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题名甘蔗转录因子DREB2基因的克隆和生物信息学分析
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作者
贾晨灏
夏可灿
钱庆忠
李浩
黎慧敏
苗贵东
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机构
兴义民族师范学院生物与化学学院
黔西南州生物遗传资源挖掘与分子育种重点实验室
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出处
《科技创新与生产力》
2023年第12期98-101,共4页
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基金
国家级大学生创新项目(202110666008)
贵州省科技厅基础研究项目(黔科合基础[2018]1166)
+1 种基金
黔西南州科技计划项目(2022-1-17)
兴义民族师范学院州管专家项目(21XYZJ 02)。
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文摘
本文指出DREB转录因子广泛参与生物胁迫与非生物胁迫的应答反应,对提高植株在逆境中耐受性具有重要作用。本研究以甘蔗杂交品种为材料,利用同源基因克隆技术获得一个DREB2类转录因子基因ScDREB2。序列分析表明,ScDREB2基因长度为1537 bp,含有2个外显子和1个内含子,其中包括789 bp的开放阅读框(ORF),整个ORF编码262个氨基酸。生物信息学表明,获得的DREB2类转录因子等电点为9.25,相对分子质量为26861.97,分子式为C1238H1958N360O406S10。在二级结构预测中,α螺旋占比最高为42.75%,其次为无规则卷曲、延伸链、β折叠。基因的获得为下一步了解DREB2基因表达与甘蔗抵御非生物胁迫能力之间的关系奠定了基础。
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关键词
甘蔗
转录因子
DREB2基因
基因克隆
生物信息学
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Keywords
sugarcane
transcription factor
DREB2 gene
gene cloning
bioinformatics
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分类号
S566.1
[农业科学—作物学]
Q753
[生物学—分子生物学]
Q343.1
[生物学—遗传学]
Q811.4
[生物学—生物工程]
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