基于生物信息学分析通用转录因子IIH对前列腺癌预后的影响

目的探讨转录起始前复合物中通用转录因子IIH(TFIIH)在前列腺癌(PCa)中的遗传、表达特征及其与PCa预后的关系。方法通过分析癌症基因图谱-PCa数据库(TCGA-PRAD)中495例PCa组织及52例癌旁组织TFIIH亚基的表达特征及临床意义。再通过PCa微阵列芯片验证TFIIH中的关键因子通用转录因子IIH亚基4(GTF2H4)与临床特征[病理分期、生化复发(BCR)以及格里森评分]的相关性。结果495例PCa患者年龄为(61.01±6.82)岁。ERCC3、GTF2H4、MNAT1在格里森评分≥8的PCa组织中mRNA表达量较高(P<0.05)。GTF2H4、MNAT1的表达量与病理分期相关(P<0.05)。高表达GTF2H4的PCa患者的BCR率较高(HR=2.47,95%CI:1.62~3.77,P<0.001),同时其对PCa患者BCR预测效果在各亚基中最好[3、5、7年受试者工作特征曲线下面积(AUC)均>0.7],并在额外4个数据库中得到验证。480例PCa样本中,9例发生了TFIIH亚基的突变,占比1.87%。其中3例为ERCC2亚基突变,2例为GTF2H3亚基突变,GTF2H1、GTF2H4、CCNH、CDK7亚基突变各1例。单因素Cox回归分析显示GTF2H4为BCR的危险因素(HR=2.470,95%CI:1.620~3.767,P<0.001),GTF2H5为保护因素(HR=0.506,95%CI:0.336~0.762,P=0.001)。免疫组织化学染色评分结果显示GTF2H4的蛋白表达量与患者临床特征相关,差异均有统计学意义。结论TFIIH中的关键因子GTF2H4在PCa中高表达并提示预后欠佳。