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草乌幼苗形成期叶绿体发育的转录组分析
1
作者
贾春赫
吕丽娟
+6 位作者
李晓杰
张晓明
穆赢通
樊东昌
吕艳敏
史佳怡
王俊杰
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1779-1788,共10页
为确定草乌(Aconitum kusnezoffii Reichb.)苗期生长发育过程中的转录组特征,本研究利用Illumina测序对草乌从种子萌发到幼苗建成涉及到的四个时期(T1,T2,T3,T4)进行转录分析,挖掘草乌幼苗形成期叶绿体发育关键基因。结果显示,4个时期的...
为确定草乌(Aconitum kusnezoffii Reichb.)苗期生长发育过程中的转录组特征,本研究利用Illumina测序对草乌从种子萌发到幼苗建成涉及到的四个时期(T1,T2,T3,T4)进行转录分析,挖掘草乌幼苗形成期叶绿体发育关键基因。结果显示,4个时期的6个差异分类检测到的差异基因数量依次为:16 379,28 155,16 100,34 368,38 250和44 568个。GO富集分析显示T3vsT4差异表达基因主要富集到对几丁质的反应,光合系统Ⅰ等。KEGG富集分析显示差异表达基因显著富集的通路主要是光合生物中的碳固定,植物激素信号转导等。草乌幼苗形成期叶绿体发育过程中,19个差异表达基因注释光信号调控叶绿体发育通路上,如GLK1/2,PIFs,HY5基因等。44个差异表达基因注释植物激素信号转导通路上,如AUX/IAA,ARF,DELLA基因等。本研究挖掘到一部分草乌幼苗形成期叶绿体发育相关基因,为进一步研究草乌生长发育相关分子机制提供理论基础。
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关键词
草乌
转录组
幼苗形成
叶绿体发育
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职称材料
题名
草乌幼苗形成期叶绿体发育的转录组分析
1
作者
贾春赫
吕丽娟
李晓杰
张晓明
穆赢通
樊东昌
吕艳敏
史佳怡
王俊杰
机构
内蒙古农业大学草原与资源环境学院
呼和浩特市林业和草原局
科尔沁右翼中旗林业和草原局
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1779-1788,共10页
基金
内蒙古自治区科技计划项目(2021GG0327)
内蒙古自治区科技计划(2022YFDZ0025)资助。
文摘
为确定草乌(Aconitum kusnezoffii Reichb.)苗期生长发育过程中的转录组特征,本研究利用Illumina测序对草乌从种子萌发到幼苗建成涉及到的四个时期(T1,T2,T3,T4)进行转录分析,挖掘草乌幼苗形成期叶绿体发育关键基因。结果显示,4个时期的6个差异分类检测到的差异基因数量依次为:16 379,28 155,16 100,34 368,38 250和44 568个。GO富集分析显示T3vsT4差异表达基因主要富集到对几丁质的反应,光合系统Ⅰ等。KEGG富集分析显示差异表达基因显著富集的通路主要是光合生物中的碳固定,植物激素信号转导等。草乌幼苗形成期叶绿体发育过程中,19个差异表达基因注释光信号调控叶绿体发育通路上,如GLK1/2,PIFs,HY5基因等。44个差异表达基因注释植物激素信号转导通路上,如AUX/IAA,ARF,DELLA基因等。本研究挖掘到一部分草乌幼苗形成期叶绿体发育相关基因,为进一步研究草乌生长发育相关分子机制提供理论基础。
关键词
草乌
转录组
幼苗形成
叶绿体发育
Keywords
Aconitum kusnezoffii Reichb
Transcriptome
Seedling formation
Chloroplast development
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草乌幼苗形成期叶绿体发育的转录组分析
贾春赫
吕丽娟
李晓杰
张晓明
穆赢通
樊东昌
吕艳敏
史佳怡
王俊杰
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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