河南部分地区乌鸡群鸭源鸡杆菌的分离鉴定及系统发育分析

为了解乌鸡中鸡杆菌的流行情况及其分离株的遗传进化特点,从河南信阳和南阳的两个乌鸡场采集棉拭子样品,进行鸡杆菌的分离和荧光定量PCR检测,对分离的菌株进行PCR鉴定、药敏试验和16SrRNA、rpoB及gyrB基因的PCR扩增,随后进行三个管家基因的序列测定分析,利用DNAStar中MegAlign程序计算分离株之间的相似性,利用MEGA5.0构建进化树进行遗传进化分析。结果显示:22只乌鸡中16只为鸭源鸡杆菌阳性,阳性率为72.7%;分离的4株鸡杆菌经鉴定均为鸭源鸡杆菌;4株鸭源鸡杆菌均为多重耐药菌株,只对头孢曲松、头孢噻肟、阿米卡星和妥布霉素等药物具有一定的敏感性;分离株与鸭源鸡杆菌的参考菌株相似性分别为99.1%～99.8%(16SrRNA)、85.4%～99.6%(rpoB)、92.7%～99.8%(gyrB);在16SrRNA基因进化树中分离的4株鸭源鸡杆菌与参考鸭源鸡杆菌位于同一分支,在rpoB基因进化树中GAC193分离株与多杀性巴氏杆菌位于同一分支中,与其他鸭源鸡杆菌不在同一分支中,gyrB基因进化树中,GAC017与鸡杆菌基因种1在一个小的分支。结果表明:乌鸡中有鸭源鸡杆菌存在,并具有较高的检出率;从乌鸡中分离到4株鸭源鸡杆菌,这些菌株多重耐药现象严重;分离的部分鸭源鸡杆菌在rpoB和gyrB基因位点具有明显的遗传进化差异。

PCV2复制起始区DNA互作蛋白的筛选及PARP1蛋白对病毒复制的调控

旨在筛选PK-15细胞中与猪圆环病毒2型(porcinecircovirustype2,PCV2)复制起始区(originofreplication,Ori)互作的细胞蛋白谱,并初步探究PARP1蛋白对PCV2复制的调控。利用DNA-proteinpulldown结合LC-MS/MS方法筛选PCV2复制起始区DNA互作蛋白;对互作蛋白进行GO分析以及KEGG通路富集分析,并绘制蛋白互作网络图。在对互作蛋白进行分析的基础上,选择聚(ADP-核糖)聚合酶1(PARP1)蛋白,开展了深入研究。构建了PARP1蛋白以及PCV2复制蛋白Rep真核表达质粒,并利用DNA-proteinpulldown及DNAIP试验验证PARP1蛋白与PCV2Ori的互作;通过Co-IP试验,研究了PARP1蛋白与PCV2Rep蛋白的互作;在细胞中过表达或沉默PARP1蛋白,通过qPCR方法检测对PCV2复制的影响。本研究共鉴定到130种可能与Ori互作的宿主蛋白,其中,与DNA功能相关的蛋白共有45种,主要涉及宿主DNA损伤修复及DNA复制功能;验证了PARP1蛋白与PCV2基因组Ori以及Rep蛋白互作。用siRNA沉默PARP1蛋白表达后,PCV2基因组复制效率显著下降,瞬时过表达PARP1蛋白,PCV2基因组复制效率显著提高。综上所述,本研究筛选到130种可能与PCV2Ori互作的细胞蛋白,发现PARP1蛋白可结合PCV2基因组Ori及Rep蛋白并促进PCV2的复制,为PCV2药物靶点选择及PCV2复制起始过程研究奠定了基础。

不同养殖条件蛋鸡场鸡杆菌的病原学检测及分析

为了解不同养殖条件蛋鸡场中鸡杆菌的感染情况,试验对中国6个省市的7家蛋鸡场进行随机采样,共采集302只鸡的604份上颚裂棉拭子和泄殖腔棉拭子,利用qPCR方法和常规细菌分离方法进行鸡杆菌的检测和分离鉴定,并统计分析了不同养殖条件和药物等对鸡杆菌感染的影响。结果表明：经qPCR检测,所有鸡场均存在鸡杆菌感染,鸡只检测阳性率为57.63%;常规细菌分离方法检测有109只鸡为阳性,阳性鸡只比例为41.60%;不同养殖条件蛋鸡场鸡杆菌的检出率有较大差别,养殖条件最好的鸡场没有分离到鸡杆菌,最差的鸡场鸡杆菌分离率为85.10%;药物对鸡杆菌感染也有较大影响,山西省某鸡场用甲砜霉素治疗的鸡群鸡杆菌分离率为30.00%,未用药鸡群的鸡杆菌分离率为80.00%。说明不同养殖条件蛋鸡场鸡杆菌的感染率不同,养殖条件越好的鸡场鸡群中鸡杆菌的感染率越低。

鸭源鸡杆菌的药物敏感性及其对氟喹诺酮类药物的耐药机制

为了解近年来鸭源鸡杆菌(Gallibacterium anatis)的药物敏感性及其对氟喹诺酮类药物的耐药机制,以204株G.anatis为对象,选取11种抗菌药,用纸片法检测其药物敏感性,随后从中随机选取30株进行gyrA、parC基因的PCR扩增和测序,并分析喹诺酮耐药决定区编码氨基酸的突变情况。结果显示,试验菌株对复方新诺明、四环素、氟喹诺酮类药物的耐药率达86.76%以上,对头孢曲松与头孢噻肟的耐药率较低,分别为11.27%和7.35%;99.02%的菌株耐3种以上药物,92.16%的菌株耐6种以上药物,其中有6株对11种药物全部耐药;30株G.anatis全部扩增出parC基因,其中22株扩增出gyrA基因,GyrA亚基存在Ser83→Phe、Asp87→Ala/Tyr/Asn和Asp139→Tyr 3个位点氨基酸置换,ParC亚基存在Thr84→Ile、Glu88→Gly、Ala94→Val和Gly179→Val 4个位点氨基酸置换,敏感菌株不存在氨基酸位点突变,中度敏感菌株发生了3处氨基酸的替换,94.7%的耐药菌株发生了4处及以上氨基酸位点的置换。结果表明,G.anatis分离株产生了严重的多重耐药性;该菌对氟喹诺酮类药物的耐药性与喹诺酮耐药决定区编码氨基酸突变的关系密切,突变位点数量与耐药程度呈正相关;推测GyrA83、GyrA87和ParC84位氨基酸的突变对耐药起着决定性作用,其余4个位点对突变起协同增强作用。

基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)在鸭源鸡杆菌快速鉴定中的应用

按照MALDI-TOF MS要求进行56株鸡杆菌分离株的样品制备,点靶并获取样品质谱图,运用Biotyper分析软件对所获取的质谱图鉴定分析;同时对这些菌株进行荧光定量PCR检测、gyrB基因的PCR扩增和序列分析,进行辅助分析鉴定。结果显示,56株鸡杆菌分离株经MALDI-TOF MS和gyrB基因序列分析均鉴定为鸭源鸡杆菌,阳性率为100.0%;荧光定量PCR鉴定出55株鸭源鸡杆菌,阳性率为98.2%(55/56)。结果表明,MALDI-TOF MS可用于鸭源鸡杆菌分离株的快速鉴定,操作简便,准确率高。