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基于数据挖掘和网络药理学探讨中药治疗肌肉萎缩的用药规律和作用机制
1
作者
陆哲
欧莉
+5 位作者
张萌萌
李瑶
谢硕男
康文倩
张依娜
王欣
《山西医科大学学报》
CAS
2023年第10期1410-1417,共8页
目的基于数据挖掘分析中药治疗肌肉萎缩的用药规律,运用网络药理学探究核心药对治疗肌肉萎缩的作用机制。方法收集整理中国知网和《中医方剂大辞典》治疗肌肉萎缩的相关方剂,利用中医传承辅助平台(V2.5)探讨用药规律,基于药物频数分析...
目的基于数据挖掘分析中药治疗肌肉萎缩的用药规律,运用网络药理学探究核心药对治疗肌肉萎缩的作用机制。方法收集整理中国知网和《中医方剂大辞典》治疗肌肉萎缩的相关方剂,利用中医传承辅助平台(V2.5)探讨用药规律,基于药物频数分析和关联分析获得核心药对。在中药系统药理学数据库与分析平台和Swiss Target Prediction数据库获得核心药对的化学成分及作用靶点,在OMIM、GeneCards和TTD数据库筛选疾病作用靶点,使用在线韦恩分析工具获得药物和疾病的交集靶点,在STRING数据库中进行交集靶点的蛋白质与蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,在Metascape数据库里完成交集靶点的GO及KEGG分析,最后采用分子对接技术完成核心成分和关键靶点的对接验证。结果数据挖掘共筛选出方剂182首,中药201味,以补虚药为主,其中黄芪-熟地黄支持度最高,作为核心药对。核心药对与肌肉萎缩的交集靶点有86个,对应16个化学成分,其中槲皮素、山奈酚和豆甾醇最为重要。经过PPI网络分析得到的关键靶点有AKT1、TNF和IL-6等。GO富集分析得到1616条生物过程,90条细胞组成,117条分子功能。KEGG通路分析得到176条相关信号通路,包括癌症通路、PI3K-Akt信号通路和HIF-1信号通路等。分子对接结果显示,核心成分与关键靶点对接良好,其中豆甾醇与AKT1的结合性最好。结论中药治疗肌肉萎缩以益胃养阴、补血滋阴、健脾益气为主。黄芪-熟地黄药对能通过多成分、多靶点、多通路来干预肌肉萎缩病程。
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关键词
数据挖掘
肌肉萎缩
网络药理学
黄芪-熟地黄
分子对接
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题名
基于数据挖掘和网络药理学探讨中药治疗肌肉萎缩的用药规律和作用机制
1
作者
陆哲
欧莉
张萌萌
李瑶
谢硕男
康文倩
张依娜
王欣
机构
陕西中医药大学药学院临床中药学教研室
出处
《山西医科大学学报》
CAS
2023年第10期1410-1417,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(81903877)
全国中药特色技术传承人才项目(T20234832005)
陕西省大学生创新创业项目(S202310716111)。
文摘
目的基于数据挖掘分析中药治疗肌肉萎缩的用药规律,运用网络药理学探究核心药对治疗肌肉萎缩的作用机制。方法收集整理中国知网和《中医方剂大辞典》治疗肌肉萎缩的相关方剂,利用中医传承辅助平台(V2.5)探讨用药规律,基于药物频数分析和关联分析获得核心药对。在中药系统药理学数据库与分析平台和Swiss Target Prediction数据库获得核心药对的化学成分及作用靶点,在OMIM、GeneCards和TTD数据库筛选疾病作用靶点,使用在线韦恩分析工具获得药物和疾病的交集靶点,在STRING数据库中进行交集靶点的蛋白质与蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,在Metascape数据库里完成交集靶点的GO及KEGG分析,最后采用分子对接技术完成核心成分和关键靶点的对接验证。结果数据挖掘共筛选出方剂182首,中药201味,以补虚药为主,其中黄芪-熟地黄支持度最高,作为核心药对。核心药对与肌肉萎缩的交集靶点有86个,对应16个化学成分,其中槲皮素、山奈酚和豆甾醇最为重要。经过PPI网络分析得到的关键靶点有AKT1、TNF和IL-6等。GO富集分析得到1616条生物过程,90条细胞组成,117条分子功能。KEGG通路分析得到176条相关信号通路,包括癌症通路、PI3K-Akt信号通路和HIF-1信号通路等。分子对接结果显示,核心成分与关键靶点对接良好,其中豆甾醇与AKT1的结合性最好。结论中药治疗肌肉萎缩以益胃养阴、补血滋阴、健脾益气为主。黄芪-熟地黄药对能通过多成分、多靶点、多通路来干预肌肉萎缩病程。
关键词
数据挖掘
肌肉萎缩
网络药理学
黄芪-熟地黄
分子对接
Keywords
data mining
muscle atrophy
network pharmacology
Radix Astragali-Radix Rehmanniae Preparata
molecular docking
分类号
R969 [医药卫生—药理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于数据挖掘和网络药理学探讨中药治疗肌肉萎缩的用药规律和作用机制
陆哲
欧莉
张萌萌
李瑶
谢硕男
康文倩
张依娜
王欣
《山西医科大学学报》
CAS
2023
0
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参考文献
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