一起学校聚集甲型流感的流行特点和全基因组特征分析

目的分析2023年3月发生的甲型H_(1)N_(1)流感病毒和季节性H3N2流感病毒共同引起的一起学校聚集流感疫情的流行特点和全基因组特征。方法对聚集疫情开展流行病学调查并采集10份病例咽拭子标本,利用实时荧光定量PCR法进行流感病毒核酸检测,利用MDCK细胞培养流感病毒,利用NEXTSEQ 2000高通量测序仪进行流感病毒全基因组测序,利用生物信息学软件进行序列分析。结果9日内3个班级共报告病例32例;采集的10份标本中甲型H_(1)N_(1)流感病毒阳性2份,季节性H_(3)N_(2)流感病毒阳性3份;培养流感病毒毒株2株。两条序列与疫苗株相比,8个基因节段核苷酸相似性分别为98.44%~98.68%和97.95%~99.34%;两条序列的血凝素(HA)抗原表位未发生漂移,受体结合位点未发生变异,神经氨酸酶(NA)抑制剂耐药位点未发生变异;但发生多个糖基化和磷酸化位点的改变。结论本次学校聚集流感疫情由甲型H1N1流感病毒和季节性H3N2流感病毒共同引起,应加大学校流感防控力度,提升学生流感疫苗接种率。

一起季节性H3N2流感引起的学校聚集疫情全基因特征分析

分析一起学校季节性H3N2流感聚集疫情的流行特点和全基因组特征,为学校流感防控提供研究数据。对一起学校流感聚集疫情进行流行病学调查,采集咽拭子标本17份进行流感病毒核酸检测、病毒培养和全基因组测序,利用生物信息学软件分析基因进化变异特征。4份咽拭子标本季节性H3N2流感病毒核酸检测阳性,培养流感病毒毒株2株。2株毒株序列同源。同疫苗株A/Kansas/14/2017相比,8个基因节段的一致性范围是96.71%~98.88%。在进化树上,2条序列与疫苗株不在同一进化分支,亲缘性较远。HA蛋白信号肽发生2个氨基酸变异,抗原表位和受体结合位点分别发生5处和2处氨基酸变异。2条序列均发生金刚烷胺耐药位点变异,均未发生神经氨酸酶抑制剂耐药位点变异。2条序列的PA均发生K158R变异,PB2均发生K340R变异。该起学校聚集疫情由季节性H3N2流感病毒引起,病毒抗原已经发生漂移,应加强学校流感疫情监测和防控。

2020年—2021年济宁市禽流感外环境监测结果分析

目的 了解济宁市外环境禽流感病毒分布情况,为禽流感防控提供科学依据。方法 2020年—2021年采集禽流感外环境标本320份,使用实时荧光定量PCR法进行甲型流感病毒检测,阳性标本再进行H5、H7和H9亚型禽流感病毒分型。结果 2020年—2021年济宁市外环境禽流感病毒的阳性率为14.69%(47/320),其中H5、H7和H9亚型的阳性率分别为3.44%(11/320)、0.31%(1/320)和10.94%(35/320)。不同监测场所中城乡活禽市场禽流感病毒阳性率最高,为17.92%(43/240)。不同标本类型中案板擦拭标本和禽类饮水阳性率较高,分别为24.49%(12/49)和24.07%(13/54)。结论 济宁市外环境中存在禽流感病毒污染,存在人感染禽流感风险,应加强禽流感监测。