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利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定还原糖浓度
被引量:
4
1
作者
陈慧
郝锦亨
+8 位作者
袁志涛
罗佳伟
陈胤熹
郑少鹏
黎佩瑜
吕咏锶
梁世濠
赖林浩
曹诗林
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2021年第7期315-320,共6页
本文探讨了运用python处理食品生物化学实验中还原糖浓度测定的新方法。分别将稀释成不同浓度的还原糖检测样品放在96孔酶标板上,利用扫描仪对其扫描,得到tiff格式的颜色位图,以利用本课题组自行开发的在线分析平台上的RGB分析模块读取...
本文探讨了运用python处理食品生物化学实验中还原糖浓度测定的新方法。分别将稀释成不同浓度的还原糖检测样品放在96孔酶标板上,利用扫描仪对其扫描,得到tiff格式的颜色位图,以利用本课题组自行开发的在线分析平台上的RGB分析模块读取样品溶液的RGB颜色数据。通过考察样品取样量、最适图片分辨率等条件,建立一种基于RGB色彩体系的食品中还原糖快速检测方法。检测葡萄糖的结果,在葡萄糖浓度相同,样品取样量为100μL,图片分辨率为1200 dpi的条件下,拟合系数大于0.98;RGB颜色数据与葡萄糖浓度之间的关系准确度更高,该结果与分光光度法结果相近,但本方法更方便、快速、可多通道处理。与此同时,通过测定实际样品中还原糖的含量,并与分光光度法测定结果比对,验证了利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定食品中还原糖浓度的可靠性和可行性。
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关键词
RGB
还原糖
扫描仪
成像
脚本
下载PDF
职称材料
利用同源建模、分子模拟和分子对接技术分析家蚕中碳酸酐酶的结构和催化机制
被引量:
1
2
作者
陈胤熹
黎菁菁
+11 位作者
罗佳伟
郑少鹏
余洁婷
黄嘉惠
李鑫尧
余铭怡
郝锦亨
黎佩瑜
古伟明
吴易达
曹诗林
赖林浩
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2022年第1期159-164,共6页
该研究以来源于家蚕的碳酸酐酶为研究对象,利用同源建模建立了家蚕碳酸酐酶的三维结构并预测了其潜在的活性区域。随后,利用Autodock-Vina对家蚕碳酸酐酶和底物进行分子对接,分析和评价了对接模型以及与乙酸对硝基苯酯底物对接过程中的...
该研究以来源于家蚕的碳酸酐酶为研究对象,利用同源建模建立了家蚕碳酸酐酶的三维结构并预测了其潜在的活性区域。随后,利用Autodock-Vina对家蚕碳酸酐酶和底物进行分子对接,分析和评价了对接模型以及与乙酸对硝基苯酯底物对接过程中的相互作用。经分子动力学模拟和MM/PBSA,分析催化过程中家蚕碳酸酐酶的均方根偏差、溶剂可及面积以及径向分布函数。结果表明:建模所得的酶结构可靠性良好(完全允许区域为89.3%,允许区域10.3%,总和超过了99%);家蚕碳酸酐酶与底物的对接结合能为-6.1 Kcal/mol;范德华力在家蚕碳酸酐酶和底物的结合中占主导地位,而极性溶剂化对结合有显著的反作用;家蚕碳酸酐酶与底物的相互作用的区域为:138L~150V和209L~217C;同源建模所得的家蚕碳酸酐酶结构稳定(模拟最后50 ns RMSD值约0.35 nm)。该研究对后续进一步理性设计和改造家蚕碳酸酐酶提供了一定的理论支持。
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关键词
碳酸酐酶
同源建模
活性区域
分子动力学模拟
下载PDF
职称材料
题名
利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定还原糖浓度
被引量:
4
1
作者
陈慧
郝锦亨
袁志涛
罗佳伟
陈胤熹
郑少鹏
黎佩瑜
吕咏锶
梁世濠
赖林浩
曹诗林
机构
佛山科学技术学院食品科学与工程学院
可持续生物化学与合成生物工程中心
华南理工大学食品科学与工程学院
出处
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2021年第7期315-320,共6页
基金
广东省基础与应用基础研究基金佛山市联合基金(粤佛联合基金)青年基金项目(2019A1515110621)
广东普通高校青年创新人才项目(自然科学类
+4 种基金
2017KQNCX217)
佛山科学技术学院高层次人才启动项目(GG07016)
大学生创新创业训练计划项目(201911847023,S201911847097,S201911847091,XJ2019213,S202011847068,S202011847086,XJ2020219,XJ2020220)
广东省科技创新战略专项资金项目(pdjh2020b0627)
广州无远生物科技有限公司-企业科研基金(012319705010)。
文摘
本文探讨了运用python处理食品生物化学实验中还原糖浓度测定的新方法。分别将稀释成不同浓度的还原糖检测样品放在96孔酶标板上,利用扫描仪对其扫描,得到tiff格式的颜色位图,以利用本课题组自行开发的在线分析平台上的RGB分析模块读取样品溶液的RGB颜色数据。通过考察样品取样量、最适图片分辨率等条件,建立一种基于RGB色彩体系的食品中还原糖快速检测方法。检测葡萄糖的结果,在葡萄糖浓度相同,样品取样量为100μL,图片分辨率为1200 dpi的条件下,拟合系数大于0.98;RGB颜色数据与葡萄糖浓度之间的关系准确度更高,该结果与分光光度法结果相近,但本方法更方便、快速、可多通道处理。与此同时,通过测定实际样品中还原糖的含量,并与分光光度法测定结果比对,验证了利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定食品中还原糖浓度的可靠性和可行性。
关键词
RGB
还原糖
扫描仪
成像
脚本
Keywords
RGB
reducing sugar
scanner
imaging
script
分类号
TS207.3 [轻工技术与工程—食品科学]
下载PDF
职称材料
题名
利用同源建模、分子模拟和分子对接技术分析家蚕中碳酸酐酶的结构和催化机制
被引量:
1
2
作者
陈胤熹
黎菁菁
罗佳伟
郑少鹏
余洁婷
黄嘉惠
李鑫尧
余铭怡
郝锦亨
黎佩瑜
古伟明
吴易达
曹诗林
赖林浩
机构
佛山科学技术学院食品科学与工程学院
华南农业大学食品学院
广东工业大学轻工化工学院
暨南大学理工学院
华南理工大学食品科学与工程学院
出处
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2022年第1期159-164,共6页
基金
广东省基础与应用基础研究基金佛山市联合基金(粤佛联合基金)青年基金项目(2019A1515110621)
广东普通高校青年创新人才项目(自然科学类)(2017KQNCX217)
+2 种基金
佛山科学技术学院高层次人才启动项目(GG07016)
大学生创新创业训练计划项目(201911847023,S201911847097,S201911847091,XJ2019213,S202011847068,S202011847086,XJ2020219,XJ2020220)
广东省科技创新战略专项资金(大学生科技创新培育)项目(pdjh2020b0627)。
文摘
该研究以来源于家蚕的碳酸酐酶为研究对象,利用同源建模建立了家蚕碳酸酐酶的三维结构并预测了其潜在的活性区域。随后,利用Autodock-Vina对家蚕碳酸酐酶和底物进行分子对接,分析和评价了对接模型以及与乙酸对硝基苯酯底物对接过程中的相互作用。经分子动力学模拟和MM/PBSA,分析催化过程中家蚕碳酸酐酶的均方根偏差、溶剂可及面积以及径向分布函数。结果表明:建模所得的酶结构可靠性良好(完全允许区域为89.3%,允许区域10.3%,总和超过了99%);家蚕碳酸酐酶与底物的对接结合能为-6.1 Kcal/mol;范德华力在家蚕碳酸酐酶和底物的结合中占主导地位,而极性溶剂化对结合有显著的反作用;家蚕碳酸酐酶与底物的相互作用的区域为:138L~150V和209L~217C;同源建模所得的家蚕碳酸酐酶结构稳定(模拟最后50 ns RMSD值约0.35 nm)。该研究对后续进一步理性设计和改造家蚕碳酸酐酶提供了一定的理论支持。
关键词
碳酸酐酶
同源建模
活性区域
分子动力学模拟
Keywords
carbonic anhydrase
homologous modeling
active site
molecular dynamics simulation
分类号
TS207.3 [轻工技术与工程—食品科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定还原糖浓度
陈慧
郝锦亨
袁志涛
罗佳伟
陈胤熹
郑少鹏
黎佩瑜
吕咏锶
梁世濠
赖林浩
曹诗林
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2021
4
下载PDF
职称材料
2
利用同源建模、分子模拟和分子对接技术分析家蚕中碳酸酐酶的结构和催化机制
陈胤熹
黎菁菁
罗佳伟
郑少鹏
余洁婷
黄嘉惠
李鑫尧
余铭怡
郝锦亨
黎佩瑜
古伟明
吴易达
曹诗林
赖林浩
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2022
1
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职称材料
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