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不同培养温度的鱼源海豚链球菌转录组分析
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作者 贾新蕾 黄增朝 +4 位作者 杨林狄 吕静 李妍萍 简纪常 黄郁葱 《热带生物学报》 2024年第1期109-121,共13页
为鉴定海豚链球菌(Streptococcus iniae)在不同温度的转录水平差异,通过生长曲线测定和人工感染试验分析该菌在25℃和35℃下的生长情况和致病性,采用链特异性转录组测序(Strand-specific RNA-seq)技术对25℃和35℃培养的海豚链球菌Tozj-... 为鉴定海豚链球菌(Streptococcus iniae)在不同温度的转录水平差异,通过生长曲线测定和人工感染试验分析该菌在25℃和35℃下的生长情况和致病性,采用链特异性转录组测序(Strand-specific RNA-seq)技术对25℃和35℃培养的海豚链球菌Tozj-1菌株进行测序分析,筛选差异表达基因,通过GO(Gene Ontology)数据库和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库对差异表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,然后利用VFDB(Virulence factor database)数据库筛选差异表达的重要毒力基因并使用实时荧光定量PCR进行验证。结果显示,海豚链球菌在35℃条件下有更快的生长速度和更强的毒力;转录组共筛选获得927个显著差异表达基因(P<0.05),其中包括820个上调基因和107个下调基因;GO功能富集分析发现,差异基因主要富集在代谢、细胞、催化及结合过程;KEGG富集分析发现,差异基因主要富集在核糖体通路、ABC转运通路、群体感应等信号通路。以上结果表明温度调控海豚链球菌基因的转录表达及相关通路的富集,为后续海豚链球菌致病机理的研究提供数据支持。 展开更多
关键词 海豚链球菌 转录组测序 温度 毒力因子 QRT-PCR
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银鼓鱼海豚链球菌的分离、鉴定及毒力基因检测 被引量:7
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作者 杨林狄 贾新蕾 +3 位作者 黄增朝 吕静 梁华芳 黄郁葱 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期233-241,共9页
为探究2021年北部湾地区养殖银鼓鱼(Selenotoca multifasciata)疾病暴发的病原,从广东省湛江市南三镇、廉江市和广西北海市的3个养殖场患病银鼓鱼的脑、肝脏和脾脏中分离细菌,综合形态学观察、生理生化特征和16S rRNA序列分析结果,对分... 为探究2021年北部湾地区养殖银鼓鱼(Selenotoca multifasciata)疾病暴发的病原,从广东省湛江市南三镇、廉江市和广西北海市的3个养殖场患病银鼓鱼的脑、肝脏和脾脏中分离细菌,综合形态学观察、生理生化特征和16S rRNA序列分析结果,对分离菌株进行种属鉴定,通过人工感染试验确定分离菌株的致病性,并进行组织病理学观察、毒力基因检测及药物敏感性试验。结果表明:从3个养殖场的患病银鼓鱼中,各分离出1株优势菌,分别命名为BBW S1、BBW S2和BBW S3,均具有较强的致病性,是引起银鼓鱼链球菌病的病原菌;根据形态学观察、生化特征和分子鉴定结果,确定3株分离菌株均为海豚链球菌(Streptococcus iniae);病理学观察发现,银鼓鱼感染海豚链球菌后,可造成脑、肝和脾等多脏器不同程度损伤,表现为变性、坏死及炎性细胞浸润等;3株分离菌株均携带scpI、simA、pdi、sagA、cpsD、pgmA和cfi 7种毒力基因,均对阿莫西林、盐酸多西环素、恩诺沙星等8种抗菌药物敏感。研究表明,海豚链球菌是2021年北部湾地区银鼓鱼疾病暴发的病原,本研究结果可为银鼓鱼海豚链球菌病的防控提供科学依据。 展开更多
关键词 银鼓鱼 海豚链球菌 分离鉴定 毒力基因检测
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改良超声弹性成像评分标准在乳腺肿块鉴别诊断中的作用探讨 被引量:1
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作者 贾新蕾 《中国医药指南》 2016年第19期159-160,共2页
目的探讨改良超声弹性成像评分标准在乳腺肿块鉴别诊断中的作用。方法以手术病理检查结果作为诊断金标准,比较改良超声弹性成像评分标准和旧评分标准对乳腺肿块诊断的效果。结果超声弹性成像旧评分标准诊断乳腺良性病灶的准确性为85.2%... 目的探讨改良超声弹性成像评分标准在乳腺肿块鉴别诊断中的作用。方法以手术病理检查结果作为诊断金标准,比较改良超声弹性成像评分标准和旧评分标准对乳腺肿块诊断的效果。结果超声弹性成像旧评分标准诊断乳腺良性病灶的准确性为85.2%,改良超声弹性成像评分成像评分标准在诊断乳腺良性肿块准确性为92.6%,两组比较差异具有统计学意义(P<0.05)。结论改良超声弹性成像评分标准在诊断乳腺良性和恶性肿块诊断方面具有简单、方便剂准确等优点,该方法具有临床推广应用价值。 展开更多
关键词 改良 超声弹性成像评分标准 乳腺肿块 诊断效果
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甲状腺肿块的超声诊断与声像图特征
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作者 贾新蕾 《中国医药指南》 2016年第26期105-106,共2页
目的探讨甲状腺肿块的超市诊断价值以及总结其声像图特征。方法回顾性分析102例术前行超声诊断的甲状腺肿块患者临床病例资料,分析其超声诊断效果及声像图特征。结果甲状腺肿瘤超声诊断结果与病理检查结果相符83例,符合率为81.4%,误诊19... 目的探讨甲状腺肿块的超市诊断价值以及总结其声像图特征。方法回顾性分析102例术前行超声诊断的甲状腺肿块患者临床病例资料,分析其超声诊断效果及声像图特征。结果甲状腺肿瘤超声诊断结果与病理检查结果相符83例,符合率为81.4%,误诊19例,比例为18.6%。结论超声检查对甲状腺肿块的临床鉴别和诊断具有较大的临床诊断价值。 展开更多
关键词 甲状腺肿块 超声诊断 病理诊断 声像图特征
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红笛鲷SR-BⅠ基因的原核表达及条件优化 被引量:1
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作者 王一帆 陈子茵 +3 位作者 贾新蕾 黄增朝 吕静 黄郁葱 《安徽农学通报》 2021年第3期1-5,48,共6页
根据GenBank上登录的红笛鲷SR-BⅠ基因设计引物,采用RT-PCR方法扩增该基因胞外段序列,然后将该基因胞外段序列定向克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,将重组质粒转入大肠杆菌BL21进行IPTG诱导表达,并对重组表达菌株的表达条件进行优化。... 根据GenBank上登录的红笛鲷SR-BⅠ基因设计引物,采用RT-PCR方法扩增该基因胞外段序列,然后将该基因胞外段序列定向克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,将重组质粒转入大肠杆菌BL21进行IPTG诱导表达,并对重组表达菌株的表达条件进行优化。结果显示,成功构建了原核表达载体pET28a-SR-BI,并能在大肠杆菌BL21中表达,表达的融合蛋白分子量为50.0ku。融合蛋白的最佳诱导表达温度、IPTG浓度和时间分别为16℃、0.05mmol/L和8h。研究结果为进一步研究SR-BI的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 红笛鲷 SR-BⅠ基因 原核表达 条件优化
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