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利用DH群体定位水稻谷粒外观性状的QTL
被引量:
22
1
作者
谭耀鹏
李兰芝
+2 位作者
李平
王玲霞
胡中立
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2005年第3期314-322,共9页
采用混合线性模型的复合区间作图方法,对水稻“圭630”和“02428”组合的DH群体的谷粒外观性状——粒长、粒宽和粒形进行了数量性状基因定位,同时对定位的主效应和上位性进行了环境效应分析。2002年对粒长、粒宽和粒形分别检测到5、4和2...
采用混合线性模型的复合区间作图方法,对水稻“圭630”和“02428”组合的DH群体的谷粒外观性状——粒长、粒宽和粒形进行了数量性状基因定位,同时对定位的主效应和上位性进行了环境效应分析。2002年对粒长、粒宽和粒形分别检测到5、4和2个QTLs;2003年对以上3个性状分别检测到3、4和4个QTLs。其中4个QTLs在2年均检测到,且其贡献率较大。位于第4染色体C22-RG449d区间的QTL效应大,同时影响粒长和粒宽,2年内均被检测到。联合2年数据分析分别检测到6个粒长QTLs、6个粒宽QTLs和3个粒形QTLs,共解释各自性状变异的67.71%、50.08%和29.17%,且影响粒形的3个QTLs同时影响粒长或粒宽。对粒形和粒宽分别检测到4个QTLs与环境之间存在显著互作。本实验中检测到主效应和上位性对谷粒外观性状均具有重要作用,但上位性贡献率相对主效应较小,环境互作效应更小。
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关键词
外观性状
DH群体
谷粒
水稻
数量性状基因定位
QTLs
混合线性模型
环境互作效应
2002年
2003年
QTL效应
上位性
主效应
作图方法
效应分析
数据分析
性状变异
贡献率
检测
粒宽
粒长
粒形
染色体
区间
下载PDF
职称材料
白色假丝酵母菌对氟康唑耐药性及Erg11基因突变分析
被引量:
7
2
作者
王明永
翟晶晶
+10 位作者
左萌洁
薛宁
刘萌萌
凌明智
高继娟
邢骏
田文倩
胡亚会
于凤婷
谭耀鹏
王凡平
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期2401-2404,共4页
目的分析白色假丝酵母菌临床分离株对氟康唑的耐药性,阐明耐氟康唑白色假丝酵母菌Erg11基因突变。方法回顾性分析2011年6月-2012年12月医院患者送检各类标本分离的287株假丝酵母菌属,采用美国临床实验室标准化研究所(CLSI)M27-A3推荐的...
目的分析白色假丝酵母菌临床分离株对氟康唑的耐药性,阐明耐氟康唑白色假丝酵母菌Erg11基因突变。方法回顾性分析2011年6月-2012年12月医院患者送检各类标本分离的287株假丝酵母菌属,采用美国临床实验室标准化研究所(CLSI)M27-A3推荐的微量稀释法进行体外药敏试验,从177株白色假丝酵母菌中筛选出7株对氟康唑耐药株,对氟康唑靶酶基因Erg11进行PCR扩增、测序,与Genbank上标准序列(X13296)比对分析。结果在7株白色假丝酵母菌氟康唑耐药株和1株敏感株中共发现25个点突变,其中15个同义突变,10个错义突变,10个错义突变分别为V51G、Y53H、C75W、Y79D、V94G、D116E、K119N、K128T、D153E、E266D,其中V51G、Y53H、C75W、Y79D、V94G是新发现的。结论成功分析了白色假丝酵母菌对氟康唑耐药性及Erg11基因突变。
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关键词
白色假丝酵母菌
氟康唑
耐药性
ERG11基因
突变
序列分析
原文传递
题名
利用DH群体定位水稻谷粒外观性状的QTL
被引量:
22
1
作者
谭耀鹏
李兰芝
李平
王玲霞
胡中立
机构
武汉大学国际软件学院
武汉大学生命科学学院发育生物学教育部重点实验室
四川农业大学水稻研究所
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2005年第3期314-322,共9页
基金
国家863计划(2003AA207160)
国家自然科学基金(30270760)
+1 种基金
湖北省自然科学基金(2002ABA006)
武汉大学发育生物学基金的资助。
文摘
采用混合线性模型的复合区间作图方法,对水稻“圭630”和“02428”组合的DH群体的谷粒外观性状——粒长、粒宽和粒形进行了数量性状基因定位,同时对定位的主效应和上位性进行了环境效应分析。2002年对粒长、粒宽和粒形分别检测到5、4和2个QTLs;2003年对以上3个性状分别检测到3、4和4个QTLs。其中4个QTLs在2年均检测到,且其贡献率较大。位于第4染色体C22-RG449d区间的QTL效应大,同时影响粒长和粒宽,2年内均被检测到。联合2年数据分析分别检测到6个粒长QTLs、6个粒宽QTLs和3个粒形QTLs,共解释各自性状变异的67.71%、50.08%和29.17%,且影响粒形的3个QTLs同时影响粒长或粒宽。对粒形和粒宽分别检测到4个QTLs与环境之间存在显著互作。本实验中检测到主效应和上位性对谷粒外观性状均具有重要作用,但上位性贡献率相对主效应较小,环境互作效应更小。
关键词
外观性状
DH群体
谷粒
水稻
数量性状基因定位
QTLs
混合线性模型
环境互作效应
2002年
2003年
QTL效应
上位性
主效应
作图方法
效应分析
数据分析
性状变异
贡献率
检测
粒宽
粒长
粒形
染色体
区间
Keywords
Rice (Oryza sativa L.), Doubled haploid population, Grain length, Grain width, Grain shape, Quantitative trait loci, Genotype×environment interaction
分类号
S511 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
白色假丝酵母菌对氟康唑耐药性及Erg11基因突变分析
被引量:
7
2
作者
王明永
翟晶晶
左萌洁
薛宁
刘萌萌
凌明智
高继娟
邢骏
田文倩
胡亚会
于凤婷
谭耀鹏
王凡平
机构
新乡医学院医学检验学院
出处
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期2401-2404,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(31100645
81373120)
+4 种基金
教育部新世纪优秀人才支持计划基金资助项目(NCET-13-0990)
国家级大学生创新创业训练计划基金资助项目(201310472041)
河南省高校科技创新人才基金资助项目(2012HASTIT024)
河南省高校青年教师骨干基金资助项目(2010GGJS-117)
河南省教育厅科学技术研究重点基金资助项目(12A320017)
文摘
目的分析白色假丝酵母菌临床分离株对氟康唑的耐药性,阐明耐氟康唑白色假丝酵母菌Erg11基因突变。方法回顾性分析2011年6月-2012年12月医院患者送检各类标本分离的287株假丝酵母菌属,采用美国临床实验室标准化研究所(CLSI)M27-A3推荐的微量稀释法进行体外药敏试验,从177株白色假丝酵母菌中筛选出7株对氟康唑耐药株,对氟康唑靶酶基因Erg11进行PCR扩增、测序,与Genbank上标准序列(X13296)比对分析。结果在7株白色假丝酵母菌氟康唑耐药株和1株敏感株中共发现25个点突变,其中15个同义突变,10个错义突变,10个错义突变分别为V51G、Y53H、C75W、Y79D、V94G、D116E、K119N、K128T、D153E、E266D,其中V51G、Y53H、C75W、Y79D、V94G是新发现的。结论成功分析了白色假丝酵母菌对氟康唑耐药性及Erg11基因突变。
关键词
白色假丝酵母菌
氟康唑
耐药性
ERG11基因
突变
序列分析
Keywords
Candida albicans
Fluconazole
Resistance
Ergll gene
Mutation
Sequencing analysis
分类号
R379 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用DH群体定位水稻谷粒外观性状的QTL
谭耀鹏
李兰芝
李平
王玲霞
胡中立
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2005
22
下载PDF
职称材料
2
白色假丝酵母菌对氟康唑耐药性及Erg11基因突变分析
王明永
翟晶晶
左萌洁
薛宁
刘萌萌
凌明智
高继娟
邢骏
田文倩
胡亚会
于凤婷
谭耀鹏
王凡平
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
7
原文传递
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