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梭梭SCARECROW-like 30基因的克隆、表达及功能分析
被引量:
2
1
作者
彭洁莹
李彩弟
+4 位作者
刘洁
谭定权
王淑冉
赵忠
张胜
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1851-1863,共13页
SCARECROW-like(SCL)是GRAS转录因子中的重要成员,主要参与植物生长发育、逆境胁迫响应以及赤霉素(GA)信号转导调控等。本研究基于梭梭转录组数据克隆获得1条在干旱胁迫下显著上调表达的SCL基因,并命名为HaSCL30。HaSCL30全长编码序列(C...
SCARECROW-like(SCL)是GRAS转录因子中的重要成员,主要参与植物生长发育、逆境胁迫响应以及赤霉素(GA)信号转导调控等。本研究基于梭梭转录组数据克隆获得1条在干旱胁迫下显著上调表达的SCL基因,并命名为HaSCL30。HaSCL30全长编码序列(CDS)为2109 bp,编码702个氨基酸,预测蛋白分子量为78.37 kDa,理论等电点为5.57,为不稳定亲水性蛋白,具有GRAS超家族保守结构域。多序列比对及系统进化表明梭梭HaSCL30蛋白与同为C4植物的玉米ZmSCL30及同科植物甜菜BvSCL30同源性较高、亲缘关系较近。STRING蛋白互作分析预测出SCL30蛋白与转录因子WRKY33和ERF104具有共表达特征。HaSCL30基因在梭梭不同组织(子叶、同化枝及根)均有表达,在子叶中相对表达量最高。在干旱和盐胁迫下HaSCL30出现不同程度上调表达。亚细胞定位结果表明HaSCL30定位于细胞核和细胞膜。酵母异源表达结果显示,过表达HaSCL30能提高酵母耐盐和耐旱性。基于以上结果,HaSCL30可能参与荒漠植物梭梭的高盐、干旱胁迫响应,对其荒漠环境生存能力的提高存在正向调控作用。研究结果为进一步揭示HaSCL30在梭梭抗旱耐盐中的功能及作用机制提供依据。
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关键词
梭梭
HaSCL30
基因克隆
亚细胞定位
酵母表达
原文传递
油用向日葵铵转运基因HaAMT1.1的克隆及功能分析
2
作者
张爽
李一
+2 位作者
谭定权
王淑冉
张胜
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022年第13期4305-4313,共9页
AMT1.1是铵转运家族的基因之一,在植物吸收转运NH_(4)^(+)中起到重要作用。为了明确氮素在植物体的转运吸收机制,本研究以油用向日葵‘早矮大头’为研究材料,成功从中克隆向日葵AMT1.1的同源基因HaAMT1.1。生物信息学分析表明该基因CDS...
AMT1.1是铵转运家族的基因之一,在植物吸收转运NH_(4)^(+)中起到重要作用。为了明确氮素在植物体的转运吸收机制,本研究以油用向日葵‘早矮大头’为研究材料,成功从中克隆向日葵AMT1.1的同源基因HaAMT1.1。生物信息学分析表明该基因CDS区长1497 bp,编码491个氨基酸;正电荷残基28个,占氨基酸总数的5.7%,负电荷残基30个,占氨基酸总数的6.1%;其分子式为C_(2417)H_(3625)N_(597)O_(668)S_(22),预测分子量为52439.29 Da,理论等电点为6.58;HaAMT1.1为疏水性蛋白,无跨膜结构域,具有Ammonium Transp超家族保守结构域,与黄花蒿AMT1.1亲缘关系最近。亚细胞定位结果表明HaAMT1.1位于细胞质膜和细胞核上。实时荧光定量PCR分析表明,不同组织中Ha AMT1.1基因在根系中表达量最高;不同NH_(4)^(+)浓度处理下,该基因在经低浓度NH_(4)^(+)处理的表达量显著高于经高浓度NH_(4)^(+)处理的组织。本研究结果为进一步分析HaAMT1.1基因的生物学功能提供参考。
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关键词
油用向日葵
铵转运家族
HaAMT1.1
亚细胞定位
表达分析
原文传递
题名
梭梭SCARECROW-like 30基因的克隆、表达及功能分析
被引量:
2
1
作者
彭洁莹
李彩弟
刘洁
谭定权
王淑冉
赵忠
张胜
机构
西北农林科技大学林学院/陕西省林业综合重点实验室
新疆大学生命科学与技术学院
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1851-1863,共13页
基金
新疆维吾尔自治区高层次天池百人计划项目(042419003)
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2019D01C017)。
文摘
SCARECROW-like(SCL)是GRAS转录因子中的重要成员,主要参与植物生长发育、逆境胁迫响应以及赤霉素(GA)信号转导调控等。本研究基于梭梭转录组数据克隆获得1条在干旱胁迫下显著上调表达的SCL基因,并命名为HaSCL30。HaSCL30全长编码序列(CDS)为2109 bp,编码702个氨基酸,预测蛋白分子量为78.37 kDa,理论等电点为5.57,为不稳定亲水性蛋白,具有GRAS超家族保守结构域。多序列比对及系统进化表明梭梭HaSCL30蛋白与同为C4植物的玉米ZmSCL30及同科植物甜菜BvSCL30同源性较高、亲缘关系较近。STRING蛋白互作分析预测出SCL30蛋白与转录因子WRKY33和ERF104具有共表达特征。HaSCL30基因在梭梭不同组织(子叶、同化枝及根)均有表达,在子叶中相对表达量最高。在干旱和盐胁迫下HaSCL30出现不同程度上调表达。亚细胞定位结果表明HaSCL30定位于细胞核和细胞膜。酵母异源表达结果显示,过表达HaSCL30能提高酵母耐盐和耐旱性。基于以上结果,HaSCL30可能参与荒漠植物梭梭的高盐、干旱胁迫响应,对其荒漠环境生存能力的提高存在正向调控作用。研究结果为进一步揭示HaSCL30在梭梭抗旱耐盐中的功能及作用机制提供依据。
关键词
梭梭
HaSCL30
基因克隆
亚细胞定位
酵母表达
Keywords
Haloxylon ammodendron
Ha SCL30
gene cloning
subcellular localization
yeast expression
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
油用向日葵铵转运基因HaAMT1.1的克隆及功能分析
2
作者
张爽
李一
谭定权
王淑冉
张胜
机构
新疆大学生命科学与技术学院
西北农林科技大学林学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022年第13期4305-4313,共9页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2019D01C017)
自治区高层次天池百人计划项目(042419003)
新疆大学自然科学基金项目(62031224612)共同资助。
文摘
AMT1.1是铵转运家族的基因之一,在植物吸收转运NH_(4)^(+)中起到重要作用。为了明确氮素在植物体的转运吸收机制,本研究以油用向日葵‘早矮大头’为研究材料,成功从中克隆向日葵AMT1.1的同源基因HaAMT1.1。生物信息学分析表明该基因CDS区长1497 bp,编码491个氨基酸;正电荷残基28个,占氨基酸总数的5.7%,负电荷残基30个,占氨基酸总数的6.1%;其分子式为C_(2417)H_(3625)N_(597)O_(668)S_(22),预测分子量为52439.29 Da,理论等电点为6.58;HaAMT1.1为疏水性蛋白,无跨膜结构域,具有Ammonium Transp超家族保守结构域,与黄花蒿AMT1.1亲缘关系最近。亚细胞定位结果表明HaAMT1.1位于细胞质膜和细胞核上。实时荧光定量PCR分析表明,不同组织中Ha AMT1.1基因在根系中表达量最高;不同NH_(4)^(+)浓度处理下,该基因在经低浓度NH_(4)^(+)处理的表达量显著高于经高浓度NH_(4)^(+)处理的组织。本研究结果为进一步分析HaAMT1.1基因的生物学功能提供参考。
关键词
油用向日葵
铵转运家族
HaAMT1.1
亚细胞定位
表达分析
Keywords
Helianthus annuus L.
AMT
HaAMT1.1
Subcellular localization
Expression analysis
分类号
S565.5 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
梭梭SCARECROW-like 30基因的克隆、表达及功能分析
彭洁莹
李彩弟
刘洁
谭定权
王淑冉
赵忠
张胜
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
原文传递
2
油用向日葵铵转运基因HaAMT1.1的克隆及功能分析
张爽
李一
谭定权
王淑冉
张胜
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022
0
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