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基于纤维蛋白原活性的红花注射液抗凝血谱-效关系研究 被引量:2
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作者 徐玉玲 贺桢翔 +4 位作者 刘钱 曾奇璐 曹鑫 吕海洋 刘涛 《中国测试》 CAS 北大核心 2019年第2期59-63,77,共6页
通过生物活性检测结合化学指纹图谱分析,探索红花注射液抗凝血活性成分。以红花注射液为研究对象,测定7批红花注射液的指纹图谱和抗凝血活性值,再基于Statistical Product and Service Solutions软件,运用主成分分析-相关性分析-多重线... 通过生物活性检测结合化学指纹图谱分析,探索红花注射液抗凝血活性成分。以红花注射液为研究对象,测定7批红花注射液的指纹图谱和抗凝血活性值,再基于Statistical Product and Service Solutions软件,运用主成分分析-相关性分析-多重线性回归的分析方法对抗凝血活性值和色谱指纹图谱数据建立谱-效回归评价模型,另取6批红花注射液对模型进行验证。纳入模型的6个自变量对抗凝血活性能力的影响均具有统计学意义(P<0.05),预测值和实测值的相对误差均在10%以内。建立的谱-效回归模型可较好地通过红花注射液图谱数据评价其抗凝血生物活性。 展开更多
关键词 红花注射液 指纹图谱 抗凝血活性 回归模型 谱-效关系
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三仁合剂治疗湿热型感冒的潜在物质基础和作用机制研究 被引量:2
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作者 曾奇璐 苏泰安 +3 位作者 贺桢翔 赵灵丽 郑荣蕾 刘涛 《中国药业》 CAS 2021年第21期29-34,共6页
目的回顾性研究三仁合剂治疗湿热型感冒的潜在物质基础和作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得三仁合剂中苦杏仁、豆蔻、薏苡仁、滑石、淡竹叶、姜半夏、通草、厚朴的活性成分和作用靶点,在UniProt数据库中检索靶点对... 目的回顾性研究三仁合剂治疗湿热型感冒的潜在物质基础和作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得三仁合剂中苦杏仁、豆蔻、薏苡仁、滑石、淡竹叶、姜半夏、通草、厚朴的活性成分和作用靶点,在UniProt数据库中检索靶点对应的基因,在GeneCards数据库获取感冒相关靶基因;采用String平台构建靶点蛋白互作(PPI)网络;通过DAVID数据库进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,运用Cytoscape 3.7.0构建成分-靶点网络,并进行网络拓扑参数分析,预测其作用机制;通过Prism软件和Omicshare数据库制作分析柱状图及高级气泡图。结果三仁合剂中共得到52个活性成分,成分-靶点网络中得到38个节点、171条边,其中核心化合物包括槲皮素、木犀草素、黄芩素,关键靶点包括肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGF-A)。GO功能富集分析得到GO条目1 555个,其中生物过程条目1 347个,细胞组成条目73个,分子功能条目135个;KEGG通路富集分析结果中,前20个信号通路主要有糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、致癌通路、疟疾等;分子对接结果显示,黄芩素与VEGF-A受体,(Flu A) M2,(Flu A) HA的结合能最低,分别为-26.36,-36.40,-38.91 kJ/mol;木犀草素与TNF-α的结合能最低,为-37.24 kJ/mol;槲皮素与IL-6的结合能最低,为-28.03 kJ/mol。结论三仁合剂中活性化合物有槲皮素、木犀草素、黄芩素等,可能通过作用于TNF-α,IL-6,VEGF-A,(Flu A) M2,(Flu A) HA等靶点调节多条信号通路,达到干预感冒的作用。 展开更多
关键词 三仁合剂 网络药理学 分子对接 湿热型感冒 物质基础 作用靶点
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基于紫外—可见、红外及物理方法联用的参附注射液指纹图谱方法学建立 被引量:6
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作者 刘涛 杨丹 +5 位作者 郑燕 贺桢翔 张文静 罗虹 潘春晖 杨红玉 《成都大学学报(自然科学版)》 2019年第1期16-19,37,共5页
为建立参附注射液的紫外—可见、红外、物理指纹图谱测定方法,采用紫外—可见分光光度计对样品进行全波长扫描,得到紫外—可见指纹图谱,运用物理方法构建参附注射液8个参数组成的对照物理指纹谱,以雷达图直观展现,并规定其参数范围,用3... 为建立参附注射液的紫外—可见、红外、物理指纹图谱测定方法,采用紫外—可见分光光度计对样品进行全波长扫描,得到紫外—可见指纹图谱,运用物理方法构建参附注射液8个参数组成的对照物理指纹谱,以雷达图直观展现,并规定其参数范围,用3批效期外样品进行验证;红外指纹图谱分别以各参附注射液样品红外指纹图谱为标准,计算其他样品相对于该标准样品的共有峰率和变异峰率,并按照共有峰率的大小建立不同的序列.实验结果显示,效期内8批参附注射液紫外—可见指纹图谱吸光度值应分别同时满足297nm(0.330~0.460)、269nm(0.587~0.734)、243nm(0.520~0.630);红外指纹图谱双指标序列中的共有峰率为54.83%~91.67%,变异峰率为0.00%~52.94%;8批效期内参附注射液的物理指纹图用雷达图规定其参数范围后,3批效期外样品8个参数基本不在其参数范围内.验证得出,3批效期外参附注射液紫外—可见、红外和物理指纹图谱都不符合要求.实验结果表明,建立的参附注射液指纹图谱方法可用于评价参附注射液药品的质量及稳定性. 展开更多
关键词 参附注射液 质量评价 红外 紫外—可见 物理指纹图谱
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基于网络药理学和分子对接技术的抗病毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在物质基础研究 被引量:93
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作者 姚运秀 贺桢翔 +5 位作者 刘晓凤 何勇志 雷阳 张书滔 赵灵丽 刘涛 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1386-1396,共11页
目的通过网络药理学及分子对接技术探寻抗病毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在物质基础。方法借助TCMSP检索抗病毒颗粒中板蓝根、连翘、石膏、知母、芦根、地黄、广藿香、石菖蒲、郁金的化学成分和作用靶点。通过Uni Prot数... 目的通过网络药理学及分子对接技术探寻抗病毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在物质基础。方法借助TCMSP检索抗病毒颗粒中板蓝根、连翘、石膏、知母、芦根、地黄、广藿香、石菖蒲、郁金的化学成分和作用靶点。通过Uni Prot数据库查询靶点对应的基因,进而运用Cytoscape3.6.1构建药材-化合物-靶点(基因)网络,通过DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和KEGG通路富集分析,预测其作用机制,将药材-化合物-靶点网络中排名前15的成分与新型冠状病毒(SARS-Co V-2)3CL水解酶进行分子对接,同时将比枯枯灵、木犀草素、槲皮素与血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接。结果药材-化合物-靶点(基因)网络包含药材8个、化合物75个、靶点255个。GO功能富集分析得到GO条目161个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目65个,细胞组成(CC)条目36个,分子功能(MF)条目60个。KEGG通路富集筛选得到131条信号通路(P<0.05)。分子对接结果显示抗病毒颗粒中比枯枯灵、木犀草素、槲皮素等核心活性化合物与SARS-Co V-23CL水解酶的亲和力与临床推荐化学药相似。结论抗病毒颗粒中的活性化合物比枯枯灵、木犀草素、槲皮素等能通过与ACE2结合作用于PTGS2、HSP90AB1、PTGS1等靶点调节多条信号通路,从而可能发挥对COVID-19的治疗作用。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接 抗病毒颗粒 新型冠状病毒肺炎 血管紧张素转换酶Ⅱ 比枯枯灵 木犀草素 槲皮素
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基于网络药理学和分子对接法探索藿香正气口服液预防新型冠状病毒肺炎(COVID-19)活性化合物研究 被引量:121
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作者 邓燕君 刘博文 +6 位作者 贺桢翔 刘涛 郑荣蕾 杨安迪 黄澳 李玉婷 徐玉玲 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1113-1122,共10页
目的采用网络药理学与分子对接法探索藿香正气口服液预防新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性化合物。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索藿香正气口服液组方中苍术、陈皮、厚朴、白芷、茯苓、大腹皮、半夏、甘草、广藿香、紫苏... 目的采用网络药理学与分子对接法探索藿香正气口服液预防新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性化合物。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索藿香正气口服液组方中苍术、陈皮、厚朴、白芷、茯苓、大腹皮、半夏、甘草、广藿香、紫苏的化学成分和作用靶点。通过Uniprot数据库查询靶点对应的基因,进而运用Cyoscape3.7.2软件构建药材-化合物-靶点(基因)网络进行可视化,通过DAVID进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,预测其作用机制,并通过Prism软件及Omicshare数据库绘制柱状图及气泡图进行可视化。结果药材-化合物-靶点网络包含了10种药材,123个化合物和相应靶点基因257个,关键靶点基因涉及PTGS2、HSP90AB1、AR、CAMSAP2、PPARG、NOS2等。GO功能富集分析得到GO条目278个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目178个,细胞组成(CC)条目36个,分子功能(MF)条目64个。KEGG通路富集分析筛选得到119条信号通路(P<0.05),涉及乙型肝炎、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、膀胱癌、前列腺癌及T细胞受体通路等。分子对接结果显示槲皮素、异鼠李素、葛花苷元、山柰酚、汉黄芩素、黄芩素等核心化合物与COVID-19推荐药的亲和力相似。其中以槲皮素、异鼠李素、葛花苷元3者亲和力最强。结论藿香正气口服液中的化合物能通过与血管紧张素转化酶II(ACE2)结合作用于PTGS2、HSP90AB1、AR、CAMSAP2等靶点调节多条信号通路,从而发挥对COVID-19的防治作用。 展开更多
关键词 藿香正气口服液 新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 新型冠状病毒肺炎(COVID-19) 网络药理学 分子对接 槲皮素 异鼠李素 葛花苷元
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基于网络药理学和分子对接法探索肺毒清治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在活性成分 被引量:22
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作者 刘钱 贺桢翔 +4 位作者 杨慧 刘新燕 曾钦 张梅 刘涛 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1713-1722,共10页
目的以网络药理学和分子对接法探索肺毒清治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)活性化合物。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得肺毒清中木蝴蝶、栀子及苦参3味中药相关的成分和作用靶点,通过Uni Prot数据库查询靶点对应的基因;采用S... 目的以网络药理学和分子对接法探索肺毒清治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)活性化合物。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得肺毒清中木蝴蝶、栀子及苦参3味中药相关的成分和作用靶点,通过Uni Prot数据库查询靶点对应的基因;采用STRING平台构建靶点PPI网络;通过DAVID进行GO(gene ontology)生物过程及KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,对核心靶点进行网络拓扑分析,运用Cytoscape 3.7.0构建成分-靶点网络,分析预测其作用机制。肺毒清中核心化合物与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶进行分子对接,同时将结合能最低的前3位化合物与血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接。结果成分-靶点网络得到269个节点,4204条边,其中包括槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚等50个成分,关键靶点有JUN、AKT1、TP53、PTGS2、FOS、ESR1等。GO功能富集分析得到GO条目2 187个(P<0.05),其中生物过程(biological process,BP)条目1 877个,细胞组成(cellular component,CC)条目105个,分子功能(molecularfunction,MF)条目205个;KEGG富集筛选得到25条信号通路(P<0.05),主要有乙型肝炎通路、致癌通路、肿瘤坏死因子信号通路、胰腺癌、弓形虫病通路等;木犀草素(-26.78 kJ/mol)、槲皮素(-26.36kJ/mol)、去甲脱水淫羊藿黄素(-25.94 kJ/mol)作用于SARS-CoV-2 3CL水解酶的分子对接结合能最低。结论肺毒清的活性化合物通过作用于JUN、AKT1、TP53、PTGS2、FOS、ESR1等靶点,与ACE2结合,调节多条信号通路,对COVID-19有潜在治疗作用。 展开更多
关键词 肺毒清 网络药理学 新型冠状病毒肺炎 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 分子对接 血管紧张素转化酶Ⅱ 木犀草素 槲皮素 去甲脱水淫羊藿黄素
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