均横动量T>与碰撞中心度呈线性关系,而与每核子对的平均碰撞次数2N_(coll)/N_(part)、每核子对平均产生的带电粒子多重数赝快度密度2/N_(part)dN_(ch)/dη及每次碰撞平均产生的带电粒子多重数赝快度密度1/N_(coll)dN_(ch)/dη呈幂律关系.同时,发现鉴别粒子平均横动量T>与碰撞中心度以及每核子对的平均碰撞次数唯象公式中的拟合参数与碰撞能量呈现非常好的幂律函数关系.因此,碰撞中心度及每核子对的平均碰撞次数是研究鉴别粒子平均横动量的优选物理量.本文结果可用于对实验上在其他碰撞能量下鉴别粒子平均横动量的预测.
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关键词
重离子碰撞
平均横动量
鉴别粒子
中心快度区
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职称材料
题名
ITS2序列作为DNA条形码鉴定几种虎耳草科植物的有效性研究
被引量:
1
1
作者
任瑶瑶
郑颖
柯家伟
姚雨庭
谢浈
蒋合众
机构
西南交通大学化学学院
西南交通大学生命科学与工程学院
出处
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2023年第4期20-24,32,共6页
基金
四川省科技厅重点研发计划(2023YFQ0001)
四川省科技厅省院省校科技合作重点项目(2021YFSY0041)
西南交通大学2022年校级实验教学研究与改革项目(20221460)。
文摘
利用DNA条形码分子诊断技术对几种虎耳草科药用植物进行鉴定并评价ITS2序列对虎耳草科植物鉴定的有效性,为虎耳草科植物鉴定提供一种新思路。于不同区域采集13份虎耳草科植物样本,提取基因组DNA后,利用ITS2序列扩增引物进行PCR扩增及测序,并从GenBank数据库中下载11条同属及同科序列。基于HHMer注释方法去掉两端区段获得ITS2序列,采用MEGA7.0软件进行序列长度、碱基含量对比,并基于K2P模型计算并分析种内、种间遗传距离,采用邻接法构建NJ系统进化树,采用靴带检验法(1000次重复)检验各分支的支持率,于ITS2数据库网站预测并比较ITS2序列的二级结构。结果显示,虎耳草科植物种间遗传距离大于种内遗传距离,能将各物种区分;系统进化树中各属分别聚为一支,同属内各物种大多分别聚为一小支,部分物种的鉴定需要进一步研究;各物种ITS2二级结构均存在不同差异,可对物种鉴定进行辅助分析。利用ITS2序列作为DNA条形码可有效地区分鉴别几种虎耳草科药用植物。
关键词
虎耳草科
DNA条形码
ITS2序列
分子鉴定
遗传距离
Keywords
Saxifragaceae
DNA barcode
ITS2 sequence
molecular identification
genetic distance
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
高能重离子碰撞中心快度区鉴别粒子的平均横动量
2
作者
谢浈
李景行
郑华
张文超
朱励霖
刘星泉
谭志光
周代梅
Bonasera Aldo
机构
陕西师范大学物理学与信息技术学院
出处
《物理学报》
SCIE
EI
CAS
2024年第18期98-111,共14页
基金
国家自然科学基金(批准号:11905120)
华中师范大学夸克与轻子物理教育部重点实验室开放基金(批准号:QLPL2024P01)
四川省自然科学基金面上项目(批准号:2024NSFSC0420)资助的课题。
文摘
末态粒子的平均横动量T>是高能重离子碰撞实验中的一个重要观测量.它反映了软质强子的特性和热核物质的性质,对其研究有助于获取碰撞系统的演化信息与规律.基于相对论重离子对撞机(RHIC)上的STAR、PHENIX实验组和大型强子对撞机(LHC)的ALICE实验组提供的金核-金核(Au+Au)和铅核-铅核(Pb+Pb)碰撞中心快度区实验数据,唯象公式能很好地描述不同碰撞能量下,鉴别粒子平均横动量T>随碰撞中心度、每核子对的平均碰撞次数、每核子对平均产生的带电粒子多重数赝快度密度及每次碰撞平均产生的带电粒子多重数赝快度密度的依赖关系.结果表明,鉴别粒子平均横动量T>与碰撞中心度呈线性关系,而与每核子对的平均碰撞次数2N_(coll)/N_(part)、每核子对平均产生的带电粒子多重数赝快度密度2/N_(part)dN_(ch)/dη及每次碰撞平均产生的带电粒子多重数赝快度密度1/N_(coll)dN_(ch)/dη呈幂律关系.同时,发现鉴别粒子平均横动量T>与碰撞中心度以及每核子对的平均碰撞次数唯象公式中的拟合参数与碰撞能量呈现非常好的幂律函数关系.因此,碰撞中心度及每核子对的平均碰撞次数是研究鉴别粒子平均横动量的优选物理量.本文结果可用于对实验上在其他碰撞能量下鉴别粒子平均横动量的预测.
关键词
重离子碰撞
平均横动量
鉴别粒子
中心快度区
Keywords
heavy-ion collisions
average transverse momentum
identified particle
midrapidity
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ITS2序列作为DNA条形码鉴定几种虎耳草科植物的有效性研究
任瑶瑶
郑颖
柯家伟
姚雨庭
谢浈
蒋合众
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
高能重离子碰撞中心快度区鉴别粒子的平均横动量
谢浈
李景行
郑华
张文超
朱励霖
刘星泉
谭志光
周代梅
Bonasera Aldo
《物理学报》
SCIE
EI
CAS
2024
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引证文献
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