目的了解云南省家鼠鼠疫疫源地鼠形动物戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)感染情况及基因多态性。方法2019年7-8月,在云南省家鼠鼠疫疫源地的16个自然村(弥勒市4个、芒市6个、梁河县6个)周围,采用夹夜法收集鼠形动物,提取肝脏RNA,应...目的了解云南省家鼠鼠疫疫源地鼠形动物戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)感染情况及基因多态性。方法2019年7-8月,在云南省家鼠鼠疫疫源地的16个自然村(弥勒市4个、芒市6个、梁河县6个)周围,采用夹夜法收集鼠形动物,提取肝脏RNA,应用一步法荧光定量PCR检测鼠HEV目的基因,计算鼠HEV阳性率;采用PCR法对阳性样本进行目的基因扩增及克隆测序,应用MegAlign和MEGA 7.0软件对测序样本序列与GenBank注册的HEV基因序列进行序列对比分析,构建系统进化树。结果共捕获鼠形动物491只,隶属3目、5科、8属、15种;鼠HEV阳性率为4.89%(24/491),其中黄胸鼠和针毛鼠的阳性率分别为9.39%(23/245)和1/3,其他鼠形动物未检出。不同生境鼠形动物鼠HEV阳性率比较差异有统计学意义(P=0.014),且民居附近生境鼠HEV阳性率高于其他生境(P均<0.05)。序列对比分析结果显示,来源于梁河县的P018样本基因序列与来自香港首例感染鼠HEV患者的样本MG813927.1序列同源性为100.0%,且与MG813927.1及来源于鼠的样本LC549185.1序列聚为同一分支,为HEV C型;来源于芒市的G024样本与其他病毒株的序列同源性为20.7%~31.5%,与来源于鸟类的样本AY535004.1序列聚为同一分支。结论云南省家鼠鼠疫疫源地鼠形动物存在鼠HEV感染,可能存在基因多态性,且感染差异与生境有关。展开更多
文摘目的了解云南省家鼠鼠疫疫源地鼠形动物戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)感染情况及基因多态性。方法2019年7-8月,在云南省家鼠鼠疫疫源地的16个自然村(弥勒市4个、芒市6个、梁河县6个)周围,采用夹夜法收集鼠形动物,提取肝脏RNA,应用一步法荧光定量PCR检测鼠HEV目的基因,计算鼠HEV阳性率;采用PCR法对阳性样本进行目的基因扩增及克隆测序,应用MegAlign和MEGA 7.0软件对测序样本序列与GenBank注册的HEV基因序列进行序列对比分析,构建系统进化树。结果共捕获鼠形动物491只,隶属3目、5科、8属、15种;鼠HEV阳性率为4.89%(24/491),其中黄胸鼠和针毛鼠的阳性率分别为9.39%(23/245)和1/3,其他鼠形动物未检出。不同生境鼠形动物鼠HEV阳性率比较差异有统计学意义(P=0.014),且民居附近生境鼠HEV阳性率高于其他生境(P均<0.05)。序列对比分析结果显示,来源于梁河县的P018样本基因序列与来自香港首例感染鼠HEV患者的样本MG813927.1序列同源性为100.0%,且与MG813927.1及来源于鼠的样本LC549185.1序列聚为同一分支,为HEV C型;来源于芒市的G024样本与其他病毒株的序列同源性为20.7%~31.5%,与来源于鸟类的样本AY535004.1序列聚为同一分支。结论云南省家鼠鼠疫疫源地鼠形动物存在鼠HEV感染,可能存在基因多态性,且感染差异与生境有关。